MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus sanguinis SK36 chromosome

Total Repeats: 336

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009009	TCGTG	2	10	17455	17464	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009009	GGGAG	2	10	18710	18719	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009009	AGGGA	2	10	20919	20928	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009009	AGGAC	2	10	21182	21191	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009009	GGAAA	2	10	31903	31912	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009009	TAAGA	2	10	67043	67052	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009009	TTAAC	2	10	67121	67130	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009009	AATTG	2	10	70180	70189	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009009	AGTTT	2	10	95259	95268	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009009	AGTCT	2	10	100204	100213	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009009	AAGGA	2	10	113814	113823	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009009	TTAAA	2	10	117273	117282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009009	GGGAT	2	10	117292	117301	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009009	TCGTG	2	10	125439	125448	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009009	GGGAG	2	10	126695	126704	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009009	AGGGA	2	10	128905	128914	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009009	AGGAC	2	10	129168	129177	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009009	TAATG	2	10	130476	130485	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009009	CTTTT	2	10	130650	130659	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009009	TTTTA	2	10	139657	139666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009009	TTTTC	2	10	149571	149580	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009009	ATTGA	2	10	153447	153456	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009009	TTTGC	2	10	153471	153480	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009009	CTAGA	2	10	158624	158633	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009009	AGGAT	2	10	158863	158872	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009009	TTATT	2	10	165248	165257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009009	GACTG	2	10	167624	167633	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009009	TAATT	2	10	174755	174764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009009	AGTTA	2	10	182767	182776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009009	AAGTT	2	10	188228	188237	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009009	GCAAG	2	10	199886	199895	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009009	CTATA	2	10	204143	204152	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009009	CTATA	2	10	210288	210297	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009009	TAATA	2	10	210976	210985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009009	AAAAT	2	10	218654	218663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009009	TAAAA	2	10	223193	223202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009009	TTCTC	2	10	228284	228293	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009009	ATAGT	2	10	229048	229057	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009009	AAAAG	2	10	229141	229150	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009009	CTTTA	2	10	229370	229379	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009009	ATATT	2	10	229411	229420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009009	TTATA	2	10	238357	238366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009009	AAGAG	2	10	238388	238397	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009009	GGAAA	2	10	238545	238554	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009009	AGGAG	2	10	238615	238624	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009009	TTATA	2	10	239732	239741	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009009	AAAGA	2	10	246404	246413	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009009	TCAAA	2	10	247062	247071	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009009	TAAAA	2	10	256295	256304	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009009	TCAAA	2	10	258338	258347	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009009	ATAGA	2	10	258485	258494	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009009	AAAGA	2	10	258521	258530	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009009	TAAAT	2	10	276465	276474	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009009	CAGTT	2	10	315663	315672	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009009	TGATA	2	10	317106	317115	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009009	CTTTC	2	10	319922	319931	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_009009	AAGTA	2	10	337341	337350	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009009	TAAAA	2	10	338895	338904	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009009	TTTTA	2	10	339385	339394	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009009	AACAA	2	10	339448	339457	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009009	AGAAA	2	10	346974	346983	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009009	AATCT	2	10	352081	352090	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009009	GGAGC	2	10	356453	356462	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009009	TTATT	2	10	356644	356653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009009	AAATG	2	10	365302	365311	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009009	ATTAG	2	10	367346	367355	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009009	CTTTT	3	15	370970	370984	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009009	AAATG	2	10	372826	372835	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009009	AAATA	2	10	376328	376337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009009	TTTTA	2	10	381578	381587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009009	TATAA	2	10	382472	382481	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009009	CTTTT	2	10	382540	382549	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009009	TGATC	2	10	391079	391088	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009009	TATAA	2	10	391155	391164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009009	AGGGA	2	10	394070	394079	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009009	TTTTG	2	10	400301	400310	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009009	TTTTC	2	10	411834	411843	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009009	GATAA	2	10	411993	412002	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009009	ATTTT	2	10	424492	424501	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009009	TACTT	2	10	424570	424579	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009009	TTTCT	2	10	429211	429220	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009009	TGTCA	2	10	429422	429431	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009009	TATAA	2	10	441264	441273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009009	CTTTT	2	10	500626	500635	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009009	TATAA	2	10	506676	506685	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009009	CTTTT	2	10	537257	537266	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009009	TCAAA	2	10	545782	545791	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009009	CTTTT	2	10	547479	547488	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009009	AGAGG	2	10	549037	549046	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009009	TTTCG	2	10	553221	553230	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_009009	TTTAT	2	10	560046	560055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009009	TATTT	2	10	566991	567000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009009	TGCTA	2	10	567272	567281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009009	TGATA	2	10	579900	579909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009009	AGCTT	2	10	585677	585686	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009009	TCACT	2	10	589125	589134	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_009009	TTATT	2	10	600898	600907	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009009	AATAG	2	10	606698	606707	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009009	ATATA	2	10	609352	609361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009009	ATATA	2	10	611649	611658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009009	AGACA	2	10	619875	619884	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009009	TTTTG	2	10	619973	619982	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009009	CTTTC	2	10	630860	630869	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_009009	ATCAT	2	10	632660	632669	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009009	CTTTT	2	10	653821	653830	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009009	TAAAA	2	10	665006	665015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009009	GGGTA	2	10	670580	670589	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009009	ATAGA	2	10	671448	671457	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009009	TAAAA	2	10	680464	680473	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009009	AGATA	2	10	684356	684365	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009009	ACATA	2	10	685539	685548	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009009	TATAA	2	10	685588	685597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009009	GAAGA	2	10	691270	691279	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009009	TAAAA	2	10	693252	693261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009009	AAAAG	2	10	694843	694852	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009009	GATAA	2	10	703860	703869	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009009	TCTAG	2	10	708182	708191	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009009	CTAGA	2	10	708552	708561	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009009	TTCGT	2	10	708619	708628	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009009	TTGGT	2	10	713761	713770	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009009	ATTTT	2	10	718540	718549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009009	TAAAA	2	10	722287	722296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009009	TATAA	2	10	731834	731843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009009	TAAAA	2	10	739696	739705	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009009	AAAAG	2	10	743958	743967	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009009	CTTTT	2	10	749318	749327	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009009	TACAA	2	10	752003	752012	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_009009	TTTTC	2	10	773114	773123	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009009	AAAAT	2	10	779568	779577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009009	TAAAA	2	10	784307	784316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009009	ATTAT	2	10	802095	802104	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009009	AGTCT	2	10	805850	805859	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009009	ATGAA	2	10	812545	812554	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009009	ATCTA	2	10	839095	839104	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009009	GAAAG	2	10	845638	845647	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009009	CTAGG	2	10	865468	865477	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009009	GTAGA	2	10	876292	876301	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009009	TAGAA	2	10	884288	884297	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009009	AATGA	2	10	890014	890023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009009	GAGAA	2	10	893369	893378	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009009	AATTT	2	10	919386	919395	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009009	AAATC	2	10	919416	919425	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009009	ATAGA	2	10	924965	924974	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009009	AAATA	2	10	930378	930387	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009009	TTTTG	2	10	945152	945161	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009009	ATGTA	2	10	954303	954312	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009009	CTATT	2	10	955044	955053	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_009009	CTTTG	2	10	961293	961302	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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331	NC_009009	ACTTT	2	10	2346847	2346856	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
332	NC_009009	AAAAG	2	10	2355465	2355474	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
333	NC_009009	CTTAT	2	10	2362711	2362720	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
334	NC_009009	GTGCT	2	10	2363910	2363919	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
335	NC_009009	TTTAG	2	10	2367214	2367223	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
336	NC_009009	ATTCT	2	10	2378512	2378521	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.