MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 8376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009012	TA	3	6	60	65	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009012	CA	3	6	1925	1930	50 %	0 %	0 %	50 %	125972527
3	NC_009012	AT	3	6	2038	2043	50 %	50 %	0 %	0 %	125972527
4	NC_009012	GA	3	6	2091	2096	50 %	0 %	50 %	0 %	125972527
5	NC_009012	AT	3	6	2678	2683	50 %	50 %	0 %	0 %	125972528
6	NC_009012	AC	3	6	2732	2737	50 %	0 %	0 %	50 %	125972528
7	NC_009012	AT	3	6	3347	3352	50 %	50 %	0 %	0 %	125972528
8	NC_009012	AT	3	6	3510	3515	50 %	50 %	0 %	0 %	125972528
9	NC_009012	AT	3	6	3550	3555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009012	AT	3	6	3607	3612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009012	TA	3	6	3742	3747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009012	GT	3	6	4568	4573	0 %	50 %	50 %	0 %	125972529
13	NC_009012	GT	3	6	5072	5077	0 %	50 %	50 %	0 %	125972529
14	NC_009012	CA	3	6	5580	5585	50 %	0 %	0 %	50 %	125972529
15	NC_009012	AT	3	6	6208	6213	50 %	50 %	0 %	0 %	125972529
16	NC_009012	AT	3	6	6277	6282	50 %	50 %	0 %	0 %	125972529
17	NC_009012	GA	3	6	6490	6495	50 %	0 %	50 %	0 %	125972529
18	NC_009012	AG	3	6	6847	6852	50 %	0 %	50 %	0 %	125972529
19	NC_009012	AT	3	6	7097	7102	50 %	50 %	0 %	0 %	125972529
20	NC_009012	GA	3	6	7115	7120	50 %	0 %	50 %	0 %	125972529
21	NC_009012	AG	4	8	8149	8156	50 %	0 %	50 %	0 %	125972529
22	NC_009012	AT	3	6	8391	8396	50 %	50 %	0 %	0 %	125972529
23	NC_009012	AT	3	6	8402	8407	50 %	50 %	0 %	0 %	125972529
24	NC_009012	AT	3	6	8669	8674	50 %	50 %	0 %	0 %	125972529
25	NC_009012	TA	3	6	8828	8833	50 %	50 %	0 %	0 %	125972529
26	NC_009012	AG	3	6	8886	8891	50 %	0 %	50 %	0 %	125972529
27	NC_009012	AT	3	6	9046	9051	50 %	50 %	0 %	0 %	125972529
28	NC_009012	TA	3	6	9334	9339	50 %	50 %	0 %	0 %	125972529
29	NC_009012	TA	3	6	9389	9394	50 %	50 %	0 %	0 %	125972529
30	NC_009012	TA	3	6	9518	9523	50 %	50 %	0 %	0 %	125972529
31	NC_009012	AT	6	12	10234	10245	50 %	50 %	0 %	0 %	125972530
32	NC_009012	AT	3	6	10314	10319	50 %	50 %	0 %	0 %	125972530
33	NC_009012	AT	3	6	10323	10328	50 %	50 %	0 %	0 %	125972530
34	NC_009012	AT	3	6	10410	10415	50 %	50 %	0 %	0 %	125972530
35	NC_009012	TG	3	6	11277	11282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009012	AT	3	6	11373	11378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009012	TA	3	6	11977	11982	50 %	50 %	0 %	0 %	125972532
38	NC_009012	CG	3	6	12032	12037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009012	TA	3	6	12308	12313	50 %	50 %	0 %	0 %	125972533
40	NC_009012	GA	3	6	13013	13018	50 %	0 %	50 %	0 %	125972534
41	NC_009012	GT	3	6	13234	13239	0 %	50 %	50 %	0 %	125972534
42	NC_009012	AT	3	6	14787	14792	50 %	50 %	0 %	0 %	125972534
43	NC_009012	AT	3	6	14874	14879	50 %	50 %	0 %	0 %	125972534
44	NC_009012	TC	3	6	15337	15342	0 %	50 %	0 %	50 %	125972534
45	NC_009012	AT	3	6	15763	15768	50 %	50 %	0 %	0 %	125972534
46	NC_009012	AG	3	6	16817	16822	50 %	0 %	50 %	0 %	125972534
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48	NC_009012	AT	3	6	17057	17062	50 %	50 %	0 %	0 %	125972534
49	NC_009012	AT	4	8	17068	17075	50 %	50 %	0 %	0 %	125972534
50	NC_009012	AT	4	8	17126	17133	50 %	50 %	0 %	0 %	125972534
51	NC_009012	AT	3	6	17335	17340	50 %	50 %	0 %	0 %	125972534
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54	NC_009012	AT	3	6	18339	18344	50 %	50 %	0 %	0 %	125972535
55	NC_009012	TA	3	6	18370	18375	50 %	50 %	0 %	0 %	125972535
56	NC_009012	AT	3	6	18967	18972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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62	NC_009012	AT	3	6	20907	20912	50 %	50 %	0 %	0 %	125972540
63	NC_009012	AT	3	6	20943	20948	50 %	50 %	0 %	0 %	125972540
64	NC_009012	TA	3	6	21925	21930	50 %	50 %	0 %	0 %	125972540
65	NC_009012	GA	3	6	22262	22267	50 %	0 %	50 %	0 %	125972540
66	NC_009012	TA	3	6	22393	22398	50 %	50 %	0 %	0 %	125972540
67	NC_009012	AT	3	6	22412	22417	50 %	50 %	0 %	0 %	125972540
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70	NC_009012	TA	4	8	22839	22846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009012	TA	3	6	22924	22929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009012	AT	3	6	22954	22959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91	NC_009012	GA	3	6	34579	34584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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113	NC_009012	AT	3	6	49364	49369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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118	NC_009012	TA	3	6	52577	52582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009012	AT	3	6	54018	54023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009012	AT	3	6	54043	54048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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