MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus sanguinis SK36 chromosome

Total Repeats: 1843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009009	TCAAC	2	10	1930	1939	40 %	20 %	0 %	40 %	125716889
2	NC_009009	TGATT	2	10	5917	5926	20 %	60 %	20 %	0 %	125716894
3	NC_009009	TCAAT	2	10	6826	6835	40 %	40 %	0 %	20 %	125716894
4	NC_009009	AAAGG	2	10	10039	10048	60 %	0 %	40 %	0 %	125716897
5	NC_009009	GGAAA	2	10	11966	11975	60 %	0 %	40 %	0 %	125716899
6	NC_009009	GTACT	2	10	12579	12588	20 %	40 %	20 %	20 %	125716899
7	NC_009009	GATTA	2	10	13087	13096	40 %	40 %	20 %	0 %	125716900
8	NC_009009	ATTTT	2	10	13433	13442	20 %	80 %	0 %	0 %	125716901
9	NC_009009	CAAAA	2	10	15806	15815	80 %	0 %	0 %	20 %	125716902
10	NC_009009	TTGGA	2	10	15997	16006	20 %	40 %	40 %	0 %	125716902
11	NC_009009	TCGTG	2	10	17455	17464	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009009	GGGAG	2	10	18710	18719	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009009	AGGGA	2	10	20919	20928	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009009	AGGAC	2	10	21182	21191	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009009	CTTAT	2	10	23017	23026	20 %	60 %	0 %	20 %	125716903
16	NC_009009	ATGCT	2	10	23375	23384	20 %	40 %	20 %	20 %	125716903
17	NC_009009	GCTTT	2	10	24129	24138	0 %	60 %	20 %	20 %	125716904
18	NC_009009	CTGAA	2	10	24945	24954	40 %	20 %	20 %	20 %	125716905
19	NC_009009	GATTG	2	10	25775	25784	20 %	40 %	40 %	0 %	125716906
20	NC_009009	AAAAG	2	10	28908	28917	80 %	0 %	20 %	0 %	125716909
21	NC_009009	ATGCT	2	10	30890	30899	20 %	40 %	20 %	20 %	125716911
22	NC_009009	AACGG	2	10	31144	31153	40 %	0 %	40 %	20 %	125716911
23	NC_009009	TTGAT	2	10	31729	31738	20 %	60 %	20 %	0 %	125716912
24	NC_009009	GGAAA	2	10	31903	31912	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009009	CAGCT	2	10	33099	33108	20 %	20 %	20 %	40 %	125716914
26	NC_009009	TCTGC	2	10	35030	35039	0 %	40 %	20 %	40 %	125716914
27	NC_009009	CGCTG	2	10	37118	37127	0 %	20 %	40 %	40 %	125716915
28	NC_009009	GTCTG	2	10	37496	37505	0 %	40 %	40 %	20 %	125716915
29	NC_009009	AAATG	2	10	37508	37517	60 %	20 %	20 %	0 %	125716915
30	NC_009009	ATGAT	2	10	39970	39979	40 %	40 %	20 %	0 %	125716918
31	NC_009009	TAAAT	2	10	40271	40280	60 %	40 %	0 %	0 %	125716918
32	NC_009009	AGACA	2	10	40499	40508	60 %	0 %	20 %	20 %	125716919
33	NC_009009	CTGGG	2	10	40542	40551	0 %	20 %	60 %	20 %	125716919
34	NC_009009	CTTGG	2	10	42788	42797	0 %	40 %	40 %	20 %	125716920
35	NC_009009	ATAAG	2	10	43881	43890	60 %	20 %	20 %	0 %	125716920
36	NC_009009	GCGAT	2	10	46636	46645	20 %	20 %	40 %	20 %	125716923
37	NC_009009	GAAGC	2	10	47447	47456	40 %	0 %	40 %	20 %	125716923
38	NC_009009	GGGGA	2	10	47519	47528	20 %	0 %	80 %	0 %	125716923
39	NC_009009	ACAAG	2	10	48311	48320	60 %	0 %	20 %	20 %	125716925
40	NC_009009	CTTTT	2	10	49393	49402	0 %	80 %	0 %	20 %	125716927
41	NC_009009	TTATT	2	10	49594	49603	20 %	80 %	0 %	0 %	125716927
42	NC_009009	ATTGA	2	10	49676	49685	40 %	40 %	20 %	0 %	125716927
43	NC_009009	CAATA	2	10	50098	50107	60 %	20 %	0 %	20 %	125716927
44	NC_009009	GATTT	2	10	52494	52503	20 %	60 %	20 %	0 %	125716930
45	NC_009009	CTTGC	2	10	52581	52590	0 %	40 %	20 %	40 %	125716930
46	NC_009009	TTGGC	2	10	54311	54320	0 %	40 %	40 %	20 %	125716932
47	NC_009009	GTTTT	2	10	54359	54368	0 %	80 %	20 %	0 %	125716932
48	NC_009009	GCTGG	2	10	55064	55073	0 %	20 %	60 %	20 %	125716933
49	NC_009009	GCTCG	2	10	55535	55544	0 %	20 %	40 %	40 %	125716934
50	NC_009009	TCAGC	2	10	56646	56655	20 %	20 %	20 %	40 %	125716935
51	NC_009009	TTTGA	2	10	64130	64139	20 %	60 %	20 %	0 %	125716943
52	NC_009009	CTATC	2	10	64477	64486	20 %	40 %	0 %	40 %	125716943
53	NC_009009	TGGCT	2	10	64786	64795	0 %	40 %	40 %	20 %	125716943
54	NC_009009	GCTAA	2	10	65607	65616	40 %	20 %	20 %	20 %	125716944
55	NC_009009	TAAGA	2	10	67043	67052	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009009	TTAAC	2	10	67121	67130	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009009	CTTTC	2	10	68753	68762	0 %	60 %	0 %	40 %	125716948
58	NC_009009	AGCCT	2	10	69022	69031	20 %	20 %	20 %	40 %	125716948
59	NC_009009	TGGCT	2	10	69116	69125	0 %	40 %	40 %	20 %	125716948
60	NC_009009	AATTG	2	10	70180	70189	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009009	ATGGT	2	10	71014	71023	20 %	40 %	40 %	0 %	125716949
62	NC_009009	GCTTG	2	10	72635	72644	0 %	40 %	40 %	20 %	125716949
63	NC_009009	TGGGC	2	10	73195	73204	0 %	20 %	60 %	20 %	125716950
64	NC_009009	TACTT	2	10	73984	73993	20 %	60 %	0 %	20 %	125716951
65	NC_009009	GGGCT	2	10	74248	74257	0 %	20 %	60 %	20 %	125716951
66	NC_009009	CTATC	2	10	74794	74803	20 %	40 %	0 %	40 %	125716951
67	NC_009009	CGGAC	2	10	75862	75871	20 %	0 %	40 %	40 %	125716952
68	NC_009009	CAAGC	2	10	75944	75953	40 %	0 %	20 %	40 %	125716952
69	NC_009009	CCTAT	2	10	78572	78581	20 %	40 %	0 %	40 %	125716955
70	NC_009009	TCCTT	2	10	79326	79335	0 %	60 %	0 %	40 %	125716956
71	NC_009009	TTTGC	2	10	81547	81556	0 %	60 %	20 %	20 %	125716958
72	NC_009009	TAAAA	2	10	81974	81983	80 %	20 %	0 %	0 %	125716958
73	NC_009009	CTGTC	2	10	84538	84547	0 %	40 %	20 %	40 %	125716962
74	NC_009009	TATTT	2	10	87001	87010	20 %	80 %	0 %	0 %	125716964
75	NC_009009	CACTC	2	10	87797	87806	20 %	20 %	0 %	60 %	125716964
76	NC_009009	AGCAA	2	10	87829	87838	60 %	0 %	20 %	20 %	125716964
77	NC_009009	TAAAA	2	10	91091	91100	80 %	20 %	0 %	0 %	125716969
78	NC_009009	GAAAT	2	10	91174	91183	60 %	20 %	20 %	0 %	125716970
79	NC_009009	ATGGG	2	10	93312	93321	20 %	20 %	60 %	0 %	125716971
80	NC_009009	GTCTC	2	10	94084	94093	0 %	40 %	20 %	40 %	125716971
81	NC_009009	GCAAG	2	10	94171	94180	40 %	0 %	40 %	20 %	125716971
82	NC_009009	CTGGG	2	10	94325	94334	0 %	20 %	60 %	20 %	125716971
83	NC_009009	AGTTT	2	10	95259	95268	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009009	AGTCT	2	10	100204	100213	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009009	AGTCT	2	10	104218	104227	20 %	40 %	20 %	20 %	125716980
86	NC_009009	TCTGC	2	10	104647	104656	0 %	40 %	20 %	40 %	125716980
87	NC_009009	GACAG	2	10	104661	104670	40 %	0 %	40 %	20 %	125716980
88	NC_009009	GGAAT	2	10	105438	105447	40 %	20 %	40 %	0 %	125716981
89	NC_009009	GTCTG	2	10	107194	107203	0 %	40 %	40 %	20 %	125716983
90	NC_009009	GCTTT	2	10	107323	107332	0 %	60 %	20 %	20 %	125716983
91	NC_009009	TTTGG	2	10	111300	111309	0 %	60 %	40 %	0 %	125716990
92	NC_009009	GGTTG	2	10	112392	112401	0 %	40 %	60 %	0 %	125716992
93	NC_009009	AAGGA	2	10	113814	113823	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009009	TGAAT	2	10	115334	115343	40 %	40 %	20 %	0 %	125717000
95	NC_009009	TTAAA	2	10	117273	117282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009009	GGGAT	2	10	117292	117301	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009009	TTTAC	2	10	118548	118557	20 %	60 %	0 %	20 %	125717006
98	NC_009009	ATTTG	2	10	122101	122110	20 %	60 %	20 %	0 %	125717012
99	NC_009009	TCGTG	2	10	125439	125448	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009009	GGGAG	2	10	126695	126704	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009009	AGGGA	2	10	128905	128914	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009009	AGGAC	2	10	129168	129177	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009009	TAATG	2	10	130476	130485	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009009	CTTTT	2	10	130650	130659	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009009	AAAAT	2	10	133400	133409	80 %	20 %	0 %	0 %	125717017
106	NC_009009	TCAGT	2	10	134634	134643	20 %	40 %	20 %	20 %	125717018
107	NC_009009	AGATG	2	10	136454	136463	40 %	20 %	40 %	0 %	125717019
108	NC_009009	TTTTA	2	10	139657	139666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009009	AAAAG	2	10	140322	140331	80 %	0 %	20 %	0 %	125717025
110	NC_009009	AGAAA	2	10	140548	140557	80 %	0 %	20 %	0 %	125717025
111	NC_009009	GACTG	2	10	140926	140935	20 %	20 %	40 %	20 %	125717025
112	NC_009009	AAAGA	2	10	141242	141251	80 %	0 %	20 %	0 %	125717025
113	NC_009009	ATCGT	2	10	143007	143016	20 %	40 %	20 %	20 %	125717026
114	NC_009009	ATCAT	2	10	145486	145495	40 %	40 %	0 %	20 %	125717029
115	NC_009009	TGATT	2	10	146952	146961	20 %	60 %	20 %	0 %	125717030
116	NC_009009	CGGAA	2	10	148068	148077	40 %	0 %	40 %	20 %	125717030
117	NC_009009	CTTTG	2	10	148889	148898	0 %	60 %	20 %	20 %	125717031
118	NC_009009	CCTTT	3	15	148963	148977	0 %	60 %	0 %	40 %	125717031
119	NC_009009	AGTTT	2	10	149154	149163	20 %	60 %	20 %	0 %	125717031
120	NC_009009	CAAGC	2	10	149198	149207	40 %	0 %	20 %	40 %	125717031
121	NC_009009	TTTTC	2	10	149571	149580	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009009	ATTGA	2	10	153447	153456	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009009	TTTGC	2	10	153471	153480	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009009	TAAAT	2	10	155802	155811	60 %	40 %	0 %	0 %	125717037
125	NC_009009	CTAGA	2	10	158624	158633	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009009	AGGAT	2	10	158863	158872	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009009	GCTAA	2	10	160590	160599	40 %	20 %	20 %	20 %	125717039
128	NC_009009	TTATT	2	10	165248	165257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009009	AATAA	2	10	165403	165412	80 %	20 %	0 %	0 %	125717045
130	NC_009009	TTCCT	2	10	166671	166680	0 %	60 %	0 %	40 %	125717046
131	NC_009009	GAGAA	2	10	167192	167201	60 %	0 %	40 %	0 %	125717046
132	NC_009009	GACTG	2	10	167624	167633	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009009	GATTG	2	10	174059	174068	20 %	40 %	40 %	0 %	125717053
134	NC_009009	TAATT	2	10	174755	174764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009009	AACCA	2	10	175811	175820	60 %	0 %	0 %	40 %	125717055
136	NC_009009	ACATG	2	10	177213	177222	40 %	20 %	20 %	20 %	125717055
137	NC_009009	CGTGA	2	10	177587	177596	20 %	20 %	40 %	20 %	125717055
138	NC_009009	TGTCT	2	10	181667	181676	0 %	60 %	20 %	20 %	125717056
139	NC_009009	AGTTA	2	10	182767	182776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009009	ATGCC	2	10	185475	185484	20 %	20 %	20 %	40 %	125717060
141	NC_009009	AAAAC	2	10	186329	186338	80 %	0 %	0 %	20 %	125717060
142	NC_009009	AAGTT	2	10	188228	188237	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009009	GCTCA	2	10	188749	188758	20 %	20 %	20 %	40 %	125717063
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145	NC_009009	GCGAT	2	10	196981	196990	20 %	20 %	40 %	20 %	125717074
146	NC_009009	AGTCA	2	10	198371	198380	40 %	20 %	20 %	20 %	125717075
147	NC_009009	TATGA	2	10	199163	199172	40 %	40 %	20 %	0 %	125717077
148	NC_009009	GCAAG	2	10	199886	199895	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_009009	AGGAA	2	10	201096	201105	60 %	0 %	40 %	0 %	125717079
150	NC_009009	TTTGG	2	10	202133	202142	0 %	60 %	40 %	0 %	125717080
151	NC_009009	TCAGT	2	10	203425	203434	20 %	40 %	20 %	20 %	125717082
152	NC_009009	CTATA	2	10	204143	204152	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_009009	GCTTA	2	10	204448	204457	20 %	40 %	20 %	20 %	125717084
154	NC_009009	AGTGG	2	10	205157	205166	20 %	20 %	60 %	0 %	125717086
155	NC_009009	TGGTC	2	10	208106	208115	0 %	40 %	40 %	20 %	125717088
156	NC_009009	AGCTA	2	10	208159	208168	40 %	20 %	20 %	20 %	125717088
157	NC_009009	CTATA	2	10	210288	210297	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_009009	TAATA	2	10	210976	210985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_009009	CTCAG	2	10	214080	214089	20 %	20 %	20 %	40 %	125717096
160	NC_009009	TGGTG	2	10	214581	214590	0 %	40 %	60 %	0 %	125717096
161	NC_009009	AATCA	2	10	217286	217295	60 %	20 %	0 %	20 %	125717099
162	NC_009009	AAAAT	2	10	218654	218663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009009	GCTCA	2	10	222401	222410	20 %	20 %	20 %	40 %	125717104
164	NC_009009	TAAAA	2	10	223193	223202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_009009	TAAGG	2	10	224700	224709	40 %	20 %	40 %	0 %	125717107
166	NC_009009	ATAGT	2	10	227111	227120	40 %	40 %	20 %	0 %	125717108
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168	NC_009009	TTGTG	2	10	227960	227969	0 %	60 %	40 %	0 %	125717110
169	NC_009009	TTCTC	2	10	228284	228293	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
170	NC_009009	ATTTC	2	10	229022	229031	20 %	60 %	0 %	20 %	125717111
171	NC_009009	ATAGT	2	10	229048	229057	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_009009	AAAAG	2	10	229141	229150	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_009009	CTTTA	2	10	229370	229379	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_009009	ATATT	2	10	229411	229420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_009009	GCTAG	2	10	231710	231719	20 %	20 %	40 %	20 %	125717113
176	NC_009009	AAATC	2	10	232019	232028	60 %	20 %	0 %	20 %	125717113
177	NC_009009	AGAAA	2	10	232135	232144	80 %	0 %	20 %	0 %	125717113
178	NC_009009	TTGTT	2	10	232210	232219	0 %	80 %	20 %	0 %	125717113
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185	NC_009009	TTATA	2	10	238357	238366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_009009	GGAAA	2	10	238545	238554	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
188	NC_009009	AGGAG	2	10	238615	238624	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
189	NC_009009	AGAAA	2	10	238987	238996	80 %	0 %	20 %	0 %	125717120
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191	NC_009009	TTATA	2	10	239732	239741	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_009009	CAGGT	2	10	242438	242447	20 %	20 %	40 %	20 %	125717126
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201	NC_009009	TAAAA	2	10	256295	256304	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_009009	TCAAA	2	10	258338	258347	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
203	NC_009009	ATAGA	2	10	258485	258494	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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218	NC_009009	GGCTG	2	10	279229	279238	0 %	20 %	60 %	20 %	125717160
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234	NC_009009	ATGAG	2	10	309193	309202	40 %	20 %	40 %	0 %	125717188
235	NC_009009	ATCGT	2	10	310888	310897	20 %	40 %	20 %	20 %	125717190
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239	NC_009009	TTGGC	2	10	317945	317954	0 %	40 %	40 %	20 %	125717199
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242	NC_009009	CTTTC	2	10	319922	319931	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
243	NC_009009	AAAAG	2	10	320495	320504	80 %	0 %	20 %	0 %	125717201
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250	NC_009009	GATTG	2	10	328595	328604	20 %	40 %	40 %	0 %	125717208
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253	NC_009009	TCCAG	2	10	332233	332242	20 %	20 %	20 %	40 %	125717211
254	NC_009009	CAGCT	2	10	332358	332367	20 %	20 %	20 %	40 %	125717212
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258	NC_009009	TGCGA	2	10	334687	334696	20 %	20 %	40 %	20 %	125717214
259	NC_009009	AAGTA	2	10	337341	337350	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
260	NC_009009	TAAAA	2	10	338895	338904	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_009009	TTTTA	2	10	339385	339394	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_009009	AACAA	2	10	339448	339457	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NC_009009	ATCGG	2	10	340638	340647	20 %	20 %	40 %	20 %	125717219
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266	NC_009009	GACTA	2	10	343508	343517	40 %	20 %	20 %	20 %	125717221
267	NC_009009	TCCGT	2	10	343848	343857	0 %	40 %	20 %	40 %	125717221
268	NC_009009	CGTTC	2	10	344770	344779	0 %	40 %	20 %	40 %	125717222
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