MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylothermus marinus F1 chromosome

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009033	ATAATT	2	12	26825	26836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009033	TTATAT	2	12	32017	32028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009033	ATATAA	2	12	47105	47116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009033	AGGCTC	2	12	47859	47870	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009033	AAAATA	2	12	89823	89834	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009033	TTTATT	2	12	137379	137390	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009033	AAAACA	2	12	173645	173656	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009033	ACCATA	2	12	217521	217532	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009033	ATTAAA	2	12	219038	219049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009033	TTTTTC	2	12	241625	241636	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009033	AGAGGC	2	12	305084	305095	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009033	AAGTCT	2	12	322873	322884	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009033	AAAAAG	2	12	322936	322947	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009033	TTAAAC	2	12	330108	330119	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009033	GATCCT	2	12	330251	330262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009033	CAAAAA	2	12	349650	349661	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009033	TTATTT	2	12	356552	356563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009033	TGATGG	2	12	375335	375346	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009033	ACATCC	2	12	376961	376972	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009033	CCGGAG	2	12	394413	394424	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009033	AACTGC	2	12	394736	394747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009033	TGCTTT	2	12	395140	395151	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_009033	CTCTAT	2	12	408662	408673	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009033	TGACGA	2	12	456358	456369	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009033	GTTAAA	2	12	540104	540115	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009033	ATAAAC	2	12	563602	563613	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009033	TGAAAG	2	12	564909	564920	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009033	ACTGTT	2	12	565249	565260	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009033	TATTTT	2	12	593587	593598	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009033	CCTAAT	2	12	594237	594248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009033	CTTAAA	2	12	596332	596343	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009033	TTTTTG	2	12	603324	603335	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009033	TGTTCA	2	12	611117	611128	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009033	AAATAT	2	12	622808	622819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009033	TAAAAA	2	12	625643	625654	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009033	CAAAAA	2	12	667788	667799	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009033	ATTTTT	2	12	668297	668308	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009033	GAGCGA	2	12	668501	668512	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009033	TTTATA	2	12	681414	681425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009033	TTTATT	2	12	688151	688162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009033	AAAAAC	2	12	707546	707557	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009033	CGATCT	2	12	710968	710979	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009033	TAAAAT	2	12	718923	718934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009033	TGGGAG	2	12	737186	737197	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009033	TTGTTT	2	12	824591	824602	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009033	GGAAGA	2	12	888178	888189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009033	CATGTT	2	12	902506	902517	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009033	ATAAAA	2	12	936776	936787	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009033	TTTATT	2	12	984545	984556	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009033	AAATAT	2	12	1023949	1023960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009033	GGTGTA	2	12	1102688	1102699	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009033	AAATCA	2	12	1105275	1105286	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009033	TTTTGT	2	12	1111067	1111078	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009033	CGTAGG	2	12	1120260	1120271	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009033	GGGGAA	2	12	1121075	1121086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009033	CGGGGG	2	12	1121905	1121916	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009033	AGAGAA	2	12	1152570	1152581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009033	AAAACT	2	12	1169644	1169655	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_009033	TCCATA	2	12	1199449	1199460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009033	TCTTTT	2	12	1237981	1237992	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009033	GTATGG	2	12	1314123	1314134	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009033	GTTGAG	2	12	1351622	1351633	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009033	ACATAA	2	12	1445123	1445134	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_009033	GTTTTT	2	12	1451363	1451374	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009033	TGTATG	2	12	1455532	1455543	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009033	ATTAGT	2	12	1464446	1464457	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009033	AACATC	2	12	1474465	1474476	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009033	TTCTAT	2	12	1482652	1482663	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009033	CTATCC	2	12	1500185	1500196	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009033	TATCTA	2	12	1505805	1505816	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009033	ATTATA	2	12	1508720	1508731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009033	ATTTTT	2	12	1518047	1518058	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009033	TTTTAT	2	12	1518063	1518074	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009033	GTATAT	2	12	1525406	1525417	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009033	CATTAA	2	12	1533787	1533798	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009033	AGAGTT	2	12	1569654	1569665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.