MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 2028

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009012	TA	3	6	60	65	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009012	AT	3	6	3550	3555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009012	AT	3	6	3607	3612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009012	TA	3	6	3742	3747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009012	TG	3	6	11277	11282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009012	AT	3	6	11373	11378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009012	CG	3	6	12032	12037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009012	AT	3	6	18967	18972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009012	GT	3	6	19291	19296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009012	AT	3	6	19997	20002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009012	TA	3	6	20012	20017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009012	AT	3	6	20271	20276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009012	TA	3	6	22750	22755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009012	AT	4	8	22827	22834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009012	TA	4	8	22839	22846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009012	TA	3	6	22924	22929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009012	AT	3	6	22954	22959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009012	CG	3	6	23856	23861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009012	TA	3	6	24019	24024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009012	AG	3	6	33017	33022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009012	GA	3	6	33041	33046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009012	AT	3	6	33206	33211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009012	AT	4	8	33267	33274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009012	AT	3	6	33746	33751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009012	TA	3	6	34159	34164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009012	AT	3	6	34468	34473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009012	GA	3	6	34579	34584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009012	TC	3	6	35685	35690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009012	AT	3	6	36012	36017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009012	AT	3	6	36783	36788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009012	AT	3	6	49364	49369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009012	TA	3	6	52577	52582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009012	AT	3	6	54018	54023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009012	AT	3	6	54043	54048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009012	AT	4	8	54123	54130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009012	TA	3	6	54338	54343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009012	AT	3	6	56707	56712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009012	TA	3	6	58452	58457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009012	AT	4	8	58464	58471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009012	TA	3	6	58580	58585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009012	GT	3	6	62307	62312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009012	AT	3	6	64151	64156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009012	TA	3	6	64982	64987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009012	AG	3	6	65154	65159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009012	AT	3	6	67627	67632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009012	AT	3	6	67692	67697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009012	TA	3	6	75036	75041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009012	GT	3	6	89356	89361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009012	AT	3	6	92463	92468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009012	AT	3	6	92475	92480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009012	GA	3	6	92551	92556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009012	GT	3	6	93901	93906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009012	CT	3	6	95865	95870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009012	TA	3	6	95902	95907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009012	GT	4	8	96025	96032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009012	TA	3	6	98456	98461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009012	GT	3	6	99961	99966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009012	TA	3	6	105834	105839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009012	TA	3	6	107609	107614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009012	AC	3	6	107653	107658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009012	TA	3	6	107689	107694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009012	AT	3	6	109068	109073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009012	AT	3	6	109151	109156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009012	AT	3	6	110006	110011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009012	TA	3	6	110065	110070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009012	AG	3	6	111277	111282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009012	TA	3	6	112710	112715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009012	AG	3	6	112813	112818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009012	AT	3	6	115731	115736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009012	TA	3	6	115784	115789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009012	TA	3	6	118319	118324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009012	TA	5	10	119278	119287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009012	AT	3	6	120559	120564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009012	TA	3	6	120572	120577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009012	AT	3	6	126950	126955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009012	AT	3	6	127023	127028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009012	AT	3	6	127042	127047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009012	TA	3	6	131019	131024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009012	TA	4	8	132100	132107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009012	AT	3	6	134305	134310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009012	AT	4	8	134344	134351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009012	AT	3	6	135725	135730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009012	TA	3	6	135988	135993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009012	AT	4	8	140560	140567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009012	AT	3	6	140588	140593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_009012	AT	3	6	141864	141869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009012	TA	3	6	143792	143797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009012	TA	3	6	152125	152130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009012	AT	3	6	154432	154437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009012	AT	3	6	156436	156441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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96	NC_009012	AT	3	6	157706	157711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009012	AT	3	6	159319	159324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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99	NC_009012	TA	3	6	175009	175014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009012	GA	3	6	176428	176433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_009012	TA	4	8	177308	177315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009012	AT	3	6	178926	178931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009012	AT	3	6	179077	179082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009012	AT	4	8	184105	184112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_009012	AT	3	6	189383	189388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009012	AT	3	6	189755	189760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009012	TA	6	12	191303	191314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009012	AT	4	8	194940	194947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009012	GT	3	6	194948	194953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009012	TA	3	6	195035	195040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009012	TA	3	6	195060	195065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009012	TA	3	6	204463	204468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009012	TA	4	8	204487	204494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009012	AT	3	6	204498	204503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009012	TG	3	6	204543	204548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009012	TA	3	6	209723	209728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009012	TA	3	6	211789	211794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009012	AT	3	6	211827	211832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009012	AT	3	6	216789	216794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009012	AT	3	6	216919	216924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009012	TA	3	6	228514	228519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009012	TA	3	6	230724	230729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_009012	TA	4	8	256789	256796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009012	AT	3	6	256861	256866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009012	TA	3	6	257989	257994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009012	AT	4	8	258066	258073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009012	TA	3	6	258099	258104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009012	TA	3	6	260033	260038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009012	TA	3	6	260050	260055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009012	AT	3	6	260910	260915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009012	GA	3	6	260987	260992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009012	AG	3	6	261015	261020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009012	TA	3	6	261293	261298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009012	TA	3	6	261317	261322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_009012	AT	3	6	269116	269121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009012	AT	3	6	269155	269160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009012	TA	3	6	269495	269500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009012	AT	3	6	269636	269641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009012	TA	3	6	271100	271105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009012	AT	3	6	273441	273446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_009012	TA	3	6	282106	282111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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