MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid E

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009008	CCGC	2	8	254	261	0 %	0 %	25 %	75 %	125654694
2	NC_009008	CGCC	2	8	273	280	0 %	0 %	25 %	75 %	125654694
3	NC_009008	CTGG	2	8	1545	1552	0 %	25 %	50 %	25 %	125654695
4	NC_009008	GAGG	2	8	1669	1676	25 %	0 %	75 %	0 %	125654695
5	NC_009008	GCCG	2	8	1698	1705	0 %	0 %	50 %	50 %	125654695
6	NC_009008	CGGG	2	8	2933	2940	0 %	0 %	75 %	25 %	125654696
7	NC_009008	GGCG	2	8	2964	2971	0 %	0 %	75 %	25 %	125654696
8	NC_009008	GGCG	2	8	3810	3817	0 %	0 %	75 %	25 %	125654697
9	NC_009008	GCCG	2	8	4047	4054	0 %	0 %	50 %	50 %	125654697
10	NC_009008	GCGG	2	8	4163	4170	0 %	0 %	75 %	25 %	125654697
11	NC_009008	AGCC	2	8	5186	5193	25 %	0 %	25 %	50 %	125654699
12	NC_009008	GACC	2	8	5584	5591	25 %	0 %	25 %	50 %	125654699
13	NC_009008	GCGG	2	8	6695	6702	0 %	0 %	75 %	25 %	125654700
14	NC_009008	CGGA	2	8	6819	6826	25 %	0 %	50 %	25 %	125654700
15	NC_009008	GGCG	2	8	6989	6996	0 %	0 %	75 %	25 %	125654701
16	NC_009008	TTCA	2	8	7692	7699	25 %	50 %	0 %	25 %	125654702
17	NC_009008	GGGA	2	8	7870	7877	25 %	0 %	75 %	0 %	125654702
18	NC_009008	CGCT	2	8	8002	8009	0 %	25 %	25 %	50 %	125654702
19	NC_009008	CTGA	2	8	8110	8117	25 %	25 %	25 %	25 %	125654702
20	NC_009008	GATT	2	8	9125	9132	25 %	50 %	25 %	0 %	125654704
21	NC_009008	CTGG	2	8	9216	9223	0 %	25 %	50 %	25 %	125654704
22	NC_009008	TGCG	2	8	9248	9255	0 %	25 %	50 %	25 %	125654704
23	NC_009008	GCCT	2	8	9509	9516	0 %	25 %	25 %	50 %	125654704
24	NC_009008	CGCT	2	8	9668	9675	0 %	25 %	25 %	50 %	125654705
25	NC_009008	CCGG	2	8	10223	10230	0 %	0 %	50 %	50 %	125654705
26	NC_009008	GCCT	2	8	13605	13612	0 %	25 %	25 %	50 %	125654707
27	NC_009008	AGAA	2	8	14076	14083	75 %	0 %	25 %	0 %	125654708
28	NC_009008	CCCA	2	8	14148	14155	25 %	0 %	0 %	75 %	125654708
29	NC_009008	GCGG	2	8	14333	14340	0 %	0 %	75 %	25 %	125654708
30	NC_009008	GCCC	2	8	14524	14531	0 %	0 %	25 %	75 %	125654708
31	NC_009008	GCCG	2	8	14834	14841	0 %	0 %	50 %	50 %	125654708
32	NC_009008	CGCC	2	8	15811	15818	0 %	0 %	25 %	75 %	125654708
33	NC_009008	CGCC	2	8	15901	15908	0 %	0 %	25 %	75 %	125654708
34	NC_009008	TCGG	2	8	16512	16519	0 %	25 %	50 %	25 %	125654709
35	NC_009008	GTCG	2	8	16720	16727	0 %	25 %	50 %	25 %	125654709
36	NC_009008	GCCG	2	8	16778	16785	0 %	0 %	50 %	50 %	125654709
37	NC_009008	CGAG	2	8	17131	17138	25 %	0 %	50 %	25 %	125654710
38	NC_009008	CGCC	2	8	17688	17695	0 %	0 %	25 %	75 %	125654710
39	NC_009008	CGAG	2	8	17830	17837	25 %	0 %	50 %	25 %	125654710
40	NC_009008	GCTC	2	8	18136	18143	0 %	25 %	25 %	50 %	125654710
41	NC_009008	GTCG	2	8	18173	18180	0 %	25 %	50 %	25 %	125654710
42	NC_009008	GGTG	2	8	18254	18261	0 %	25 %	75 %	0 %	125654710
43	NC_009008	CGCC	2	8	18877	18884	0 %	0 %	25 %	75 %	125654710
44	NC_009008	GCCG	2	8	18908	18915	0 %	0 %	50 %	50 %	125654710
45	NC_009008	CCGC	2	8	19123	19130	0 %	0 %	25 %	75 %	125654710
46	NC_009008	CGGA	2	8	19417	19424	25 %	0 %	50 %	25 %	125654711
47	NC_009008	TCGG	2	8	20350	20357	0 %	25 %	50 %	25 %	125654711
48	NC_009008	GATC	2	8	20545	20552	25 %	25 %	25 %	25 %	125654712
49	NC_009008	GGTC	2	8	21419	21426	0 %	25 %	50 %	25 %	125654713
50	NC_009008	GCCC	2	8	21734	21741	0 %	0 %	25 %	75 %	125654713
51	NC_009008	GCGA	2	8	21964	21971	25 %	0 %	50 %	25 %	125654713
52	NC_009008	CGGG	2	8	22482	22489	0 %	0 %	75 %	25 %	125654714
53	NC_009008	GCAG	2	8	23261	23268	25 %	0 %	50 %	25 %	125654715
54	NC_009008	CAGC	2	8	23288	23295	25 %	0 %	25 %	50 %	125654715
55	NC_009008	ACGC	2	8	23669	23676	25 %	0 %	25 %	50 %	125654715
56	NC_009008	GACG	2	8	23708	23715	25 %	0 %	50 %	25 %	125654715
57	NC_009008	CGCT	2	8	24157	24164	0 %	25 %	25 %	50 %	125654716
58	NC_009008	TTCG	2	8	24268	24275	0 %	50 %	25 %	25 %	125654716
59	NC_009008	CCGA	2	8	24452	24459	25 %	0 %	25 %	50 %	125654717
60	NC_009008	GCGG	2	8	26354	26361	0 %	0 %	75 %	25 %	125654718
61	NC_009008	CCCG	2	8	26409	26416	0 %	0 %	25 %	75 %	125654718
62	NC_009008	GTCG	2	8	28467	28474	0 %	25 %	50 %	25 %	125654718
63	NC_009008	TCGC	2	8	29059	29066	0 %	25 %	25 %	50 %	125654718
64	NC_009008	CAGG	2	8	29364	29371	25 %	0 %	50 %	25 %	125654718
65	NC_009008	CCGA	2	8	29485	29492	25 %	0 %	25 %	50 %	125654718
66	NC_009008	CGAC	2	8	29495	29502	25 %	0 %	25 %	50 %	125654718
67	NC_009008	CTGC	2	8	29852	29859	0 %	25 %	25 %	50 %	125654718
68	NC_009008	CGGG	2	8	30288	30295	0 %	0 %	75 %	25 %	125654718
69	NC_009008	TGGT	2	8	30436	30443	0 %	50 %	50 %	0 %	125654718
70	NC_009008	GATC	2	8	30678	30685	25 %	25 %	25 %	25 %	125654718
71	NC_009008	GCCT	2	8	31514	31521	0 %	25 %	25 %	50 %	125654719
72	NC_009008	GCCA	2	8	33189	33196	25 %	0 %	25 %	50 %	125654720
73	NC_009008	CCAG	2	8	33680	33687	25 %	0 %	25 %	50 %	125654720
74	NC_009008	GTGC	2	8	33783	33790	0 %	25 %	50 %	25 %	125654720
75	NC_009008	GAAG	2	8	33816	33823	50 %	0 %	50 %	0 %	125654720
76	NC_009008	CGGA	2	8	34874	34881	25 %	0 %	50 %	25 %	125654721
77	NC_009008	GGCG	2	8	35038	35045	0 %	0 %	75 %	25 %	125654721

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.