MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal02

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009036	TC	3	6	1033	1038	0 %	50 %	0 %	50 %	126090237
2	NC_009036	AT	3	6	1097	1102	50 %	50 %	0 %	0 %	126090237
3	NC_009036	AC	3	6	2037	2042	50 %	0 %	0 %	50 %	126090237
4	NC_009036	CA	3	6	2234	2239	50 %	0 %	0 %	50 %	126090237
5	NC_009036	TC	3	6	2800	2805	0 %	50 %	0 %	50 %	126090237
6	NC_009036	GC	3	6	3445	3450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009036	AC	3	6	4096	4101	50 %	0 %	0 %	50 %	126090239
8	NC_009036	TA	3	6	4495	4500	50 %	50 %	0 %	0 %	126090240
9	NC_009036	GT	3	6	7380	7385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009036	TG	3	6	7579	7584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009036	CA	3	6	8522	8527	50 %	0 %	0 %	50 %	126090245
12	NC_009036	AT	3	6	10131	10136	50 %	50 %	0 %	0 %	126090247
13	NC_009036	AC	3	6	10295	10300	50 %	0 %	0 %	50 %	126090247
14	NC_009036	AC	4	8	10625	10632	50 %	0 %	0 %	50 %	126090247
15	NC_009036	AT	3	6	10655	10660	50 %	50 %	0 %	0 %	126090247
16	NC_009036	AT	3	6	11070	11075	50 %	50 %	0 %	0 %	126090247
17	NC_009036	CG	4	8	11323	11330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009036	CT	3	6	11811	11816	0 %	50 %	0 %	50 %	126090248
19	NC_009036	CG	4	8	12223	12230	0 %	0 %	50 %	50 %	126090249
20	NC_009036	CG	3	6	12667	12672	0 %	0 %	50 %	50 %	126090249
21	NC_009036	CG	3	6	13453	13458	0 %	0 %	50 %	50 %	126090249
22	NC_009036	CG	3	6	13714	13719	0 %	0 %	50 %	50 %	126090249
23	NC_009036	CG	3	6	14758	14763	0 %	0 %	50 %	50 %	126090249
24	NC_009036	CG	3	6	15019	15024	0 %	0 %	50 %	50 %	126090249
25	NC_009036	AC	3	6	15223	15228	50 %	0 %	0 %	50 %	126090249
26	NC_009036	AC	3	6	15481	15486	50 %	0 %	0 %	50 %	126090249
27	NC_009036	CG	3	6	15535	15540	0 %	0 %	50 %	50 %	126090249
28	NC_009036	AT	3	6	17004	17009	50 %	50 %	0 %	0 %	126090250
29	NC_009036	CG	3	6	17073	17078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009036	TA	3	6	17225	17230	50 %	50 %	0 %	0 %	126090251
31	NC_009036	GT	3	6	18248	18253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009036	CT	3	6	18686	18691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009036	TA	3	6	18735	18740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009036	CG	3	6	19162	19167	0 %	0 %	50 %	50 %	126090252
35	NC_009036	AT	3	6	19330	19335	50 %	50 %	0 %	0 %	126090252
36	NC_009036	TA	3	6	19601	19606	50 %	50 %	0 %	0 %	126090253
37	NC_009036	TC	3	6	20317	20322	0 %	50 %	0 %	50 %	126090254
38	NC_009036	TG	3	6	20583	20588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009036	CA	3	6	21526	21531	50 %	0 %	0 %	50 %	126090256
40	NC_009036	TA	3	6	22473	22478	50 %	50 %	0 %	0 %	126090258
41	NC_009036	CT	3	6	22936	22941	0 %	50 %	0 %	50 %	126090258
42	NC_009036	TA	3	6	23191	23196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009036	AC	3	6	24014	24019	50 %	0 %	0 %	50 %	126090259
44	NC_009036	CA	4	8	25401	25408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009036	AG	3	6	25661	25666	50 %	0 %	50 %	0 %	126090261
46	NC_009036	AT	3	6	26305	26310	50 %	50 %	0 %	0 %	126090261
47	NC_009036	AC	3	6	26564	26569	50 %	0 %	0 %	50 %	126090261
48	NC_009036	TA	4	8	29003	29010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009036	TA	3	6	29518	29523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009036	AC	3	6	31007	31012	50 %	0 %	0 %	50 %	126090264
51	NC_009036	AG	3	6	31153	31158	50 %	0 %	50 %	0 %	126090264
52	NC_009036	AC	3	6	32082	32087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009036	AG	4	8	32754	32761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009036	GT	3	6	32875	32880	0 %	50 %	50 %	0 %	126090266
55	NC_009036	AC	3	6	33141	33146	50 %	0 %	0 %	50 %	126090266
56	NC_009036	CG	3	6	33413	33418	0 %	0 %	50 %	50 %	126090266
57	NC_009036	AC	3	6	33608	33613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009036	TA	3	6	33893	33898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009036	AC	4	8	34322	34329	50 %	0 %	0 %	50 %	126090267
60	NC_009036	AG	3	6	36086	36091	50 %	0 %	50 %	0 %	126090269
61	NC_009036	AG	3	6	36397	36402	50 %	0 %	50 %	0 %	126090269
62	NC_009036	GC	3	6	37790	37795	0 %	0 %	50 %	50 %	126090269
63	NC_009036	GA	4	8	38350	38357	50 %	0 %	50 %	0 %	126090269
64	NC_009036	TA	4	8	38583	38590	50 %	50 %	0 %	0 %	126090269
65	NC_009036	AC	4	8	39045	39052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009036	AT	3	6	39498	39503	50 %	50 %	0 %	0 %	126090270
67	NC_009036	AC	3	6	41334	41339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009036	AG	3	6	41488	41493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009036	CA	3	6	45173	45178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009036	AT	3	6	46377	46382	50 %	50 %	0 %	0 %	126090280
71	NC_009036	CA	3	6	47468	47473	50 %	0 %	0 %	50 %	126090281
72	NC_009036	CT	3	6	47711	47716	0 %	50 %	0 %	50 %	126090281
73	NC_009036	AG	3	6	47985	47990	50 %	0 %	50 %	0 %	126090281
74	NC_009036	CA	3	6	49117	49122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009036	GA	3	6	49967	49972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009036	GT	3	6	50457	50462	0 %	50 %	50 %	0 %	126090285
77	NC_009036	AC	3	6	51514	51519	50 %	0 %	0 %	50 %	126090286
78	NC_009036	GC	3	6	51908	51913	0 %	0 %	50 %	50 %	126090286
79	NC_009036	TA	3	6	53062	53067	50 %	50 %	0 %	0 %	126090287
80	NC_009036	AT	4	8	53352	53359	50 %	50 %	0 %	0 %	126090287
81	NC_009036	CT	3	6	53840	53845	0 %	50 %	0 %	50 %	126090287
82	NC_009036	TG	3	6	53880	53885	0 %	50 %	50 %	0 %	126090287
83	NC_009036	AT	3	6	54290	54295	50 %	50 %	0 %	0 %	126090287
84	NC_009036	AT	3	6	54518	54523	50 %	50 %	0 %	0 %	126090287
85	NC_009036	CG	3	6	56024	56029	0 %	0 %	50 %	50 %	126090288
86	NC_009036	GT	4	8	58618	58625	0 %	50 %	50 %	0 %	126090292
87	NC_009036	CT	3	6	61225	61230	0 %	50 %	0 %	50 %	126090295
88	NC_009036	CT	4	8	61475	61482	0 %	50 %	0 %	50 %	126090295
89	NC_009036	GA	3	6	62456	62461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009036	TC	3	6	63961	63966	0 %	50 %	0 %	50 %	126090298
91	NC_009036	AT	4	8	65139	65146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009036	TA	3	6	66707	66712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009036	CA	3	6	69555	69560	50 %	0 %	0 %	50 %	126090304
94	NC_009036	AG	3	6	69913	69918	50 %	0 %	50 %	0 %	126090304
95	NC_009036	CT	3	6	71033	71038	0 %	50 %	0 %	50 %	126090304
96	NC_009036	TC	3	6	72625	72630	0 %	50 %	0 %	50 %	126090306

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.