MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid E

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009008	CGGG	2	8	15	22	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009008	CCGC	2	8	254	261	0 %	0 %	25 %	75 %	125654694
3	NC_009008	CGCC	2	8	273	280	0 %	0 %	25 %	75 %	125654694
4	NC_009008	CTGG	2	8	1545	1552	0 %	25 %	50 %	25 %	125654695
5	NC_009008	GAGG	2	8	1669	1676	25 %	0 %	75 %	0 %	125654695
6	NC_009008	GCCG	2	8	1698	1705	0 %	0 %	50 %	50 %	125654695
7	NC_009008	GTCC	2	8	1930	1937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009008	CGGG	2	8	2933	2940	0 %	0 %	75 %	25 %	125654696
9	NC_009008	GGCG	2	8	2964	2971	0 %	0 %	75 %	25 %	125654696
10	NC_009008	GAGG	2	8	3556	3563	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009008	GGCG	2	8	3810	3817	0 %	0 %	75 %	25 %	125654697
12	NC_009008	GCCG	2	8	4047	4054	0 %	0 %	50 %	50 %	125654697
13	NC_009008	GCGG	2	8	4163	4170	0 %	0 %	75 %	25 %	125654697
14	NC_009008	AGCC	2	8	5186	5193	25 %	0 %	25 %	50 %	125654699
15	NC_009008	GACC	2	8	5584	5591	25 %	0 %	25 %	50 %	125654699
16	NC_009008	GCGG	2	8	6695	6702	0 %	0 %	75 %	25 %	125654700
17	NC_009008	CGGA	2	8	6819	6826	25 %	0 %	50 %	25 %	125654700
18	NC_009008	GGCG	2	8	6989	6996	0 %	0 %	75 %	25 %	125654701
19	NC_009008	TTCA	2	8	7692	7699	25 %	50 %	0 %	25 %	125654702
20	NC_009008	GGGA	2	8	7870	7877	25 %	0 %	75 %	0 %	125654702
21	NC_009008	CGCT	2	8	8002	8009	0 %	25 %	25 %	50 %	125654702
22	NC_009008	CTGA	2	8	8110	8117	25 %	25 %	25 %	25 %	125654702
23	NC_009008	GATT	2	8	9125	9132	25 %	50 %	25 %	0 %	125654704
24	NC_009008	CTGG	2	8	9216	9223	0 %	25 %	50 %	25 %	125654704
25	NC_009008	TGCG	2	8	9248	9255	0 %	25 %	50 %	25 %	125654704
26	NC_009008	GCCT	2	8	9509	9516	0 %	25 %	25 %	50 %	125654704
27	NC_009008	CGCT	2	8	9668	9675	0 %	25 %	25 %	50 %	125654705
28	NC_009008	CCGG	2	8	10223	10230	0 %	0 %	50 %	50 %	125654705
29	NC_009008	CGAC	2	8	11298	11305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009008	GGAA	2	8	12165	12172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009008	TCCG	2	8	12308	12315	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009008	GACG	2	8	13158	13165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009008	GCCT	2	8	13605	13612	0 %	25 %	25 %	50 %	125654707
34	NC_009008	AGAA	2	8	14076	14083	75 %	0 %	25 %	0 %	125654708
35	NC_009008	CCCA	2	8	14148	14155	25 %	0 %	0 %	75 %	125654708
36	NC_009008	GCGG	2	8	14333	14340	0 %	0 %	75 %	25 %	125654708
37	NC_009008	GCCC	2	8	14524	14531	0 %	0 %	25 %	75 %	125654708
38	NC_009008	GCCG	2	8	14834	14841	0 %	0 %	50 %	50 %	125654708
39	NC_009008	CGCC	2	8	15811	15818	0 %	0 %	25 %	75 %	125654708
40	NC_009008	CGCC	2	8	15901	15908	0 %	0 %	25 %	75 %	125654708
41	NC_009008	TCGG	2	8	16512	16519	0 %	25 %	50 %	25 %	125654709
42	NC_009008	GTCG	2	8	16720	16727	0 %	25 %	50 %	25 %	125654709
43	NC_009008	GCCG	2	8	16778	16785	0 %	0 %	50 %	50 %	125654709
44	NC_009008	TCCG	2	8	16881	16888	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009008	CGAG	2	8	17131	17138	25 %	0 %	50 %	25 %	125654710
46	NC_009008	CGCC	2	8	17688	17695	0 %	0 %	25 %	75 %	125654710
47	NC_009008	CGAG	2	8	17830	17837	25 %	0 %	50 %	25 %	125654710
48	NC_009008	GCTC	2	8	18136	18143	0 %	25 %	25 %	50 %	125654710
49	NC_009008	GTCG	2	8	18173	18180	0 %	25 %	50 %	25 %	125654710
50	NC_009008	GGTG	2	8	18254	18261	0 %	25 %	75 %	0 %	125654710
51	NC_009008	CGCC	2	8	18877	18884	0 %	0 %	25 %	75 %	125654710
52	NC_009008	GCCG	2	8	18908	18915	0 %	0 %	50 %	50 %	125654710
53	NC_009008	CCGC	2	8	19123	19130	0 %	0 %	25 %	75 %	125654710
54	NC_009008	CGGA	2	8	19417	19424	25 %	0 %	50 %	25 %	125654711
55	NC_009008	TCGG	2	8	20350	20357	0 %	25 %	50 %	25 %	125654711
56	NC_009008	GATC	2	8	20545	20552	25 %	25 %	25 %	25 %	125654712
57	NC_009008	GGTC	2	8	20993	21000	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009008	CCTG	2	8	21182	21189	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009008	GGTC	2	8	21419	21426	0 %	25 %	50 %	25 %	125654713
60	NC_009008	GCCC	2	8	21734	21741	0 %	0 %	25 %	75 %	125654713
61	NC_009008	GCGA	2	8	21964	21971	25 %	0 %	50 %	25 %	125654713
62	NC_009008	CGGG	2	8	22482	22489	0 %	0 %	75 %	25 %	125654714
63	NC_009008	CCGG	2	8	22863	22870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009008	GCAG	2	8	23261	23268	25 %	0 %	50 %	25 %	125654715
65	NC_009008	CAGC	2	8	23288	23295	25 %	0 %	25 %	50 %	125654715
66	NC_009008	ACGC	2	8	23669	23676	25 %	0 %	25 %	50 %	125654715
67	NC_009008	GACG	2	8	23708	23715	25 %	0 %	50 %	25 %	125654715
68	NC_009008	CGCT	2	8	24157	24164	0 %	25 %	25 %	50 %	125654716
69	NC_009008	TTCG	2	8	24268	24275	0 %	50 %	25 %	25 %	125654716
70	NC_009008	CCGA	2	8	24452	24459	25 %	0 %	25 %	50 %	125654717
71	NC_009008	GCCC	2	8	24809	24816	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_009008	TCCG	2	8	25024	25031	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009008	CCGC	2	8	25054	25061	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_009008	GCGG	2	8	26354	26361	0 %	0 %	75 %	25 %	125654718
75	NC_009008	CCCG	2	8	26409	26416	0 %	0 %	25 %	75 %	125654718
76	NC_009008	GTCG	2	8	28467	28474	0 %	25 %	50 %	25 %	125654718
77	NC_009008	TCGC	2	8	29059	29066	0 %	25 %	25 %	50 %	125654718
78	NC_009008	CAGG	2	8	29364	29371	25 %	0 %	50 %	25 %	125654718
79	NC_009008	CCGA	2	8	29485	29492	25 %	0 %	25 %	50 %	125654718
80	NC_009008	CGAC	2	8	29495	29502	25 %	0 %	25 %	50 %	125654718
81	NC_009008	CTGC	2	8	29852	29859	0 %	25 %	25 %	50 %	125654718
82	NC_009008	CGGG	2	8	30288	30295	0 %	0 %	75 %	25 %	125654718
83	NC_009008	TGGT	2	8	30436	30443	0 %	50 %	50 %	0 %	125654718
84	NC_009008	GATC	2	8	30678	30685	25 %	25 %	25 %	25 %	125654718
85	NC_009008	GCCT	2	8	31514	31521	0 %	25 %	25 %	50 %	125654719
86	NC_009008	CGGA	2	8	31875	31882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009008	TCAT	2	8	32483	32490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009008	GGTT	2	8	32616	32623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009008	CGTT	2	8	32869	32876	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009008	GCCA	2	8	33000	33007	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009008	CAGC	2	8	33061	33068	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009008	GCCA	2	8	33189	33196	25 %	0 %	25 %	50 %	125654720
93	NC_009008	CCAG	2	8	33680	33687	25 %	0 %	25 %	50 %	125654720
94	NC_009008	GTGC	2	8	33783	33790	0 %	25 %	50 %	25 %	125654720
95	NC_009008	GAAG	2	8	33816	33823	50 %	0 %	50 %	0 %	125654720
96	NC_009008	CGGC	2	8	34004	34011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009008	GCGG	2	8	34134	34141	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009008	AATT	2	8	34220	34227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009008	TCAT	2	8	34650	34657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009008	CGGA	2	8	34874	34881	25 %	0 %	50 %	25 %	125654721
101	NC_009008	GGCG	2	8	35038	35045	0 %	0 %	75 %	25 %	125654721
102	NC_009008	GTCG	2	8	35391	35398	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009008	CCGG	2	8	36701	36708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.