MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 7840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009012	AATG	2	8	932	939	50 %	25 %	25 %	0 %	125972526
2	NC_009012	TGGA	2	8	2014	2021	25 %	25 %	50 %	0 %	125972527
3	NC_009012	TTTA	2	8	2475	2482	25 %	75 %	0 %	0 %	125972527
4	NC_009012	GATG	2	8	2551	2558	25 %	25 %	50 %	0 %	125972527
5	NC_009012	TGGT	2	8	3301	3308	0 %	50 %	50 %	0 %	125972528
6	NC_009012	AAAT	2	8	3528	3535	75 %	25 %	0 %	0 %	125972528
7	NC_009012	ATTG	2	8	3985	3992	25 %	50 %	25 %	0 %	125972529
8	NC_009012	GGGA	2	8	4509	4516	25 %	0 %	75 %	0 %	125972529
9	NC_009012	GGGA	2	8	4712	4719	25 %	0 %	75 %	0 %	125972529
10	NC_009012	GAAG	2	8	4808	4815	50 %	0 %	50 %	0 %	125972529
11	NC_009012	CGGG	2	8	5315	5322	0 %	0 %	75 %	25 %	125972529
12	NC_009012	AAAC	2	8	5496	5503	75 %	0 %	0 %	25 %	125972529
13	NC_009012	ACCA	2	8	5914	5921	50 %	0 %	0 %	50 %	125972529
14	NC_009012	CGGA	2	8	5945	5952	25 %	0 %	50 %	25 %	125972529
15	NC_009012	GAAA	2	8	6147	6154	75 %	0 %	25 %	0 %	125972529
16	NC_009012	TACA	2	8	7458	7465	50 %	25 %	0 %	25 %	125972529
17	NC_009012	GGAA	2	8	7504	7511	50 %	0 %	50 %	0 %	125972529
18	NC_009012	GACA	2	8	7528	7535	50 %	0 %	25 %	25 %	125972529
19	NC_009012	GACG	2	8	7564	7571	25 %	0 %	50 %	25 %	125972529
20	NC_009012	GAAA	2	8	8013	8020	75 %	0 %	25 %	0 %	125972529
21	NC_009012	CGGA	2	8	8381	8388	25 %	0 %	50 %	25 %	125972529
22	NC_009012	GGTA	2	8	8446	8453	25 %	25 %	50 %	0 %	125972529
23	NC_009012	GATA	2	8	9322	9329	50 %	25 %	25 %	0 %	125972529
24	NC_009012	CAAG	2	8	9639	9646	50 %	0 %	25 %	25 %	125972529
25	NC_009012	TAAG	2	8	9696	9703	50 %	25 %	25 %	0 %	125972529
26	NC_009012	TAAT	2	8	9709	9716	50 %	50 %	0 %	0 %	125972530
27	NC_009012	AAAT	2	8	9870	9877	75 %	25 %	0 %	0 %	125972530
28	NC_009012	GGAA	2	8	10838	10845	50 %	0 %	50 %	0 %	125972531
29	NC_009012	GAAA	2	8	11613	11620	75 %	0 %	25 %	0 %	125972532
30	NC_009012	AGGC	2	8	11720	11727	25 %	0 %	50 %	25 %	125972532
31	NC_009012	ATTG	2	8	12666	12673	25 %	50 %	25 %	0 %	125972534
32	NC_009012	GCAA	2	8	12719	12726	50 %	0 %	25 %	25 %	125972534
33	NC_009012	GGAA	2	8	13175	13182	50 %	0 %	50 %	0 %	125972534
34	NC_009012	TACA	2	8	13268	13275	50 %	25 %	0 %	25 %	125972534
35	NC_009012	TACA	2	8	13298	13305	50 %	25 %	0 %	25 %	125972534
36	NC_009012	CAGG	2	8	13314	13321	25 %	0 %	50 %	25 %	125972534
37	NC_009012	GAAG	2	8	13474	13481	50 %	0 %	50 %	0 %	125972534
38	NC_009012	GAAT	2	8	13664	13671	50 %	25 %	25 %	0 %	125972534
39	NC_009012	GGAA	2	8	14312	14319	50 %	0 %	50 %	0 %	125972534
40	NC_009012	ACCA	2	8	14580	14587	50 %	0 %	0 %	50 %	125972534
41	NC_009012	CGGA	2	8	14611	14618	25 %	0 %	50 %	25 %	125972534
42	NC_009012	GGCT	2	8	14895	14902	0 %	25 %	50 %	25 %	125972534
43	NC_009012	TGGA	2	8	15244	15251	25 %	25 %	50 %	0 %	125972534
44	NC_009012	TACA	2	8	16124	16131	50 %	25 %	0 %	25 %	125972534
45	NC_009012	GGAA	2	8	16170	16177	50 %	0 %	50 %	0 %	125972534
46	NC_009012	GACA	2	8	16194	16201	50 %	0 %	25 %	25 %	125972534
47	NC_009012	CAAC	2	8	16408	16415	50 %	0 %	0 %	50 %	125972534
48	NC_009012	GAAG	2	8	16733	16740	50 %	0 %	50 %	0 %	125972534
49	NC_009012	GATT	2	8	16906	16913	25 %	50 %	25 %	0 %	125972534
50	NC_009012	AAAG	2	8	17696	17703	75 %	0 %	25 %	0 %	125972534
51	NC_009012	TGGC	2	8	17953	17960	0 %	25 %	50 %	25 %	125972534
52	NC_009012	TAGA	2	8	18203	18210	50 %	25 %	25 %	0 %	125972535
53	NC_009012	TTTA	2	8	18227	18234	25 %	75 %	0 %	0 %	125972535
54	NC_009012	GACA	2	8	20998	21005	50 %	0 %	25 %	25 %	125972540
55	NC_009012	GAAA	2	8	21881	21888	75 %	0 %	25 %	0 %	125972540
56	NC_009012	TCTT	2	8	22093	22100	0 %	75 %	0 %	25 %	125972540
57	NC_009012	TGAA	2	8	23042	23049	50 %	25 %	25 %	0 %	125972541
58	NC_009012	CATA	2	8	23075	23082	50 %	25 %	0 %	25 %	125972541
59	NC_009012	CAAG	2	8	23332	23339	50 %	0 %	25 %	25 %	125972541
60	NC_009012	TTGG	2	8	24287	24294	0 %	50 %	50 %	0 %	125972542
61	NC_009012	GGCA	2	8	25000	25007	25 %	0 %	50 %	25 %	125972542
62	NC_009012	ATTT	2	8	25501	25508	25 %	75 %	0 %	0 %	125972542
63	NC_009012	ATTG	2	8	25519	25526	25 %	50 %	25 %	0 %	125972542
64	NC_009012	ATGA	2	8	25598	25605	50 %	25 %	25 %	0 %	125972542
65	NC_009012	TAAT	2	8	26379	26386	50 %	50 %	0 %	0 %	125972544
66	NC_009012	ACTG	2	8	26455	26462	25 %	25 %	25 %	25 %	125972544
67	NC_009012	AAAT	2	8	26820	26827	75 %	25 %	0 %	0 %	125972545
68	NC_009012	AAGG	2	8	27097	27104	50 %	0 %	50 %	0 %	125972545
69	NC_009012	GCGG	2	8	27243	27250	0 %	0 %	75 %	25 %	125972545
70	NC_009012	CATA	2	8	27334	27341	50 %	25 %	0 %	25 %	125972545
71	NC_009012	CAAT	2	8	27485	27492	50 %	25 %	0 %	25 %	125972545
72	NC_009012	GGAG	2	8	27613	27620	25 %	0 %	75 %	0 %	125972545
73	NC_009012	TATT	2	8	27834	27841	25 %	75 %	0 %	0 %	125972546
74	NC_009012	AATA	2	8	28457	28464	75 %	25 %	0 %	0 %	125972546
75	NC_009012	TTTA	2	8	29263	29270	25 %	75 %	0 %	0 %	125972547
76	NC_009012	GGAA	2	8	29623	29630	50 %	0 %	50 %	0 %	125972547
77	NC_009012	TTGC	2	8	29883	29890	0 %	50 %	25 %	25 %	125972548
78	NC_009012	TCAT	2	8	30238	30245	25 %	50 %	0 %	25 %	125972548
79	NC_009012	GATT	2	8	30379	30386	25 %	50 %	25 %	0 %	125972548
80	NC_009012	GATA	2	8	30417	30424	50 %	25 %	25 %	0 %	125972548
81	NC_009012	TGCC	2	8	30693	30700	0 %	25 %	25 %	50 %	125972549
82	NC_009012	AACA	2	8	31099	31106	75 %	0 %	0 %	25 %	125972549
83	NC_009012	GAAA	2	8	31131	31138	75 %	0 %	25 %	0 %	125972549
84	NC_009012	AAGA	2	8	31215	31222	75 %	0 %	25 %	0 %	125972549
85	NC_009012	GTTG	2	8	32395	32402	0 %	50 %	50 %	0 %	125972550
86	NC_009012	AATA	2	8	35017	35024	75 %	25 %	0 %	0 %	125972552
87	NC_009012	TGAT	2	8	35050	35057	25 %	50 %	25 %	0 %	125972552
88	NC_009012	TCCT	2	8	35284	35291	0 %	50 %	0 %	50 %	125972552
89	NC_009012	AAGA	2	8	36077	36084	75 %	0 %	25 %	0 %	125972553
90	NC_009012	GCCT	2	8	36381	36388	0 %	25 %	25 %	50 %	125972553
91	NC_009012	GATG	2	8	36550	36557	25 %	25 %	50 %	0 %	125972553
92	NC_009012	AACG	2	8	36596	36603	50 %	0 %	25 %	25 %	125972553
93	NC_009012	AAAG	2	8	36682	36689	75 %	0 %	25 %	0 %	125972553
94	NC_009012	GGAT	2	8	37020	37027	25 %	25 %	50 %	0 %	125972554
95	NC_009012	TGTT	2	8	37183	37190	0 %	75 %	25 %	0 %	125972554
96	NC_009012	TGTT	2	8	37375	37382	0 %	75 %	25 %	0 %	125972554
97	NC_009012	AGAA	2	8	37768	37775	75 %	0 %	25 %	0 %	125972555
98	NC_009012	TGTC	2	8	37843	37850	0 %	50 %	25 %	25 %	125972555
99	NC_009012	AACA	2	8	37944	37951	75 %	0 %	0 %	25 %	125972555
100	NC_009012	ATTG	2	8	38385	38392	25 %	50 %	25 %	0 %	125972556
101	NC_009012	CATT	2	8	38429	38436	25 %	50 %	0 %	25 %	125972556
102	NC_009012	ACGG	2	8	39056	39063	25 %	0 %	50 %	25 %	125972556
103	NC_009012	TGTA	2	8	39197	39204	25 %	50 %	25 %	0 %	125972556
104	NC_009012	AATC	2	8	39692	39699	50 %	25 %	0 %	25 %	125972556
105	NC_009012	TTTG	2	8	39708	39715	0 %	75 %	25 %	0 %	125972556
106	NC_009012	CATA	2	8	39815	39822	50 %	25 %	0 %	25 %	125972556
107	NC_009012	ACAA	2	8	40856	40863	75 %	0 %	0 %	25 %	125972557
108	NC_009012	TAAT	2	8	40872	40879	50 %	50 %	0 %	0 %	125972557
109	NC_009012	TTGG	2	8	42116	42123	0 %	50 %	50 %	0 %	125972557
110	NC_009012	CATG	2	8	42355	42362	25 %	25 %	25 %	25 %	125972557
111	NC_009012	GGAA	2	8	42494	42501	50 %	0 %	50 %	0 %	125972557
112	NC_009012	ATAA	2	8	43113	43120	75 %	25 %	0 %	0 %	125972557
113	NC_009012	GCAG	2	8	43528	43535	25 %	0 %	50 %	25 %	125972558
114	NC_009012	GCTT	2	8	43800	43807	0 %	50 %	25 %	25 %	125972558
115	NC_009012	AGAT	2	8	44030	44037	50 %	25 %	25 %	0 %	125972559
116	NC_009012	TGCC	2	8	44073	44080	0 %	25 %	25 %	50 %	125972559
117	NC_009012	AGAA	2	8	44252	44259	75 %	0 %	25 %	0 %	125972559
118	NC_009012	CAAC	2	8	44690	44697	50 %	0 %	0 %	50 %	125972559
119	NC_009012	AGGG	2	8	46619	46626	25 %	0 %	75 %	0 %	125972561
120	NC_009012	CATA	2	8	46931	46938	50 %	25 %	0 %	25 %	125972561
121	NC_009012	GATG	2	8	47037	47044	25 %	25 %	50 %	0 %	125972562
122	NC_009012	TGTT	2	8	47120	47127	0 %	75 %	25 %	0 %	125972562
123	NC_009012	ATTA	2	8	47383	47390	50 %	50 %	0 %	0 %	125972563
124	NC_009012	GTAA	2	8	47588	47595	50 %	25 %	25 %	0 %	125972563
125	NC_009012	ACCG	2	8	47675	47682	25 %	0 %	25 %	50 %	125972563
126	NC_009012	GAAA	2	8	48694	48701	75 %	0 %	25 %	0 %	125972563
127	NC_009012	AAAT	2	8	48867	48874	75 %	25 %	0 %	0 %	125972563
128	NC_009012	GGTT	2	8	49585	49592	0 %	50 %	50 %	0 %	125972564
129	NC_009012	TCTT	2	8	51886	51893	0 %	75 %	0 %	25 %	125972564
130	NC_009012	ATTA	2	8	52197	52204	50 %	50 %	0 %	0 %	125972565
131	NC_009012	TGAA	2	8	52791	52798	50 %	25 %	25 %	0 %	125972566
132	NC_009012	ATTG	2	8	53113	53120	25 %	50 %	25 %	0 %	125972566
133	NC_009012	GAAC	2	8	53449	53456	50 %	0 %	25 %	25 %	125972566
134	NC_009012	ATAA	2	8	53729	53736	75 %	25 %	0 %	0 %	125972566
135	NC_009012	AATT	2	8	53808	53815	50 %	50 %	0 %	0 %	125972566
136	NC_009012	TGAA	2	8	53838	53845	50 %	25 %	25 %	0 %	125972566
137	NC_009012	TCCT	2	8	55210	55217	0 %	50 %	0 %	50 %	125972567
138	NC_009012	AAAG	2	8	55485	55492	75 %	0 %	25 %	0 %	125972567
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