MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal02

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009036	CTAA	2	8	3387	3394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009036	ATAA	2	8	5829	5836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009036	TCAT	2	8	7198	7205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009036	GCTT	2	8	7236	7243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009036	AAGC	2	8	9130	9137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009036	GCAT	2	8	9157	9164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009036	ATTC	2	8	9362	9369	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009036	GGAA	2	8	9394	9401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009036	ACTT	2	8	11368	11375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009036	GGTA	2	8	18617	18624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009036	AATA	2	8	23277	23284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009036	AAAG	2	8	23545	23552	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009036	CAAC	2	8	23624	23631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009036	ATTG	2	8	29328	29335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009036	AATT	2	8	29830	29837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009036	TTAA	3	12	29884	29895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009036	TATT	2	8	30010	30017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009036	ATCA	2	8	30635	30642	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009036	AAAG	2	8	32628	32635	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009036	GATT	2	8	32777	32784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009036	TTTG	2	8	33733	33740	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009036	CTAA	2	8	34761	34768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009036	TATC	2	8	34891	34898	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009036	GTTA	2	8	40092	40099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009036	ATGG	2	8	44460	44467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009036	GATA	2	8	47001	47008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009036	CAAA	2	8	47245	47252	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009036	CTAA	2	8	48401	48408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009036	TTAA	2	8	48507	48514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009036	TAAG	2	8	49830	49837	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009036	GATT	2	8	49859	49866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009036	CCTT	2	8	55456	55463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009036	GTTA	2	8	55469	55476	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009036	CTTT	2	8	61742	61749	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009036	TTTA	2	8	61914	61921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009036	AAGG	2	8	62682	62689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009036	TCGT	2	8	62710	62717	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009036	ATTA	2	8	64573	64580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009036	CTTT	2	8	64728	64735	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009036	ACAT	2	8	65102	65109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009036	ATGG	2	8	65248	65255	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009036	CAAC	2	8	65273	65280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009036	AAAC	2	8	65287	65294	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009036	TTTA	2	8	65858	65865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009036	TATT	2	8	67544	67551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.