MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylothermus marinus F1 chromosome

Total Repeats: 444

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009033	TTCTAT	2	12	10350	10361	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	126464927
2	NC_009033	TTCTTT	2	12	11172	11183	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	126464927
3	NC_009033	ATAAGA	2	12	14579	14590	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	126464928
4	NC_009033	TAGCTA	2	12	17452	17463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126464929
5	NC_009033	CTGTTG	2	12	21952	21963	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126464936
6	NC_009033	TTATAC	2	12	21979	21990	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	126464936
7	NC_009033	CCATAC	2	12	26522	26533	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	126464942
8	NC_009033	TCTACG	2	12	27018	27029	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126464943
9	NC_009033	CTTAGG	2	12	31983	31994	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126464949
10	NC_009033	TGGTAC	2	12	39139	39150	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126464957
11	NC_009033	TTATGA	2	12	46462	46473	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126464966
12	NC_009033	GGTTTA	2	12	53506	53517	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	126464972
13	NC_009033	GTGGAT	2	12	54746	54757	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	126464973
14	NC_009033	AGTGGG	2	12	66526	66537	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	126464985
15	NC_009033	TTATAG	2	12	67507	67518	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126464986
16	NC_009033	AATTAA	2	12	68600	68611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464987
17	NC_009033	AGAGGA	2	12	71551	71562	50 %	0 %	50 %	0 %	126464988
18	NC_009033	AAAACT	2	12	71946	71957	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	126464989
19	NC_009033	GCTATG	2	12	74610	74621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126464990
20	NC_009033	TTGCTC	2	12	76419	76430	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126464992
21	NC_009033	TAGGTG	2	12	82711	82722	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	126464997
22	NC_009033	AGCTAC	2	12	85045	85056	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126465000
23	NC_009033	AGGATG	2	12	87233	87244	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	126465002
24	NC_009033	ATCAAT	2	12	89693	89704	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126465004
25	NC_009033	CTATGA	2	12	90701	90712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126465006
26	NC_009033	GCTAAA	2	12	91830	91841	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126465006
27	NC_009033	TGATAT	2	12	97028	97039	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126465009
28	NC_009033	CTGGGA	2	12	98177	98188	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126465010
29	NC_009033	CTTTCT	2	12	99789	99800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126465011
30	NC_009033	ATCTTG	2	12	101728	101739	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	126465014
31	NC_009033	TTTGTA	2	12	126033	126044	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	126465035
32	NC_009033	TATTCT	2	12	132021	132032	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	126465042
33	NC_009033	CGTATT	2	12	136570	136581	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	126465046
34	NC_009033	AAGGAC	2	12	137076	137087	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	126465046
35	NC_009033	TACTAA	2	12	137142	137153	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126465046
36	NC_009033	ATACGA	2	12	141030	141041	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126465050
37	NC_009033	ATTCCT	2	12	142037	142048	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	126465051
38	NC_009033	GGTCTC	2	12	147185	147196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126465054
39	NC_009033	AGCTAA	2	12	148198	148209	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126465054
40	NC_009033	TAGTTG	2	12	148375	148386	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	126465055
41	NC_009033	TGGTTG	2	12	148393	148404	0 %	50 %	50 %	0 %	126465055
42	NC_009033	TTTTCT	2	12	155694	155705	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	126465061
43	NC_009033	TAGTGG	2	12	156293	156304	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	126465062
44	NC_009033	GATTAT	2	12	158279	158290	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126465063
45	NC_009033	ACAGCT	2	12	162355	162366	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126465064
46	NC_009033	TACTTC	2	12	164924	164935	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	126465065
47	NC_009033	TAAGGA	2	12	165747	165758	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	126465066
48	NC_009033	ATAGTT	2	12	166848	166859	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126465067
49	NC_009033	AAGCTG	2	12	167809	167820	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126465068
50	NC_009033	GAAAAA	2	12	169403	169414	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	126465069
51	NC_009033	TTAGCA	2	12	170287	170298	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126465071
52	NC_009033	AAAATA	2	12	172933	172944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	126465075
53	NC_009033	GTATAT	2	12	192185	192196	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126465093
54	NC_009033	AGCTAG	2	12	202579	202590	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126465103
55	NC_009033	GGAAAA	2	12	211507	211518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126465113
56	NC_009033	TCATCT	2	12	220565	220576	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	126465121
57	NC_009033	TAATAG	2	12	232879	232890	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	126465133
58	NC_009033	CTCTTC	2	12	232919	232930	0 %	50 %	0 %	50 %	126465133
59	NC_009033	CAATGT	2	12	234347	234358	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126465135
60	NC_009033	TCCTCG	2	12	237475	237486	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126465136
61	NC_009033	CATAAT	2	12	246963	246974	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126465146
62	NC_009033	CAGTAA	2	12	247761	247772	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126465146
63	NC_009033	TGATAA	2	12	249434	249445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	126465148
64	NC_009033	AGTCAA	2	12	251019	251030	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126465149
65	NC_009033	ACATAG	2	12	252200	252211	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126465150
66	NC_009033	TAGGAA	2	12	255912	255923	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	126465153
67	NC_009033	GCATTA	2	12	258854	258865	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126465158
68	NC_009033	GGATAC	2	12	264529	264540	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126465162
69	NC_009033	AGGATA	2	12	267614	267625	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	126465165
70	NC_009033	AAAAAT	2	12	269259	269270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	126465165
71	NC_009033	TCTAAT	2	12	270382	270393	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	126465166
72	NC_009033	CTCTCC	2	12	273149	273160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126465169
73	NC_009033	ATACGT	2	12	275601	275612	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126465170
74	NC_009033	TTATGA	2	12	278547	278558	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126465174
75	NC_009033	TAGTAT	2	12	287374	287385	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126465182
76	NC_009033	AGTCCT	2	12	289059	289070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126465184
77	NC_009033	AAGCAA	2	12	289971	289982	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	126465185
78	NC_009033	TATGTA	2	12	291379	291390	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126465186
79	NC_009033	ATTATA	2	12	292362	292373	50 %	50 %	0 %	0 %	126465186
80	NC_009033	CAATAC	2	12	302759	302770	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	126465197
81	NC_009033	GTCCAT	2	12	303290	303301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126465197
82	NC_009033	GAAGCA	2	12	303892	303903	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	126465198
83	NC_009033	ATAGTA	2	12	304728	304739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	126465199
84	NC_009033	GTAGAG	2	12	305623	305634	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	126465200
85	NC_009033	CCTACG	2	12	310744	310755	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126465206
86	NC_009033	ATTGAG	2	12	313184	313195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126465208
87	NC_009033	TAAAAA	2	12	315314	315325	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	126465210
88	NC_009033	ACAGCA	2	12	315671	315682	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	126465211
89	NC_009033	GCAGAG	2	12	319198	319209	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126465214
90	NC_009033	GTTGCT	2	12	319211	319222	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126465214
91	NC_009033	AAAAAT	2	12	323076	323087	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	126465219
92	NC_009033	GAATAA	2	12	326450	326461	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	126465222
93	NC_009033	TGTGTT	2	12	331394	331405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126465225
94	NC_009033	GTCCTA	2	12	337642	337653	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126465230
95	NC_009033	AGCTAA	2	12	339687	339698	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126465232
96	NC_009033	TATACA	2	12	340651	340662	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126465233
97	NC_009033	GATTAG	2	12	354139	354150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126465244
98	NC_009033	ATCCTG	2	12	356680	356691	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126465248
99	NC_009033	ACATCC	2	12	361760	361771	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	126465252
100	NC_009033	GCTCTG	2	12	362076	362087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126465253
101	NC_009033	GGTATT	2	12	362216	362227	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	126465253
102	NC_009033	TCTGCC	2	12	362514	362525	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126465253
103	NC_009033	CCTCTC	2	12	363075	363086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126465254
104	NC_009033	TGTGGT	2	12	368402	368413	0 %	50 %	50 %	0 %	126465257
105	NC_009033	ATTGCT	2	12	372351	372362	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	126465261
106	NC_009033	GTGTAA	2	12	374465	374476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126465262
107	NC_009033	AGGAAT	2	12	380081	380092	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	126465268
108	NC_009033	CTATAT	2	12	381677	381688	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	126465269
109	NC_009033	TTCTTT	2	12	385671	385682	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	126465274
110	NC_009033	ACTAAC	2	12	394282	394293	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	126465285
111	NC_009033	TAATCA	2	12	394299	394310	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126465285
112	NC_009033	TGTTTT	2	12	402098	402109	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	126465292
113	NC_009033	CCATAT	2	12	402353	402364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126465292
114	NC_009033	CATATA	2	12	403376	403387	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126465293
115	NC_009033	ATCTTC	2	12	411817	411828	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	126465304
116	NC_009033	GTATTG	2	12	414715	414726	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	126465306
117	NC_009033	TCTATT	2	12	417968	417979	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	126465309
118	NC_009033	CTGGTT	2	12	421095	421106	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126465313
119	NC_009033	ATGGTA	2	12	433748	433759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126465324
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230	NC_009033	AGTAGA	2	12	890390	890401	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	126465806
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232	NC_009033	TACCAT	2	12	902214	902225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126465819
233	NC_009033	CCCTTA	2	12	903943	903954	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	126465821
234	NC_009033	CAACTA	2	12	906091	906102	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	126465823
235	NC_009033	ATAACT	2	12	916696	916707	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126465834
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237	NC_009033	TTCCTA	2	12	918671	918682	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	126465835
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336	NC_009033	CTTTAT	2	12	1190139	1190150	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	126466115
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339	NC_009033	TGAGGA	2	12	1194896	1194907	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	126466120
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