MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid E

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009008	GGTCG	2	10	504	513	0 %	20 %	60 %	20 %	125654694
2	NC_009008	GCCGC	2	10	538	547	0 %	0 %	40 %	60 %	125654694
3	NC_009008	CGGGA	2	10	569	578	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009008	GCCGC	2	10	764	773	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_009008	TGCGC	2	10	1533	1542	0 %	20 %	40 %	40 %	125654695
6	NC_009008	CAGGA	2	10	4980	4989	40 %	0 %	40 %	20 %	125654698
7	NC_009008	GCCGC	2	10	5363	5372	0 %	0 %	40 %	60 %	125654699
8	NC_009008	GTCCG	2	10	5627	5636	0 %	20 %	40 %	40 %	125654699
9	NC_009008	GCCGT	2	10	5826	5835	0 %	20 %	40 %	40 %	125654699
10	NC_009008	TCGGC	2	10	6447	6456	0 %	20 %	40 %	40 %	125654700
11	NC_009008	GGGCG	2	10	6759	6768	0 %	0 %	80 %	20 %	125654700
12	NC_009008	GCTTG	2	10	8034	8043	0 %	40 %	40 %	20 %	125654702
13	NC_009008	GTGCT	2	10	9149	9158	0 %	40 %	40 %	20 %	125654704
14	NC_009008	GCGGA	2	10	10436	10445	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009008	TGTGC	2	10	11253	11262	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009008	GTCCC	2	10	11666	11675	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_009008	AGGCC	2	10	14129	14138	20 %	0 %	40 %	40 %	125654708
18	NC_009008	AAGGC	2	10	14727	14736	40 %	0 %	40 %	20 %	125654708
19	NC_009008	CGACG	2	10	16088	16097	20 %	0 %	40 %	40 %	125654709
20	NC_009008	CGAGC	2	10	17291	17300	20 %	0 %	40 %	40 %	125654710
21	NC_009008	CCGAG	2	10	17518	17527	20 %	0 %	40 %	40 %	125654710
22	NC_009008	GCGCC	2	10	17981	17990	0 %	0 %	40 %	60 %	125654710
23	NC_009008	AGCGC	2	10	18724	18733	20 %	0 %	40 %	40 %	125654710
24	NC_009008	CGGGG	2	10	19351	19360	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009008	CGGCG	2	10	21287	21296	0 %	0 %	60 %	40 %	125654713
26	NC_009008	CCGAG	2	10	21602	21611	20 %	0 %	40 %	40 %	125654713
27	NC_009008	TCGTC	2	10	22319	22328	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009008	GATCG	2	10	22664	22673	20 %	20 %	40 %	20 %	125654714
29	NC_009008	GCAAG	2	10	23069	23078	40 %	0 %	40 %	20 %	125654715
30	NC_009008	GTGGC	2	10	25821	25830	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009008	CCGCG	2	10	26495	26504	0 %	0 %	40 %	60 %	125654718
32	NC_009008	GGTGC	2	10	27351	27360	0 %	20 %	60 %	20 %	125654718
33	NC_009008	GCCGT	2	10	28276	28285	0 %	20 %	40 %	40 %	125654718
34	NC_009008	GCGCC	2	10	28571	28580	0 %	0 %	40 %	60 %	125654718
35	NC_009008	CCGGT	2	10	30257	30266	0 %	20 %	40 %	40 %	125654718
36	NC_009008	GCCGA	2	10	32079	32088	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009008	CATCA	2	10	33146	33155	40 %	20 %	0 %	40 %	125654720
38	NC_009008	TTTGT	2	10	34620	34629	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009008	ATGGG	2	10	35612	35621	20 %	20 %	60 %	0 %	125654722
40	NC_009008	CGGCG	2	10	35764	35773	0 %	0 %	60 %	40 %	125654722
41	NC_009008	CGGCA	2	10	36200	36209	20 %	0 %	40 %	40 %	125654722
42	NC_009008	GGGCA	2	10	36416	36425	20 %	0 %	60 %	20 %	125654722
43	NC_009008	GCCAC	2	10	36743	36752	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_009008	TCTTG	2	10	36781	36790	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009008	GCCGG	2	10	37050	37059	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.