MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal03

Total Repeats: 238

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009037	TAA	2	6	83	88	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009037	AAG	2	6	160	165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
3	NC_009037	AAG	2	6	244	249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
4	NC_009037	GCC	2	6	289	294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126090320
5	NC_009037	GTG	2	6	401	406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090320
6	NC_009037	AGC	2	6	462	467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090320
7	NC_009037	AAG	2	6	497	502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
8	NC_009037	TGA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
9	NC_009037	TTC	2	6	604	609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090320
10	NC_009037	TCA	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090320
11	NC_009037	TAT	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090320
12	NC_009037	CGC	2	6	739	744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126090320
13	NC_009037	CAT	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090320
14	NC_009037	GTC	2	6	938	943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
15	NC_009037	TGC	2	6	1029	1034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
16	NC_009037	AGA	2	6	1098	1103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
17	NC_009037	ATG	2	6	1246	1251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
18	NC_009037	CCA	2	6	1264	1269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126090320
19	NC_009037	TGC	2	6	1278	1283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
20	NC_009037	TTC	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090320
21	NC_009037	CGT	2	6	1360	1365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
22	NC_009037	TGA	2	6	1377	1382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
23	NC_009037	AGA	2	6	1407	1412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
24	NC_009037	TCG	2	6	1415	1420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
25	NC_009037	GAA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
26	NC_009037	CAT	2	6	1434	1439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090320
27	NC_009037	CGA	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090320
28	NC_009037	GAT	2	6	1468	1473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
29	NC_009037	CCG	2	6	1491	1496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126090320
30	NC_009037	TTC	2	6	1654	1659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090320
31	NC_009037	TTC	2	6	1662	1667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090320
32	NC_009037	AAC	2	6	1693	1698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090320
33	NC_009037	CGT	2	6	1723	1728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
34	NC_009037	GGT	2	6	1747	1752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090320
35	NC_009037	GAA	2	6	1969	1974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
36	NC_009037	AGA	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
37	NC_009037	GTC	2	6	2048	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
38	NC_009037	ATT	2	6	2119	2124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090320
39	NC_009037	TGC	2	6	2130	2135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
40	NC_009037	GAT	2	6	2161	2166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
41	NC_009037	TAG	2	6	2237	2242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
42	NC_009037	GTT	2	6	2287	2292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090320
43	NC_009037	GTG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090320
44	NC_009037	GTT	2	6	2338	2343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090320
45	NC_009037	TTG	2	6	2448	2453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090320
46	NC_009037	AAG	2	6	2612	2617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
47	NC_009037	ACT	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090320
48	NC_009037	GAA	2	6	2683	2688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
49	NC_009037	CGA	2	6	2736	2741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090320
50	NC_009037	GCG	2	6	2777	2782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126090320
51	NC_009037	AGA	2	6	2832	2837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
52	NC_009037	ATC	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090320
53	NC_009037	GAA	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
54	NC_009037	TGC	2	6	3108	3113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
55	NC_009037	AAG	2	6	3220	3225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
56	NC_009037	CGT	2	6	3238	3243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
57	NC_009037	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
58	NC_009037	GTC	2	6	3344	3349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
59	NC_009037	GCT	2	6	3496	3501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
60	NC_009037	GAA	2	6	3538	3543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
61	NC_009037	TGA	3	9	3636	3644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
62	NC_009037	GTT	2	6	3774	3779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090320
63	NC_009037	TGA	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
64	NC_009037	CAA	2	6	3907	3912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090320
65	NC_009037	GGT	2	6	3937	3942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090320
66	NC_009037	TCG	2	6	4064	4069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
67	NC_009037	TTA	2	6	4264	4269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090321
68	NC_009037	GAA	2	6	4297	4302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
69	NC_009037	AAG	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
70	NC_009037	GTG	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090321
71	NC_009037	CGT	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
72	NC_009037	AGA	2	6	4737	4742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
73	NC_009037	AGA	2	6	4761	4766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
74	NC_009037	TGA	2	6	4773	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090321
75	NC_009037	GAA	2	6	4861	4866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
76	NC_009037	TCG	2	6	4890	4895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
77	NC_009037	CAA	2	6	4947	4952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090321
78	NC_009037	GAT	2	6	4962	4967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090321
79	NC_009037	ACC	2	6	4989	4994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126090321
80	NC_009037	GGC	2	6	5023	5028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126090321
81	NC_009037	CGC	2	6	5062	5067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126090321
82	NC_009037	AAC	2	6	5080	5085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090321
83	NC_009037	GTC	2	6	5183	5188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
84	NC_009037	AAG	2	6	5362	5367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
85	NC_009037	CTA	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090321
86	NC_009037	AGC	2	6	5439	5444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090321
87	NC_009037	AAG	2	6	5446	5451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
88	NC_009037	TGA	2	6	5702	5707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090321
89	NC_009037	CAA	2	6	5715	5720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090321
90	NC_009037	TAC	2	6	5785	5790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090321
91	NC_009037	GTG	2	6	5816	5821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090321
92	NC_009037	GCT	2	6	5875	5880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
93	NC_009037	ATT	2	6	5920	5925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090321
94	NC_009037	AAC	2	6	5948	5953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090321
95	NC_009037	TTG	2	6	5960	5965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090321
96	NC_009037	CTG	2	6	5986	5991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
97	NC_009037	CAG	2	6	6005	6010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090321
98	NC_009037	ACA	2	6	6290	6295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090321
99	NC_009037	ATG	2	6	6343	6348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090321
100	NC_009037	ATG	2	6	6424	6429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090321
101	NC_009037	ATC	2	6	6514	6519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090321
102	NC_009037	TCG	2	6	6645	6650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
103	NC_009037	GGT	2	6	6736	6741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090321
104	NC_009037	CAC	2	6	6827	6832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126090321
105	NC_009037	CGA	2	6	6846	6851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090321
106	NC_009037	AGA	2	6	6870	6875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
107	NC_009037	CGA	2	6	6885	6890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090321
108	NC_009037	GCA	2	6	7009	7014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090321
109	NC_009037	GGT	2	6	7066	7071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090321
110	NC_009037	TTC	2	6	7188	7193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090321
111	NC_009037	AGA	2	6	7272	7277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
112	NC_009037	AGC	2	6	7278	7283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090321
113	NC_009037	GTA	2	6	7352	7357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090321
114	NC_009037	TCA	2	6	7423	7428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090321
115	NC_009037	TGA	2	6	7517	7522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090321
116	NC_009037	CTT	2	6	7551	7556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090321
117	NC_009037	GGT	2	6	7660	7665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090321
118	NC_009037	CGT	2	6	7771	7776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
119	NC_009037	CTG	2	6	7790	7795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
120	NC_009037	GGC	2	6	7798	7803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126090321
121	NC_009037	GAT	2	6	7818	7823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090321
122	NC_009037	GTG	2	6	7871	7876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090321
123	NC_009037	ATC	2	6	8020	8025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090321
124	NC_009037	TGC	2	6	8033	8038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
125	NC_009037	ACT	2	6	8169	8174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090321
126	NC_009037	CAG	2	6	8216	8221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090321
127	NC_009037	GGT	2	6	8266	8271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090321
128	NC_009037	GAA	2	6	8376	8381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
129	NC_009037	GTA	2	6	8392	8397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090321
130	NC_009037	CCA	2	6	8583	8588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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132	NC_009037	CGG	2	6	8852	8857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126090322
133	NC_009037	GTG	2	6	8899	8904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090322
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238	NC_009037	TAT	2	6	16660	16665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.