MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus sanguinis SK36 chromosome

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009009	AGATTT	2	12	3239	3250	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009009	ACTAAT	2	12	21059	21070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009009	AAAAAG	2	12	45951	45962	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009009	GAAAAG	2	12	62796	62807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009009	AAAGTA	2	12	70017	70028	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009009	ACTTTT	2	12	85238	85249	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009009	GGAAAT	2	12	122866	122877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009009	ACTAAT	2	12	129045	129056	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009009	TTCGGG	2	12	129984	129995	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009009	TTTTAC	2	12	130623	130634	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009009	TCTTTT	2	12	149921	149932	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009009	CTTTTT	2	12	166447	166458	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009009	AAGATT	2	12	186372	186383	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009009	CTTTGG	2	12	194309	194320	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009009	ATGCTA	2	12	209283	209294	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009009	AAAAAT	2	12	209470	209481	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009009	GGTAAA	2	12	221041	221052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009009	TATAAT	2	12	231198	231209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009009	TGTTTA	2	12	246317	246328	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009009	TTATTT	2	12	271642	271653	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009009	TAAATG	2	12	293500	293511	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009009	TCTTTT	2	12	320564	320575	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_009009	TTGCGA	2	12	429099	429110	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_009009	CTTATC	2	12	452186	452197	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009009	TTAAAA	2	12	503886	503897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009009	AATTAC	2	12	567053	567064	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009009	TAAAAT	2	12	567468	567479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009009	ATTAAT	2	12	631577	631588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009009	TTTTTA	2	12	654306	654317	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009009	AAAGGA	2	12	657198	657209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009009	CTTTTT	2	12	669034	669045	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009009	CTGAAT	2	12	682202	682213	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009009	AGGTGA	2	12	693306	693317	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009009	ATAGAA	2	12	718627	718638	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009009	CAAAAA	2	12	752135	752146	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009009	AAATAG	2	12	797547	797558	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009009	AAAAAG	2	12	833486	833497	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009009	ATTAGA	2	12	863044	863055	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009009	CAGATG	2	12	929077	929088	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009009	ACAAAT	2	12	955707	955718	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009009	CTTTTT	2	12	966214	966225	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009009	AGCTTC	2	12	1007110	1007121	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009009	ATATGT	2	12	1032852	1032863	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009009	CAAACT	2	12	1052669	1052680	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009009	TCTAAA	2	12	1078940	1078951	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009009	AAGGAA	2	12	1089883	1089894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009009	TTTCCT	2	12	1160377	1160388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009009	TAGTTT	2	12	1205505	1205516	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009009	TTTTCT	2	12	1205520	1205531	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009009	CCCGAA	2	12	1247233	1247244	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009009	TTCCGT	2	12	1280397	1280408	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009009	CGTTTC	2	12	1280760	1280771	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009009	TAAAAA	2	12	1294058	1294069	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009009	TGCCTT	2	12	1342484	1342495	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009009	CCACTT	2	12	1356579	1356590	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009009	TACAAG	2	12	1364226	1364237	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009009	CAAGAC	2	12	1366754	1366765	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009009	CTTATT	2	12	1386104	1386115	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_009009	ATAAGA	2	12	1405420	1405431	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009009	ATACCA	2	12	1466056	1466067	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009009	AAGTCA	2	12	1483303	1483314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009009	ACTGAA	2	12	1505087	1505098	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009009	CTTTCT	2	12	1589184	1589195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009009	AAAAGA	2	12	1688133	1688144	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009009	TTTTGA	2	12	1693614	1693625	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009009	TAGAAA	2	12	1714579	1714590	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009009	TTTACA	2	12	1782663	1782674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009009	AAAAAG	2	12	1791426	1791437	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009009	ATTAGT	2	12	1824719	1824730	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009009	AATCTT	2	12	1835927	1835938	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009009	TCCTTC	2	12	1883577	1883588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009009	TTTCTC	2	12	1884246	1884257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009009	TTACTT	2	12	1906563	1906574	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009009	TAAAAA	2	12	1930416	1930427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009009	ATTAGT	2	12	1930779	1930790	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009009	GGACTA	2	12	1948217	1948228	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009009	AAAAAG	2	12	1990205	1990216	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009009	GAAAAA	2	12	2059797	2059808	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009009	TCTTAT	2	12	2097579	2097590	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009009	ATTTTT	2	12	2101823	2101834	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009009	GCTTCT	2	12	2206225	2206236	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009009	TAAAAA	2	12	2231399	2231410	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009009	ATAAGA	2	12	2343778	2343789	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009009	GAAAAA	2	12	2346982	2346993	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.