MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal01

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009035	CG	3	6	730	735	0 %	0 %	50 %	50 %	126090119
2	NC_009035	TA	3	6	782	787	50 %	50 %	0 %	0 %	126090119
3	NC_009035	TG	3	6	1692	1697	0 %	50 %	50 %	0 %	126090120
4	NC_009035	TG	3	6	1794	1799	0 %	50 %	50 %	0 %	126090120
5	NC_009035	AT	3	6	2842	2847	50 %	50 %	0 %	0 %	126090120
6	NC_009035	CG	3	6	4754	4759	0 %	0 %	50 %	50 %	126090122
7	NC_009035	AC	3	6	5915	5920	50 %	0 %	0 %	50 %	126090124
8	NC_009035	CT	3	6	6308	6313	0 %	50 %	0 %	50 %	126090124
9	NC_009035	GC	3	6	6784	6789	0 %	0 %	50 %	50 %	126090124
10	NC_009035	GC	3	6	6968	6973	0 %	0 %	50 %	50 %	126090124
11	NC_009035	AT	3	6	7814	7819	50 %	50 %	0 %	0 %	126090126
12	NC_009035	GA	3	6	7981	7986	50 %	0 %	50 %	0 %	126090126
13	NC_009035	GT	4	8	8067	8074	0 %	50 %	50 %	0 %	126090127
14	NC_009035	CT	3	6	11126	11131	0 %	50 %	0 %	50 %	126090129
15	NC_009035	GT	3	6	12125	12130	0 %	50 %	50 %	0 %	126090130
16	NC_009035	TG	3	6	12307	12312	0 %	50 %	50 %	0 %	126090131
17	NC_009035	TA	3	6	12904	12909	50 %	50 %	0 %	0 %	126090131
18	NC_009035	CG	3	6	15232	15237	0 %	0 %	50 %	50 %	126090134
19	NC_009035	TG	3	6	15674	15679	0 %	50 %	50 %	0 %	126090134
20	NC_009035	GC	3	6	15699	15704	0 %	0 %	50 %	50 %	126090134
21	NC_009035	CA	3	6	18564	18569	50 %	0 %	0 %	50 %	126090137
22	NC_009035	GC	3	6	19328	19333	0 %	0 %	50 %	50 %	126090138
23	NC_009035	GC	3	6	19534	19539	0 %	0 %	50 %	50 %	126090138
24	NC_009035	CA	3	6	19804	19809	50 %	0 %	0 %	50 %	126090138
25	NC_009035	GA	3	6	20398	20403	50 %	0 %	50 %	0 %	126090138
26	NC_009035	CA	3	6	24837	24842	50 %	0 %	0 %	50 %	126090141
27	NC_009035	GC	4	8	26031	26038	0 %	0 %	50 %	50 %	126090142
28	NC_009035	GC	3	6	26261	26266	0 %	0 %	50 %	50 %	126090142
29	NC_009035	GC	3	6	27042	27047	0 %	0 %	50 %	50 %	126090143
30	NC_009035	AC	3	6	27458	27463	50 %	0 %	0 %	50 %	126090143
31	NC_009035	GC	3	6	28589	28594	0 %	0 %	50 %	50 %	126090144
32	NC_009035	GC	3	6	29561	29566	0 %	0 %	50 %	50 %	126090145
33	NC_009035	GC	3	6	31114	31119	0 %	0 %	50 %	50 %	126090146
34	NC_009035	GC	3	6	31207	31212	0 %	0 %	50 %	50 %	126090146
35	NC_009035	CG	3	6	32661	32666	0 %	0 %	50 %	50 %	126090148
36	NC_009035	CT	3	6	33006	33011	0 %	50 %	0 %	50 %	126090148
37	NC_009035	GC	3	6	33121	33126	0 %	0 %	50 %	50 %	126090148
38	NC_009035	TG	3	6	33175	33180	0 %	50 %	50 %	0 %	126090148
39	NC_009035	CG	3	6	33435	33440	0 %	0 %	50 %	50 %	126090148
40	NC_009035	AT	3	6	34810	34815	50 %	50 %	0 %	0 %	126090149
41	NC_009035	AC	3	6	37176	37181	50 %	0 %	0 %	50 %	126090154
42	NC_009035	GC	3	6	39306	39311	0 %	0 %	50 %	50 %	126090156
43	NC_009035	AC	3	6	40131	40136	50 %	0 %	0 %	50 %	126090156
44	NC_009035	GC	3	6	40154	40159	0 %	0 %	50 %	50 %	126090156
45	NC_009035	CA	3	6	41650	41655	50 %	0 %	0 %	50 %	126090157
46	NC_009035	AC	3	6	41904	41909	50 %	0 %	0 %	50 %	126090157
47	NC_009035	AC	3	6	41954	41959	50 %	0 %	0 %	50 %	126090157
48	NC_009035	TA	3	6	43180	43185	50 %	50 %	0 %	0 %	126090158
49	NC_009035	CT	3	6	43696	43701	0 %	50 %	0 %	50 %	126090158
50	NC_009035	TG	3	6	43712	43717	0 %	50 %	50 %	0 %	126090158
51	NC_009035	TG	3	6	44722	44727	0 %	50 %	50 %	0 %	126090159
52	NC_009035	CG	3	6	44754	44759	0 %	0 %	50 %	50 %	126090159
53	NC_009035	TC	3	6	45330	45335	0 %	50 %	0 %	50 %	126090160
54	NC_009035	CG	3	6	47945	47950	0 %	0 %	50 %	50 %	126090162
55	NC_009035	AC	3	6	48153	48158	50 %	0 %	0 %	50 %	126090162
56	NC_009035	GC	3	6	48335	48340	0 %	0 %	50 %	50 %	126090162
57	NC_009035	CA	3	6	48614	48619	50 %	0 %	0 %	50 %	126090162
58	NC_009035	AG	3	6	49125	49130	50 %	0 %	50 %	0 %	126090163
59	NC_009035	TG	4	8	50199	50206	0 %	50 %	50 %	0 %	126090164
60	NC_009035	TA	3	6	50871	50876	50 %	50 %	0 %	0 %	126090164
61	NC_009035	CA	3	6	52002	52007	50 %	0 %	0 %	50 %	126090165
62	NC_009035	GA	3	6	52046	52051	50 %	0 %	50 %	0 %	126090165
63	NC_009035	GC	3	6	52644	52649	0 %	0 %	50 %	50 %	126090166
64	NC_009035	CA	3	6	55821	55826	50 %	0 %	0 %	50 %	126090167
65	NC_009035	TG	3	6	58970	58975	0 %	50 %	50 %	0 %	126090169
66	NC_009035	GA	3	6	59036	59041	50 %	0 %	50 %	0 %	126090169
67	NC_009035	CA	3	6	59479	59484	50 %	0 %	0 %	50 %	126090170
68	NC_009035	CG	3	6	60301	60306	0 %	0 %	50 %	50 %	126090171
69	NC_009035	GC	3	6	60838	60843	0 %	0 %	50 %	50 %	126090172
70	NC_009035	TC	3	6	61258	61263	0 %	50 %	0 %	50 %	126090172
71	NC_009035	GC	3	6	64105	64110	0 %	0 %	50 %	50 %	126090174
72	NC_009035	GC	3	6	64528	64533	0 %	0 %	50 %	50 %	126090175
73	NC_009035	CA	3	6	65797	65802	50 %	0 %	0 %	50 %	126090176
74	NC_009035	GC	3	6	66216	66221	0 %	0 %	50 %	50 %	126090176
75	NC_009035	GC	3	6	66272	66277	0 %	0 %	50 %	50 %	126090176
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81	NC_009035	GC	3	6	69310	69315	0 %	0 %	50 %	50 %	126090180
82	NC_009035	GC	4	8	69507	69514	0 %	0 %	50 %	50 %	126090180
83	NC_009035	CG	3	6	69608	69613	0 %	0 %	50 %	50 %	126090180
84	NC_009035	AC	3	6	69682	69687	50 %	0 %	0 %	50 %	126090180
85	NC_009035	AT	3	6	73591	73596	50 %	50 %	0 %	0 %	126090181
86	NC_009035	CA	4	8	73691	73698	50 %	0 %	0 %	50 %	126090181
87	NC_009035	GC	3	6	74651	74656	0 %	0 %	50 %	50 %	126090181
88	NC_009035	AT	3	6	74862	74867	50 %	50 %	0 %	0 %	126090181
89	NC_009035	GC	3	6	77946	77951	0 %	0 %	50 %	50 %	126090184
90	NC_009035	GC	4	8	78406	78413	0 %	0 %	50 %	50 %	126090184
91	NC_009035	GC	3	6	79756	79761	0 %	0 %	50 %	50 %	126090185
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93	NC_009035	TA	3	6	80606	80611	50 %	50 %	0 %	0 %	126090186
94	NC_009035	TC	3	6	80796	80801	0 %	50 %	0 %	50 %	126090186
95	NC_009035	CG	3	6	80901	80906	0 %	0 %	50 %	50 %	126090186
96	NC_009035	CG	4	8	81669	81676	0 %	0 %	50 %	50 %	126090187
97	NC_009035	TA	3	6	82160	82165	50 %	50 %	0 %	0 %	126090188
98	NC_009035	CG	3	6	82482	82487	0 %	0 %	50 %	50 %	126090188
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101	NC_009035	GC	3	6	86545	86550	0 %	0 %	50 %	50 %	126090194
102	NC_009035	AC	3	6	89028	89033	50 %	0 %	0 %	50 %	126090195
103	NC_009035	CG	3	6	89067	89072	0 %	0 %	50 %	50 %	126090195
104	NC_009035	AT	3	6	94235	94240	50 %	50 %	0 %	0 %	126090199
105	NC_009035	AC	3	6	94898	94903	50 %	0 %	0 %	50 %	126090200
106	NC_009035	GC	4	8	95135	95142	0 %	0 %	50 %	50 %	126090200
107	NC_009035	CT	3	6	95592	95597	0 %	50 %	0 %	50 %	126090200
108	NC_009035	AC	3	6	95746	95751	50 %	0 %	0 %	50 %	126090200
109	NC_009035	TG	3	6	95817	95822	0 %	50 %	50 %	0 %	126090200
110	NC_009035	CG	3	6	95870	95875	0 %	0 %	50 %	50 %	126090200
111	NC_009035	AT	3	6	95939	95944	50 %	50 %	0 %	0 %	126090200
112	NC_009035	GC	3	6	97375	97380	0 %	0 %	50 %	50 %	126090201
113	NC_009035	CA	3	6	97842	97847	50 %	0 %	0 %	50 %	126090201
114	NC_009035	GT	3	6	98948	98953	0 %	50 %	50 %	0 %	126090201
115	NC_009035	GC	3	6	99095	99100	0 %	0 %	50 %	50 %	126090201
116	NC_009035	CA	3	6	99427	99432	50 %	0 %	0 %	50 %	126090201
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118	NC_009035	CA	4	8	100064	100071	50 %	0 %	0 %	50 %	126090201
119	NC_009035	GC	3	6	100129	100134	0 %	0 %	50 %	50 %	126090201
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122	NC_009035	GT	3	6	102383	102388	0 %	50 %	50 %	0 %	126090202
123	NC_009035	GT	3	6	102910	102915	0 %	50 %	50 %	0 %	126090202
124	NC_009035	GC	3	6	103044	103049	0 %	0 %	50 %	50 %	126090202
125	NC_009035	AT	3	6	103482	103487	50 %	50 %	0 %	0 %	126090202
126	NC_009035	CT	3	6	103501	103506	0 %	50 %	0 %	50 %	126090202
127	NC_009035	GC	3	6	104099	104104	0 %	0 %	50 %	50 %	126090202
128	NC_009035	GC	3	6	104596	104601	0 %	0 %	50 %	50 %	126090203
129	NC_009035	CA	3	6	105020	105025	50 %	0 %	0 %	50 %	126090203
130	NC_009035	CG	3	6	105825	105830	0 %	0 %	50 %	50 %	126090203
131	NC_009035	CG	3	6	106847	106852	0 %	0 %	50 %	50 %	126090204
132	NC_009035	CT	3	6	107134	107139	0 %	50 %	0 %	50 %	126090204
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139	NC_009035	GC	3	6	113002	113007	0 %	0 %	50 %	50 %	126090208
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.