MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal02

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009036	GCAA	2	8	1077	1084	50 %	0 %	25 %	25 %	126090237
2	NC_009036	ATGA	2	8	1594	1601	50 %	25 %	25 %	0 %	126090237
3	NC_009036	AATG	2	8	2334	2341	50 %	25 %	25 %	0 %	126090237
4	NC_009036	AGTT	2	8	2342	2349	25 %	50 %	25 %	0 %	126090237
5	NC_009036	CTAA	2	8	3387	3394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009036	TTTC	2	8	3524	3531	0 %	75 %	0 %	25 %	126090238
7	NC_009036	ATTG	2	8	3643	3650	25 %	50 %	25 %	0 %	126090238
8	NC_009036	ATTC	2	8	4813	4820	25 %	50 %	0 %	25 %	126090240
9	NC_009036	ATCC	2	8	5216	5223	25 %	25 %	0 %	50 %	126090240
10	NC_009036	GTCT	2	8	5443	5450	0 %	50 %	25 %	25 %	126090240
11	NC_009036	GCTT	2	8	5490	5497	0 %	50 %	25 %	25 %	126090240
12	NC_009036	CTGT	2	8	5563	5570	0 %	50 %	25 %	25 %	126090240
13	NC_009036	ATAA	2	8	5829	5836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009036	TCTT	2	8	6550	6557	0 %	75 %	0 %	25 %	126090241
15	NC_009036	GCTT	2	8	6581	6588	0 %	50 %	25 %	25 %	126090241
16	NC_009036	TCAT	2	8	7198	7205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009036	GCTT	2	8	7236	7243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009036	TCAA	2	8	8399	8406	50 %	25 %	0 %	25 %	126090245
19	NC_009036	ATTT	2	8	8655	8662	25 %	75 %	0 %	0 %	126090245
20	NC_009036	AAGC	2	8	9130	9137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009036	GCAT	2	8	9157	9164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009036	ATTC	2	8	9362	9369	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009036	GGAA	2	8	9394	9401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009036	TTCC	2	8	9740	9747	0 %	50 %	0 %	50 %	126090246
25	NC_009036	CCAA	2	8	10286	10293	50 %	0 %	0 %	50 %	126090247
26	NC_009036	TACT	2	8	10491	10498	25 %	50 %	0 %	25 %	126090247
27	NC_009036	TTAT	2	8	10668	10675	25 %	75 %	0 %	0 %	126090247
28	NC_009036	TTAT	2	8	11102	11109	25 %	75 %	0 %	0 %	126090247
29	NC_009036	AAAG	2	8	11144	11151	75 %	0 %	25 %	0 %	126090247
30	NC_009036	ACTT	2	8	11368	11375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009036	GCTT	2	8	11521	11528	0 %	50 %	25 %	25 %	126090248
32	NC_009036	CCCA	2	8	11705	11712	25 %	0 %	0 %	75 %	126090248
33	NC_009036	GCTT	2	8	11770	11777	0 %	50 %	25 %	25 %	126090248
34	NC_009036	CCAA	2	8	11892	11899	50 %	0 %	0 %	50 %	126090248
35	NC_009036	GGCC	2	8	12212	12219	0 %	0 %	50 %	50 %	126090249
36	NC_009036	AGTT	2	8	12295	12302	25 %	50 %	25 %	0 %	126090249
37	NC_009036	AACT	2	8	13238	13245	50 %	25 %	0 %	25 %	126090249
38	NC_009036	AACT	2	8	14282	14289	50 %	25 %	0 %	25 %	126090249
39	NC_009036	GCTT	2	8	15858	15865	0 %	50 %	25 %	25 %	126090249
40	NC_009036	TGCC	2	8	15868	15875	0 %	25 %	25 %	50 %	126090249
41	NC_009036	ACTC	2	8	15890	15897	25 %	25 %	0 %	50 %	126090249
42	NC_009036	AGCA	2	8	16276	16283	50 %	0 %	25 %	25 %	126090250
43	NC_009036	GTTG	2	8	16478	16485	0 %	50 %	50 %	0 %	126090250
44	NC_009036	TCAA	2	8	16769	16776	50 %	25 %	0 %	25 %	126090250
45	NC_009036	ATTG	2	8	17469	17476	25 %	50 %	25 %	0 %	126090251
46	NC_009036	GTCA	2	8	17485	17492	25 %	25 %	25 %	25 %	126090251
47	NC_009036	GCTG	2	8	17724	17731	0 %	25 %	50 %	25 %	126090251
48	NC_009036	GGAC	2	8	17993	18000	25 %	0 %	50 %	25 %	126090251
49	NC_009036	GGTA	2	8	18617	18624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009036	GTTC	2	8	18879	18886	0 %	50 %	25 %	25 %	126090252
51	NC_009036	GGCA	2	8	19115	19122	25 %	0 %	50 %	25 %	126090252
52	NC_009036	TCAA	2	8	21403	21410	50 %	25 %	0 %	25 %	126090256
53	NC_009036	ATTT	2	8	21659	21666	25 %	75 %	0 %	0 %	126090256
54	NC_009036	ATTG	2	8	23101	23108	25 %	50 %	25 %	0 %	126090258
55	NC_009036	AATA	2	8	23277	23284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009036	AAAG	2	8	23545	23552	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009036	CAAC	2	8	23624	23631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009036	GCTT	2	8	23875	23882	0 %	50 %	25 %	25 %	126090259
59	NC_009036	GCTT	2	8	24022	24029	0 %	50 %	25 %	25 %	126090259
60	NC_009036	GAGC	2	8	24092	24099	25 %	0 %	50 %	25 %	126090259
61	NC_009036	CCAA	2	8	24782	24789	50 %	0 %	0 %	50 %	126090260
62	NC_009036	ACAA	2	8	24801	24808	75 %	0 %	0 %	25 %	126090260
63	NC_009036	TCAA	2	8	24930	24937	50 %	25 %	0 %	25 %	126090260
64	NC_009036	AGGG	2	8	25679	25686	25 %	0 %	75 %	0 %	126090261
65	NC_009036	AATT	2	8	27794	27801	50 %	50 %	0 %	0 %	126090262
66	NC_009036	TGAA	2	8	28147	28154	50 %	25 %	25 %	0 %	126090262
67	NC_009036	AAAC	2	8	28887	28894	75 %	0 %	0 %	25 %	126090263
68	NC_009036	ATTG	2	8	29328	29335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009036	AATT	2	8	29830	29837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009036	TTAA	3	12	29884	29895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009036	TATT	2	8	30010	30017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009036	ATCA	2	8	30635	30642	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009036	GGTA	2	8	30801	30808	25 %	25 %	50 %	0 %	126090264
74	NC_009036	CAAT	2	8	31582	31589	50 %	25 %	0 %	25 %	126090265
75	NC_009036	TTAT	2	8	31596	31603	25 %	75 %	0 %	0 %	126090265
76	NC_009036	AAAG	2	8	32628	32635	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009036	GATT	2	8	32777	32784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009036	GCTT	2	8	33002	33009	0 %	50 %	25 %	25 %	126090266
79	NC_009036	GAGC	2	8	33219	33226	25 %	0 %	50 %	25 %	126090266
80	NC_009036	TTTG	2	8	33733	33740	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009036	TCTT	2	8	34115	34122	0 %	75 %	0 %	25 %	126090267
82	NC_009036	TTTG	2	8	34349	34356	0 %	75 %	25 %	0 %	126090267
83	NC_009036	TTAC	2	8	34619	34626	25 %	50 %	0 %	25 %	126090267
84	NC_009036	CTAA	2	8	34761	34768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009036	TATC	2	8	34891	34898	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009036	TTCG	2	8	35151	35158	0 %	50 %	25 %	25 %	126090268
87	NC_009036	ATAA	2	8	35915	35922	75 %	25 %	0 %	0 %	126090269
88	NC_009036	TGAT	2	8	36675	36682	25 %	50 %	25 %	0 %	126090269
89	NC_009036	AACG	2	8	36723	36730	50 %	0 %	25 %	25 %	126090269
90	NC_009036	TGAA	2	8	37182	37189	50 %	25 %	25 %	0 %	126090269
91	NC_009036	CAAG	2	8	39302	39309	50 %	0 %	25 %	25 %	126090270
92	NC_009036	CTTG	2	8	39471	39478	0 %	50 %	25 %	25 %	126090270
93	NC_009036	GTTA	2	8	40092	40099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009036	TTCA	2	8	40436	40443	25 %	50 %	0 %	25 %	126090271
95	NC_009036	TGAT	2	8	40455	40462	25 %	50 %	25 %	0 %	126090271
96	NC_009036	TGAA	2	8	40488	40495	50 %	25 %	25 %	0 %	126090271
97	NC_009036	CAAA	2	8	40916	40923	75 %	0 %	0 %	25 %	126090273
98	NC_009036	AAGT	2	8	41082	41089	50 %	25 %	25 %	0 %	126090273
99	NC_009036	TGAT	2	8	41613	41620	25 %	50 %	25 %	0 %	126090274
100	NC_009036	ATCA	2	8	42204	42211	50 %	25 %	0 %	25 %	126090274
101	NC_009036	TTCC	2	8	42215	42222	0 %	50 %	0 %	50 %	126090274
102	NC_009036	GGTG	2	8	42832	42839	0 %	25 %	75 %	0 %	126090274
103	NC_009036	ATTC	2	8	43161	43168	25 %	50 %	0 %	25 %	126090274
104	NC_009036	GACT	2	8	43439	43446	25 %	25 %	25 %	25 %	126090274
105	NC_009036	CGTT	2	8	43943	43950	0 %	50 %	25 %	25 %	126090275
106	NC_009036	ATCA	2	8	44273	44280	50 %	25 %	0 %	25 %	126090276
107	NC_009036	ATGG	2	8	44460	44467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009036	GTAA	2	8	44500	44507	50 %	25 %	25 %	0 %	126090277
109	NC_009036	TCTG	2	8	45367	45374	0 %	50 %	25 %	25 %	126090278
110	NC_009036	TTTC	2	8	45565	45572	0 %	75 %	0 %	25 %	126090278
111	NC_009036	TTAT	2	8	45587	45594	25 %	75 %	0 %	0 %	126090278
112	NC_009036	TAAA	2	8	45961	45968	75 %	25 %	0 %	0 %	126090279
113	NC_009036	TAAA	2	8	46278	46285	75 %	25 %	0 %	0 %	126090279
114	NC_009036	CAAT	2	8	46537	46544	50 %	25 %	0 %	25 %	126090280
115	NC_009036	GATA	2	8	47001	47008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009036	CAAA	2	8	47245	47252	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009036	CAAG	2	8	47571	47578	50 %	0 %	25 %	25 %	126090281
118	NC_009036	ATTA	2	8	47831	47838	50 %	50 %	0 %	0 %	126090281
119	NC_009036	ATGA	2	8	47847	47854	50 %	25 %	25 %	0 %	126090281
120	NC_009036	CCAA	2	8	48089	48096	50 %	0 %	0 %	50 %	126090281
121	NC_009036	TCGT	2	8	48120	48127	0 %	50 %	25 %	25 %	126090281
122	NC_009036	TTAA	2	8	48261	48268	50 %	50 %	0 %	0 %	126090281
123	NC_009036	CTAA	2	8	48401	48408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009036	TTAA	2	8	48507	48514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009036	AATA	2	8	49552	49559	75 %	25 %	0 %	0 %	126090283
126	NC_009036	TAAG	2	8	49830	49837	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009036	GATT	2	8	49859	49866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009036	CCAT	2	8	50199	50206	25 %	25 %	0 %	50 %	126090284
129	NC_009036	TTAA	2	8	50668	50675	50 %	50 %	0 %	0 %	126090285
130	NC_009036	ATGA	2	8	50695	50702	50 %	25 %	25 %	0 %	126090285
131	NC_009036	ATCC	2	8	50809	50816	25 %	25 %	0 %	50 %	126090285
132	NC_009036	GGGT	2	8	51139	51146	0 %	25 %	75 %	0 %	126090286
133	NC_009036	GGTC	2	8	51623	51630	0 %	25 %	50 %	25 %	126090286
134	NC_009036	CAGA	2	8	51665	51672	50 %	0 %	25 %	25 %	126090286
135	NC_009036	TAAT	2	8	52604	52611	50 %	50 %	0 %	0 %	126090287
136	NC_009036	TTTA	2	8	52738	52745	25 %	75 %	0 %	0 %	126090287
137	NC_009036	TTTC	2	8	52862	52869	0 %	75 %	0 %	25 %	126090287
138	NC_009036	CTTT	2	8	52916	52923	0 %	75 %	0 %	25 %	126090287
139	NC_009036	TGAA	2	8	53268	53275	50 %	25 %	25 %	0 %	126090287
140	NC_009036	GTAA	2	8	53721	53728	50 %	25 %	25 %	0 %	126090287
141	NC_009036	TTAT	2	8	54854	54861	25 %	75 %	0 %	0 %	126090287
142	NC_009036	CTTG	2	8	54920	54927	0 %	50 %	25 %	25 %	126090287
143	NC_009036	CCTT	2	8	55456	55463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009036	GTTA	2	8	55469	55476	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.