MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal02

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009036	CGGCG	2	10	430	439	0 %	0 %	60 %	40 %	126090237
2	NC_009036	AAATC	2	10	4596	4605	60 %	20 %	0 %	20 %	126090240
3	NC_009036	TCTGC	2	10	6309	6318	0 %	40 %	20 %	40 %	126090241
4	NC_009036	CCAAG	2	10	6884	6893	40 %	0 %	20 %	40 %	126090242
5	NC_009036	GGTTG	2	10	10547	10556	0 %	40 %	60 %	0 %	126090247
6	NC_009036	CATTC	2	10	20025	20034	20 %	40 %	0 %	40 %	126090253
7	NC_009036	TTCCA	2	10	26123	26132	20 %	40 %	0 %	40 %	126090261
8	NC_009036	GGTTA	2	10	27950	27959	20 %	40 %	40 %	0 %	126090262
9	NC_009036	TGCAA	2	10	28847	28856	40 %	20 %	20 %	20 %	126090263
10	NC_009036	CTAAA	2	10	31082	31091	60 %	20 %	0 %	20 %	126090264
11	NC_009036	ACTGG	2	10	37557	37566	20 %	20 %	40 %	20 %	126090269
12	NC_009036	GGTCA	2	10	37880	37889	20 %	20 %	40 %	20 %	126090269
13	NC_009036	ACTCA	2	10	37986	37995	40 %	20 %	0 %	40 %	126090269
14	NC_009036	GGCTG	2	10	38428	38437	0 %	20 %	60 %	20 %	126090269
15	NC_009036	CTGGG	2	10	38663	38672	0 %	20 %	60 %	20 %	126090269
16	NC_009036	AGTTC	2	10	39425	39434	20 %	40 %	20 %	20 %	126090270
17	NC_009036	CTTCA	2	10	39454	39463	20 %	40 %	0 %	40 %	126090270
18	NC_009036	TTGCC	2	10	41913	41922	0 %	40 %	20 %	40 %	126090274
19	NC_009036	TTCAT	2	10	42511	42520	20 %	60 %	0 %	20 %	126090274
20	NC_009036	CTTGG	2	10	43960	43969	0 %	40 %	40 %	20 %	126090275
21	NC_009036	GATGG	2	10	45346	45355	20 %	20 %	60 %	0 %	126090278
22	NC_009036	ATTTC	2	10	46228	46237	20 %	60 %	0 %	20 %	126090279
23	NC_009036	AGTCC	2	10	46611	46620	20 %	20 %	20 %	40 %	126090280
24	NC_009036	AGAGA	2	10	48321	48330	60 %	0 %	40 %	0 %	126090281
25	NC_009036	TAGAT	2	10	53081	53090	40 %	40 %	20 %	0 %	126090287
26	NC_009036	ATTTA	2	10	54271	54280	40 %	60 %	0 %	0 %	126090287
27	NC_009036	TTGCA	2	10	56349	56358	20 %	40 %	20 %	20 %	126090289
28	NC_009036	TAACC	2	10	57246	57255	40 %	20 %	0 %	40 %	126090290
29	NC_009036	AAATC	2	10	58280	58289	60 %	20 %	0 %	20 %	126090291
30	NC_009036	GTCAC	2	10	63551	63560	20 %	20 %	20 %	40 %	126090297
31	NC_009036	ATAAA	2	10	65589	65598	80 %	20 %	0 %	0 %	126090299
32	NC_009036	CAAAA	2	10	66252	66261	80 %	0 %	0 %	20 %	126090300
33	NC_009036	GTCAC	2	10	72215	72224	20 %	20 %	20 %	40 %	126090305
34	NC_009036	TGAAA	2	10	73261	73270	60 %	20 %	20 %	0 %	126090307

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.