MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylothermus marinus F1 chromosome

Total Repeats: 3953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009033	TGGA	2	8	226	233	25 %	25 %	50 %	0 %	126464914
2	NC_009033	GAAA	2	8	646	653	75 %	0 %	25 %	0 %	126464914
3	NC_009033	GATG	2	8	726	733	25 %	25 %	50 %	0 %	126464914
4	NC_009033	TGGC	2	8	1272	1279	0 %	25 %	50 %	25 %	126464915
5	NC_009033	ATTA	2	8	1570	1577	50 %	50 %	0 %	0 %	126464915
6	NC_009033	ATTA	2	8	2031	2038	50 %	50 %	0 %	0 %	126464917
7	NC_009033	ATTC	2	8	2611	2618	25 %	50 %	0 %	25 %	126464917
8	NC_009033	CTTC	2	8	4287	4294	0 %	50 %	0 %	50 %	126464920
9	NC_009033	TTTC	2	8	5171	5178	0 %	75 %	0 %	25 %	126464921
10	NC_009033	AGCT	2	8	6131	6138	25 %	25 %	25 %	25 %	126464921
11	NC_009033	ATAA	2	8	6373	6380	75 %	25 %	0 %	0 %	126464922
12	NC_009033	AACC	2	8	7597	7604	50 %	0 %	0 %	50 %	126464924
13	NC_009033	ATTC	2	8	7733	7740	25 %	50 %	0 %	25 %	126464924
14	NC_009033	CCCT	2	8	8248	8255	0 %	25 %	0 %	75 %	126464924
15	NC_009033	ATAC	2	8	8555	8562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009033	TAAA	2	8	8576	8583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009033	ATTC	2	8	8616	8623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009033	ATGG	2	8	8983	8990	25 %	25 %	50 %	0 %	126464925
19	NC_009033	GAAA	2	8	9060	9067	75 %	0 %	25 %	0 %	126464925
20	NC_009033	TGGA	2	8	9119	9126	25 %	25 %	50 %	0 %	126464925
21	NC_009033	TAAT	2	8	9428	9435	50 %	50 %	0 %	0 %	126464925
22	NC_009033	AGGC	2	8	10109	10116	25 %	0 %	50 %	25 %	126464927
23	NC_009033	ATTT	2	8	10809	10816	25 %	75 %	0 %	0 %	126464927
24	NC_009033	TGAT	2	8	11378	11385	25 %	50 %	25 %	0 %	126464927
25	NC_009033	GATT	2	8	11859	11866	25 %	50 %	25 %	0 %	126464927
26	NC_009033	TGTT	2	8	11915	11922	0 %	75 %	25 %	0 %	126464927
27	NC_009033	ATTC	2	8	11969	11976	25 %	50 %	0 %	25 %	126464927
28	NC_009033	ACAT	2	8	12172	12179	50 %	25 %	0 %	25 %	126464927
29	NC_009033	TAAT	2	8	12481	12488	50 %	50 %	0 %	0 %	126464927
30	NC_009033	AATG	2	8	12759	12766	50 %	25 %	25 %	0 %	126464927
31	NC_009033	GATA	2	8	13108	13115	50 %	25 %	25 %	0 %	126464927
32	NC_009033	TAAT	2	8	13349	13356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009033	TATT	2	8	13620	13627	25 %	75 %	0 %	0 %	126464928
34	NC_009033	AAAG	2	8	14127	14134	75 %	0 %	25 %	0 %	126464928
35	NC_009033	ATGG	2	8	14939	14946	25 %	25 %	50 %	0 %	126464928
36	NC_009033	TTGG	2	8	14949	14956	0 %	50 %	50 %	0 %	126464928
37	NC_009033	TATC	2	8	15098	15105	25 %	50 %	0 %	25 %	126464928
38	NC_009033	ATAC	2	8	15582	15589	50 %	25 %	0 %	25 %	126464928
39	NC_009033	AACA	2	8	16439	16446	75 %	0 %	0 %	25 %	126464929
40	NC_009033	GTTT	2	8	16765	16772	0 %	75 %	25 %	0 %	126464929
41	NC_009033	AGGA	2	8	16971	16978	50 %	0 %	50 %	0 %	126464929
42	NC_009033	AATT	2	8	17374	17381	50 %	50 %	0 %	0 %	126464929
43	NC_009033	TTTA	2	8	17669	17676	25 %	75 %	0 %	0 %	126464929
44	NC_009033	ATCC	2	8	17863	17870	25 %	25 %	0 %	50 %	126464929
45	NC_009033	ATCT	2	8	18040	18047	25 %	50 %	0 %	25 %	126464930
46	NC_009033	GAGT	2	8	18110	18117	25 %	25 %	50 %	0 %	126464930
47	NC_009033	TGAA	2	8	18542	18549	50 %	25 %	25 %	0 %	126464931
48	NC_009033	CTTT	2	8	19056	19063	0 %	75 %	0 %	25 %	126464932
49	NC_009033	TTTA	2	8	19145	19152	25 %	75 %	0 %	0 %	126464932
50	NC_009033	CATT	2	8	19291	19298	25 %	50 %	0 %	25 %	126464932
51	NC_009033	ATAC	2	8	20325	20332	50 %	25 %	0 %	25 %	126464933
52	NC_009033	TGAT	2	8	20618	20625	25 %	50 %	25 %	0 %	126464933
53	NC_009033	TCTG	2	8	20970	20977	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009033	TGCT	2	8	21297	21304	0 %	50 %	25 %	25 %	126464934
55	NC_009033	AACC	2	8	22637	22644	50 %	0 %	0 %	50 %	126464937
56	NC_009033	GATC	2	8	22815	22822	25 %	25 %	25 %	25 %	126464937
57	NC_009033	ACTT	2	8	22828	22835	25 %	50 %	0 %	25 %	126464938
58	NC_009033	GAGG	2	8	23196	23203	25 %	0 %	75 %	0 %	126464938
59	NC_009033	ATTG	2	8	24115	24122	25 %	50 %	25 %	0 %	126464940
60	NC_009033	TATT	2	8	25264	25271	25 %	75 %	0 %	0 %	126464940
61	NC_009033	TTAT	2	8	25603	25610	25 %	75 %	0 %	0 %	126464941
62	NC_009033	GCAT	2	8	25617	25624	25 %	25 %	25 %	25 %	126464941
63	NC_009033	ATCG	2	8	25687	25694	25 %	25 %	25 %	25 %	126464941
64	NC_009033	TATT	2	8	25785	25792	25 %	75 %	0 %	0 %	126464942
65	NC_009033	CATA	2	8	26700	26707	50 %	25 %	0 %	25 %	126464942
66	NC_009033	TACA	2	8	27033	27040	50 %	25 %	0 %	25 %	126464943
67	NC_009033	TATT	2	8	27189	27196	25 %	75 %	0 %	0 %	126464943
68	NC_009033	AATT	2	8	27453	27460	50 %	50 %	0 %	0 %	126464943
69	NC_009033	TCAT	2	8	27524	27531	25 %	50 %	0 %	25 %	126464943
70	NC_009033	ATTA	2	8	28314	28321	50 %	50 %	0 %	0 %	126464944
71	NC_009033	TGAT	2	8	28330	28337	25 %	50 %	25 %	0 %	126464944
72	NC_009033	TTCA	2	8	28659	28666	25 %	50 %	0 %	25 %	126464944
73	NC_009033	ATCT	2	8	29166	29173	25 %	50 %	0 %	25 %	126464945
74	NC_009033	TCTT	2	8	29416	29423	0 %	75 %	0 %	25 %	126464945
75	NC_009033	TCCA	2	8	29731	29738	25 %	25 %	0 %	50 %	126464945
76	NC_009033	CTTC	2	8	29777	29784	0 %	50 %	0 %	50 %	126464945
77	NC_009033	CCTA	2	8	30119	30126	25 %	25 %	0 %	50 %	126464946
78	NC_009033	CTCC	2	8	31020	31027	0 %	25 %	0 %	75 %	126464948
79	NC_009033	CTTT	2	8	31153	31160	0 %	75 %	0 %	25 %	126464948
80	NC_009033	ATTA	2	8	31315	31322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009033	TTCC	2	8	32144	32151	0 %	50 %	0 %	50 %	126464950
82	NC_009033	TAAT	2	8	32738	32745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009033	ATTT	3	12	32748	32759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009033	TACT	2	8	33111	33118	25 %	50 %	0 %	25 %	126464951
85	NC_009033	ATCA	2	8	33624	33631	50 %	25 %	0 %	25 %	126464951
86	NC_009033	TAAT	2	8	33676	33683	50 %	50 %	0 %	0 %	126464952
87	NC_009033	AATT	2	8	33928	33935	50 %	50 %	0 %	0 %	126464952
88	NC_009033	TAGT	2	8	34162	34169	25 %	50 %	25 %	0 %	126464952
89	NC_009033	AAAT	2	8	34252	34259	75 %	25 %	0 %	0 %	126464952
90	NC_009033	TCAA	2	8	34986	34993	50 %	25 %	0 %	25 %	126464953
91	NC_009033	CTAT	2	8	35085	35092	25 %	50 %	0 %	25 %	126464953
92	NC_009033	TATT	2	8	35150	35157	25 %	75 %	0 %	0 %	126464953
93	NC_009033	GATC	2	8	35489	35496	25 %	25 %	25 %	25 %	126464954
94	NC_009033	ACCC	2	8	35724	35731	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_009033	AAAT	2	8	36200	36207	75 %	25 %	0 %	0 %	126464955
96	NC_009033	TAGT	2	8	36570	36577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009033	GCGG	2	8	37003	37010	0 %	0 %	75 %	25 %	126464956
98	NC_009033	TATC	2	8	37574	37581	25 %	50 %	0 %	25 %	126464956
99	NC_009033	TATT	2	8	37590	37597	25 %	75 %	0 %	0 %	126464956
100	NC_009033	GATA	2	8	38109	38116	50 %	25 %	25 %	0 %	126464956
101	NC_009033	AGAA	2	8	38581	38588	75 %	0 %	25 %	0 %	126464956
102	NC_009033	GTTA	2	8	38818	38825	25 %	50 %	25 %	0 %	126464957
103	NC_009033	TTGC	2	8	39353	39360	0 %	50 %	25 %	25 %	126464957
104	NC_009033	AGTG	2	8	40113	40120	25 %	25 %	50 %	0 %	126464958
105	NC_009033	ATAA	2	8	40373	40380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009033	GATT	2	8	40710	40717	25 %	50 %	25 %	0 %	126464959
107	NC_009033	TACA	2	8	40768	40775	50 %	25 %	0 %	25 %	126464960
108	NC_009033	CCAG	2	8	40931	40938	25 %	0 %	25 %	50 %	126464960
109	NC_009033	TATT	2	8	41639	41646	25 %	75 %	0 %	0 %	126464961
110	NC_009033	CATC	2	8	41897	41904	25 %	25 %	0 %	50 %	126464961
111	NC_009033	CATT	2	8	42150	42157	25 %	50 %	0 %	25 %	126464961
112	NC_009033	ATGG	2	8	42786	42793	25 %	25 %	50 %	0 %	126464962
113	NC_009033	TATT	2	8	43646	43653	25 %	75 %	0 %	0 %	126464962
114	NC_009033	TTTA	2	8	43876	43883	25 %	75 %	0 %	0 %	126464962
115	NC_009033	AGAA	2	8	44050	44057	75 %	0 %	25 %	0 %	126464962
116	NC_009033	TTGT	2	8	44113	44120	0 %	75 %	25 %	0 %	126464963
117	NC_009033	CCTG	2	8	44806	44813	0 %	25 %	25 %	50 %	126464964
118	NC_009033	ATTT	2	8	44971	44978	25 %	75 %	0 %	0 %	126464964
119	NC_009033	ACTC	2	8	45231	45238	25 %	25 %	0 %	50 %	126464964
120	NC_009033	ATCA	2	8	45508	45515	50 %	25 %	0 %	25 %	126464964
121	NC_009033	TAAA	2	8	46934	46941	75 %	25 %	0 %	0 %	126464966
122	NC_009033	GTTT	2	8	47846	47853	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009033	TAGA	2	8	48747	48754	50 %	25 %	25 %	0 %	126464967
124	NC_009033	ATAG	2	8	48863	48870	50 %	25 %	25 %	0 %	126464967
125	NC_009033	TTTC	2	8	49588	49595	0 %	75 %	0 %	25 %	126464968
126	NC_009033	CCAT	2	8	49609	49616	25 %	25 %	0 %	50 %	126464968
127	NC_009033	ATCC	2	8	50532	50539	25 %	25 %	0 %	50 %	126464968
128	NC_009033	ATAA	2	8	50751	50758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009033	TGAA	2	8	50901	50908	50 %	25 %	25 %	0 %	126464969
130	NC_009033	TCCA	2	8	51090	51097	25 %	25 %	0 %	50 %	126464969
131	NC_009033	CCAC	2	8	51606	51613	25 %	0 %	0 %	75 %	126464969
132	NC_009033	CTAT	2	8	52021	52028	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009033	TAAA	2	8	52866	52873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009033	TTTA	2	8	54112	54119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009033	TTAT	2	8	54279	54286	25 %	75 %	0 %	0 %	126464973
136	NC_009033	TTAG	2	8	55076	55083	25 %	50 %	25 %	0 %	126464973
137	NC_009033	TATT	2	8	55595	55602	25 %	75 %	0 %	0 %	126464973
138	NC_009033	TTAT	2	8	55694	55701	25 %	75 %	0 %	0 %	126464973
139	NC_009033	CCAT	2	8	56081	56088	25 %	25 %	0 %	50 %	126464974
140	NC_009033	GTAA	2	8	56437	56444	50 %	25 %	25 %	0 %	126464975
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142	NC_009033	AGCA	2	8	56622	56629	50 %	0 %	25 %	25 %	126464975
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