MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal01

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009035	AAGCGA	2	12	437	448	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	126090119
2	NC_009035	TTGATA	2	12	1768	1779	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126090120
3	NC_009035	ATCGCC	2	12	3609	3620	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126090122
4	NC_009035	CAAAGC	2	12	3782	3793	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	126090122
5	NC_009035	GTTAAT	2	12	5254	5265	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126090123
6	NC_009035	TCAAGG	2	12	8719	8730	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126090127
7	NC_009035	GCTTAG	2	12	10110	10121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126090129
8	NC_009035	TCGCCC	2	12	10152	10163	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	126090129
9	NC_009035	TGGTTG	2	12	14021	14032	0 %	50 %	50 %	0 %	126090133
10	NC_009035	CCTGTG	2	12	14413	14424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090133
11	NC_009035	AGAGCC	2	12	23472	23483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090140
12	NC_009035	AAGCCC	2	12	23914	23925	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126090140
13	NC_009035	CAGTAT	2	12	27608	27619	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126090143
14	NC_009035	TAAAGC	2	12	33379	33390	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126090148
15	NC_009035	ACTGTT	2	12	38870	38881	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	126090155
16	NC_009035	GATCAG	2	12	40215	40226	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126090156
17	NC_009035	AACCAC	2	12	47529	47540	50 %	0 %	0 %	50 %	126090162
18	NC_009035	GGTTTT	2	12	49744	49755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090164
19	NC_009035	GGCAAA	2	12	57808	57819	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	126090169
20	NC_009035	ATGCTG	2	12	63678	63689	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126090173
21	NC_009035	CATCCA	2	12	69438	69449	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	126090180
22	NC_009035	GCCAAG	3	18	78541	78558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090184
23	NC_009035	TCGCAA	2	12	79451	79462	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126090185
24	NC_009035	CGCCTT	2	12	80216	80227	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126090185
25	NC_009035	CTTGGC	2	12	81111	81122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090187
26	NC_009035	ATGCCT	2	12	81259	81270	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126090187
27	NC_009035	AACCTT	2	12	93639	93650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090199
28	NC_009035	GAAGGT	2	12	95973	95984	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	126090200
29	NC_009035	CGATGA	2	12	98317	98328	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126090201
30	NC_009035	GCGGCA	2	12	99413	99424	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126090201
31	NC_009035	CCTTGT	2	12	101459	101470	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126090202
32	NC_009035	TTAAGA	2	12	102127	102138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	126090202
33	NC_009035	TTGTTA	2	12	105141	105152	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	126090203
34	NC_009035	CAGCAA	2	12	107917	107928	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	126090205
35	NC_009035	CCACAA	2	12	113861	113872	50 %	0 %	0 %	50 %	126090209
36	NC_009035	CGGCTT	2	12	113993	114004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090209
37	NC_009035	TTCCCA	2	12	116146	116157	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	126090210

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.