MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid E

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009008	CGGG	2	8	15	22	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009008	GTCC	2	8	1930	1937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009008	GAGG	2	8	3556	3563	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009008	CGAC	2	8	11298	11305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009008	GGAA	2	8	12165	12172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009008	TCCG	2	8	12308	12315	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009008	GACG	2	8	13158	13165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009008	TCCG	2	8	16881	16888	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009008	GGTC	2	8	20993	21000	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009008	CCTG	2	8	21182	21189	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009008	CCGG	2	8	22863	22870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009008	GCCC	2	8	24809	24816	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_009008	TCCG	2	8	25024	25031	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009008	CCGC	2	8	25054	25061	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_009008	CGGA	2	8	31875	31882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009008	TCAT	2	8	32483	32490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009008	GGTT	2	8	32616	32623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009008	CGTT	2	8	32869	32876	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009008	GCCA	2	8	33000	33007	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009008	CAGC	2	8	33061	33068	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009008	CGGC	2	8	34004	34011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009008	GCGG	2	8	34134	34141	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009008	AATT	2	8	34220	34227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009008	TCAT	2	8	34650	34657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009008	GTCG	2	8	35391	35398	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009008	CCGG	2	8	36701	36708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.