MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid E

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009008	CGCCCG	2	12	1481	1492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654695
2	NC_009008	CGCAGG	2	12	3798	3809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	125654697
3	NC_009008	GATCCA	2	12	4778	4789	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	125654698
4	NC_009008	GCGACC	2	12	6929	6940	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	125654701
5	NC_009008	GCGGGG	2	12	9931	9942	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	125654705
6	NC_009008	GCGGTG	2	12	10143	10154	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	125654705
7	NC_009008	CCAGCG	2	12	14638	14649	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	125654708
8	NC_009008	GCCGGG	2	12	14995	15006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654708
9	NC_009008	GAGGCC	2	12	15356	15367	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	125654708
10	NC_009008	AGGCCG	2	12	15456	15467	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	125654708
11	NC_009008	GCTGTA	2	12	17258	17269	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	125654710
12	NC_009008	CATGTC	2	12	22112	22123	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	125654713
13	NC_009008	CGATGG	2	12	23027	23038	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	125654715
14	NC_009008	GCTCGC	2	12	23906	23917	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	125654716
15	NC_009008	GCTGGC	2	12	24083	24094	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	125654716
16	NC_009008	GGTCTT	2	12	29577	29588	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	125654718
17	NC_009008	GCCCGC	2	12	29604	29615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
18	NC_009008	TGTTCA	2	12	29921	29932	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	125654718
19	NC_009008	CGAGGC	2	12	30396	30407	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	125654718
20	NC_009008	CAGCCC	2	12	30892	30903	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	125654718

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.