MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid E

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009008	GGTCG	2	10	504	513	0 %	20 %	60 %	20 %	125654694
2	NC_009008	GCCGC	2	10	538	547	0 %	0 %	40 %	60 %	125654694
3	NC_009008	TGCGC	2	10	1533	1542	0 %	20 %	40 %	40 %	125654695
4	NC_009008	CAGGA	2	10	4980	4989	40 %	0 %	40 %	20 %	125654698
5	NC_009008	GCCGC	2	10	5363	5372	0 %	0 %	40 %	60 %	125654699
6	NC_009008	GTCCG	2	10	5627	5636	0 %	20 %	40 %	40 %	125654699
7	NC_009008	GCCGT	2	10	5826	5835	0 %	20 %	40 %	40 %	125654699
8	NC_009008	TCGGC	2	10	6447	6456	0 %	20 %	40 %	40 %	125654700
9	NC_009008	GGGCG	2	10	6759	6768	0 %	0 %	80 %	20 %	125654700
10	NC_009008	GCTTG	2	10	8034	8043	0 %	40 %	40 %	20 %	125654702
11	NC_009008	GTGCT	2	10	9149	9158	0 %	40 %	40 %	20 %	125654704
12	NC_009008	AGGCC	2	10	14129	14138	20 %	0 %	40 %	40 %	125654708
13	NC_009008	AAGGC	2	10	14727	14736	40 %	0 %	40 %	20 %	125654708
14	NC_009008	CGACG	2	10	16088	16097	20 %	0 %	40 %	40 %	125654709
15	NC_009008	CGAGC	2	10	17291	17300	20 %	0 %	40 %	40 %	125654710
16	NC_009008	CCGAG	2	10	17518	17527	20 %	0 %	40 %	40 %	125654710
17	NC_009008	GCGCC	2	10	17981	17990	0 %	0 %	40 %	60 %	125654710
18	NC_009008	AGCGC	2	10	18724	18733	20 %	0 %	40 %	40 %	125654710
19	NC_009008	CGGCG	2	10	21287	21296	0 %	0 %	60 %	40 %	125654713
20	NC_009008	CCGAG	2	10	21602	21611	20 %	0 %	40 %	40 %	125654713
21	NC_009008	GATCG	2	10	22664	22673	20 %	20 %	40 %	20 %	125654714
22	NC_009008	GCAAG	2	10	23069	23078	40 %	0 %	40 %	20 %	125654715
23	NC_009008	CCGCG	2	10	26495	26504	0 %	0 %	40 %	60 %	125654718
24	NC_009008	GGTGC	2	10	27351	27360	0 %	20 %	60 %	20 %	125654718
25	NC_009008	GCCGT	2	10	28276	28285	0 %	20 %	40 %	40 %	125654718
26	NC_009008	GCGCC	2	10	28571	28580	0 %	0 %	40 %	60 %	125654718
27	NC_009008	CCGGT	2	10	30257	30266	0 %	20 %	40 %	40 %	125654718
28	NC_009008	CATCA	2	10	33146	33155	40 %	20 %	0 %	40 %	125654720
29	NC_009008	ATGGG	2	10	35612	35621	20 %	20 %	60 %	0 %	125654722
30	NC_009008	CGGCG	2	10	35764	35773	0 %	0 %	60 %	40 %	125654722
31	NC_009008	CGGCA	2	10	36200	36209	20 %	0 %	40 %	40 %	125654722
32	NC_009008	GGGCA	2	10	36416	36425	20 %	0 %	60 %	20 %	125654722

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.