MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal01

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009035	TAACC	2	10	1414	1423	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009035	CGCAG	2	10	3124	3133	20 %	0 %	40 %	40 %	126090121
3	NC_009035	GCGCC	2	10	4505	4514	0 %	0 %	40 %	60 %	126090122
4	NC_009035	TTACA	2	10	6513	6522	40 %	40 %	0 %	20 %	126090124
5	NC_009035	TGGTG	2	10	10615	10624	0 %	40 %	60 %	0 %	126090129
6	NC_009035	TTTGG	2	10	10897	10906	0 %	60 %	40 %	0 %	126090129
7	NC_009035	ACCCA	2	10	11370	11379	40 %	0 %	0 %	60 %	126090129
8	NC_009035	GTGAT	2	10	13274	13283	20 %	40 %	40 %	0 %	126090132
9	NC_009035	CATAC	2	10	21603	21612	40 %	20 %	0 %	40 %	126090139
10	NC_009035	GATTT	2	10	21724	21733	20 %	60 %	20 %	0 %	126090139
11	NC_009035	GCAAA	2	10	26552	26561	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009035	ACCAG	2	10	26715	26724	40 %	0 %	20 %	40 %	126090143
13	NC_009035	CTTCA	2	10	27153	27162	20 %	40 %	0 %	40 %	126090143
14	NC_009035	AAAAT	2	10	28222	28231	80 %	20 %	0 %	0 %	126090143
15	NC_009035	AATGC	2	10	29963	29972	40 %	20 %	20 %	20 %	126090145
16	NC_009035	TTGCT	2	10	30398	30407	0 %	60 %	20 %	20 %	126090145
17	NC_009035	ATCAA	2	10	33561	33570	60 %	20 %	0 %	20 %	126090148
18	NC_009035	TTCGC	2	10	33792	33801	0 %	40 %	20 %	40 %	126090148
19	NC_009035	CTCGC	2	10	35290	35299	0 %	20 %	20 %	60 %	126090150
20	NC_009035	TGAAT	2	10	38176	38185	40 %	40 %	20 %	0 %	126090154
21	NC_009035	AGTTC	2	10	38323	38332	20 %	40 %	20 %	20 %	126090154
22	NC_009035	GTTAA	2	10	38501	38510	40 %	40 %	20 %	0 %	126090155
23	NC_009035	TTTGA	2	10	40493	40502	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009035	AGAAA	2	10	43956	43965	80 %	0 %	20 %	0 %	126090158
25	NC_009035	CAGTA	2	10	44827	44836	40 %	20 %	20 %	20 %	126090159
26	NC_009035	CAAAA	2	10	51403	51412	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009035	TAGAT	2	10	53543	53552	40 %	40 %	20 %	0 %	126090166
28	NC_009035	TCACG	2	10	53709	53718	20 %	20 %	20 %	40 %	126090166
29	NC_009035	AGACC	2	10	54142	54151	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009035	ACGTA	2	10	54654	54663	40 %	20 %	20 %	20 %	126090167
31	NC_009035	AATCC	2	10	55541	55550	40 %	20 %	0 %	40 %	126090167
32	NC_009035	TTAAA	2	10	57158	57167	60 %	40 %	0 %	0 %	126090168
33	NC_009035	CAGCG	2	10	57630	57639	20 %	0 %	40 %	40 %	126090169
34	NC_009035	ATATG	2	10	58032	58041	40 %	40 %	20 %	0 %	126090169
35	NC_009035	TAAAA	2	10	60658	60667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009035	AGGCT	2	10	61378	61387	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009035	CAGCG	2	10	65865	65874	20 %	0 %	40 %	40 %	126090176
38	NC_009035	TCGCC	2	10	65972	65981	0 %	20 %	20 %	60 %	126090176
39	NC_009035	GATTG	2	10	66792	66801	20 %	40 %	40 %	0 %	126090176
40	NC_009035	GCTGC	2	10	71022	71031	0 %	20 %	40 %	40 %	126090180
41	NC_009035	TAATT	2	10	71730	71739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009035	GTTTT	2	10	73231	73240	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009035	CAGAT	2	10	75267	75276	40 %	20 %	20 %	20 %	126090181
44	NC_009035	TTCTC	2	10	75851	75860	0 %	60 %	0 %	40 %	126090182
45	NC_009035	ACCGC	2	10	78445	78454	20 %	0 %	20 %	60 %	126090184
46	NC_009035	GAGTC	2	10	83165	83174	20 %	20 %	40 %	20 %	126090190
47	NC_009035	TTTGG	2	10	83548	83557	0 %	60 %	40 %	0 %	126090190
48	NC_009035	TTTTC	2	10	84813	84822	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009035	GATAA	2	10	85819	85828	60 %	20 %	20 %	0 %	126090193
50	NC_009035	CTAAA	2	10	85902	85911	60 %	20 %	0 %	20 %	126090193
51	NC_009035	CGCAG	2	10	86812	86821	20 %	0 %	40 %	40 %	126090194
52	NC_009035	AGCGC	2	10	88170	88179	20 %	0 %	40 %	40 %	126090195
53	NC_009035	ATACC	2	10	88345	88354	40 %	20 %	0 %	40 %	126090195
54	NC_009035	CCTGC	2	10	88490	88499	0 %	20 %	20 %	60 %	126090195
55	NC_009035	CCTAG	2	10	88658	88667	20 %	20 %	20 %	40 %	126090195
56	NC_009035	CGAAG	2	10	89882	89891	40 %	0 %	40 %	20 %	126090196
57	NC_009035	CCTTG	2	10	94290	94299	0 %	40 %	20 %	40 %	126090199
58	NC_009035	CCAAT	2	10	94811	94820	40 %	20 %	0 %	40 %	126090200
59	NC_009035	GAGCC	2	10	95430	95439	20 %	0 %	40 %	40 %	126090200
60	NC_009035	ATCGA	2	10	96022	96031	40 %	20 %	20 %	20 %	126090200
61	NC_009035	TCGCC	2	10	96368	96377	0 %	20 %	20 %	60 %	126090200
62	NC_009035	ACCAA	2	10	96410	96419	60 %	0 %	0 %	40 %	126090200
63	NC_009035	CTAGC	2	10	96624	96633	20 %	20 %	20 %	40 %	126090200
64	NC_009035	GCGCA	2	10	98190	98199	20 %	0 %	40 %	40 %	126090201
65	NC_009035	TGCGG	2	10	101079	101088	0 %	20 %	60 %	20 %	126090202
66	NC_009035	GGCAA	2	10	101356	101365	40 %	0 %	40 %	20 %	126090202
67	NC_009035	GCAGC	2	10	103246	103255	20 %	0 %	40 %	40 %	126090202
68	NC_009035	CACAG	2	10	104623	104632	40 %	0 %	20 %	40 %	126090203
69	NC_009035	GCAAT	2	10	104980	104989	40 %	20 %	20 %	20 %	126090203
70	NC_009035	GTTAA	2	10	106600	106609	40 %	40 %	20 %	0 %	126090203
71	NC_009035	ATTGA	2	10	106621	106630	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009035	TATTC	2	10	107362	107371	20 %	60 %	0 %	20 %	126090205
73	NC_009035	CATTA	2	10	107499	107508	40 %	40 %	0 %	20 %	126090205
74	NC_009035	TTGTG	2	10	108300	108309	0 %	60 %	40 %	0 %	126090205
75	NC_009035	CAGCT	2	10	109828	109837	20 %	20 %	20 %	40 %	126090207
76	NC_009035	TATCG	2	10	111595	111604	20 %	40 %	20 %	20 %	126090207
77	NC_009035	TCAAT	2	10	112179	112188	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009035	GGCTG	2	10	112275	112284	0 %	20 %	60 %	20 %	126090208
79	NC_009035	CATCG	2	10	113043	113052	20 %	20 %	20 %	40 %	126090208
80	NC_009035	CATCT	2	10	113214	113223	20 %	40 %	0 %	40 %	126090208
81	NC_009035	TGCCC	2	10	115578	115587	0 %	20 %	20 %	60 %	126090210

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.