MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid E

Total Repeats: 544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009008	GCC	2	6	61	66	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009008	GCC	2	6	199	204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654694
3	NC_009008	CTG	2	6	262	267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654694
4	NC_009008	CGT	2	6	291	296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654694
5	NC_009008	ACG	2	6	323	328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654694
6	NC_009008	GCC	2	6	386	391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654694
7	NC_009008	GCT	2	6	426	431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654694
8	NC_009008	CGG	2	6	440	445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654694
9	NC_009008	GCG	2	6	480	485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654694
10	NC_009008	TGC	2	6	497	502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654694
11	NC_009008	GAC	2	6	528	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654694
12	NC_009008	GCG	2	6	623	628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009008	GCC	3	9	643	651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009008	GCG	2	6	695	700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009008	GCC	2	6	741	746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_009008	CGG	2	6	757	762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009008	GGC	2	6	786	791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009008	GCT	2	6	825	830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654695
19	NC_009008	CGC	2	6	893	898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654695
20	NC_009008	GGC	2	6	930	935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654695
21	NC_009008	GCT	2	6	978	983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654695
22	NC_009008	GCC	2	6	1004	1009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654695
23	NC_009008	GCT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654695
24	NC_009008	GTG	2	6	1126	1131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654695
25	NC_009008	TGG	2	6	1163	1168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654695
26	NC_009008	GGT	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654695
27	NC_009008	CAC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654695
28	NC_009008	CCT	2	6	1437	1442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654695
29	NC_009008	CCG	2	6	1614	1619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654695
30	NC_009008	CGG	2	6	1757	1762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009008	CCT	2	6	1780	1785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009008	CCT	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009008	CTC	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_009008	GCC	2	6	1980	1985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_009008	CCG	2	6	1989	1994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009008	CCG	2	6	2023	2028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009008	CGG	2	6	2045	2050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009008	TCG	2	6	2132	2137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
39	NC_009008	ATC	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654696
40	NC_009008	CCT	2	6	2213	2218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654696
41	NC_009008	CGT	2	6	2229	2234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
42	NC_009008	GAT	2	6	2262	2267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654696
43	NC_009008	GCC	2	6	2272	2277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
44	NC_009008	CCG	2	6	2288	2293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
45	NC_009008	CTG	2	6	2335	2340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
46	NC_009008	GCC	2	6	2341	2346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
47	NC_009008	TGA	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654696
48	NC_009008	GCC	2	6	2502	2507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
49	NC_009008	GGC	2	6	2526	2531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654696
50	NC_009008	CAT	2	6	2541	2546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654696
51	NC_009008	CGC	2	6	2582	2587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
52	NC_009008	CAT	2	6	2595	2600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654696
53	NC_009008	ATC	2	6	2728	2733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654696
54	NC_009008	GGT	2	6	2757	2762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654696
55	NC_009008	TGA	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654696
56	NC_009008	TCG	2	6	2795	2800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
57	NC_009008	CGC	2	6	2862	2867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
58	NC_009008	CGG	2	6	2880	2885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654696
59	NC_009008	GAT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654696
60	NC_009008	GGC	2	6	2945	2950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654696
61	NC_009008	CTG	2	6	2977	2982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
62	NC_009008	TCG	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
63	NC_009008	GTC	2	6	3007	3012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
64	NC_009008	TCG	2	6	3035	3040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
65	NC_009008	CAT	2	6	3042	3047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654696
66	NC_009008	GTC	2	6	3078	3083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
67	NC_009008	TCC	3	9	3112	3120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654696
68	NC_009008	GTG	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654696
69	NC_009008	TGC	2	6	3191	3196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
70	NC_009008	TCT	2	6	3206	3211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654696
71	NC_009008	CGC	2	6	3213	3218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
72	NC_009008	GCC	2	6	3328	3333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
73	NC_009008	CCG	2	6	3438	3443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
74	NC_009008	TCG	2	6	3494	3499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
75	NC_009008	TGG	2	6	3591	3596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654697
76	NC_009008	CTG	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654697
77	NC_009008	GCC	2	6	3687	3692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654697
78	NC_009008	GCC	2	6	3698	3703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654697
79	NC_009008	GCC	2	6	3845	3850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654697
80	NC_009008	TGG	2	6	3933	3938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654697
81	NC_009008	CCT	2	6	4000	4005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654697
82	NC_009008	TGG	2	6	4068	4073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654697
83	NC_009008	CGG	2	6	4081	4086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654697
84	NC_009008	GGC	2	6	4117	4122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654697
85	NC_009008	GAG	2	6	4172	4177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654697
86	NC_009008	GCT	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654697
87	NC_009008	GGC	2	6	4228	4233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654697
88	NC_009008	CCT	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654697
89	NC_009008	ATC	2	6	4349	4354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654697
90	NC_009008	ACC	3	9	4361	4369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654697
91	NC_009008	GGC	2	6	4429	4434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009008	CGG	2	6	4446	4451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009008	GCC	2	6	4452	4457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_009008	CCG	2	6	4524	4529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_009008	CGC	2	6	4579	4584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654698
96	NC_009008	GAG	2	6	4676	4681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654698
97	NC_009008	TCG	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654698
98	NC_009008	AGG	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654698
99	NC_009008	CCA	2	6	4765	4770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654698
100	NC_009008	CAG	2	6	4841	4846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654698
101	NC_009008	GCC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654698
102	NC_009008	GCC	2	6	5021	5026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_009008	GCA	2	6	5080	5085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654699
104	NC_009008	AAT	2	6	5090	5095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125654699
105	NC_009008	CTT	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654699
106	NC_009008	GCG	2	6	5165	5170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654699
107	NC_009008	CTG	2	6	5228	5233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654699
108	NC_009008	CGC	2	6	5301	5306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654699
109	NC_009008	TGG	2	6	5466	5471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654699
110	NC_009008	AGA	2	6	5478	5483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125654699
111	NC_009008	GAT	2	6	5494	5499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654699
112	NC_009008	GCC	2	6	5554	5559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654699
113	NC_009008	CTG	2	6	5603	5608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654699
114	NC_009008	CAC	2	6	5701	5706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654699
115	NC_009008	CGC	2	6	5918	5923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654699
116	NC_009008	CCG	2	6	5991	5996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654699
117	NC_009008	GAA	2	6	6010	6015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009008	GCC	2	6	6112	6117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_009008	TGA	2	6	6134	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009008	GTC	2	6	6167	6172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009008	GCC	2	6	6175	6180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_009008	CAT	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009008	CGA	2	6	6426	6431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654700
124	NC_009008	CGC	2	6	6485	6490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654700
125	NC_009008	GGC	2	6	6519	6524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654700
126	NC_009008	TGA	2	6	7034	7039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654701
127	NC_009008	GCA	2	6	7046	7051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654701
128	NC_009008	CAC	2	6	7242	7247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654701
129	NC_009008	CTT	2	6	7254	7259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009008	GAA	2	6	7320	7325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009008	GAC	2	6	7380	7385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654702
132	NC_009008	CGG	2	6	7470	7475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654702
133	NC_009008	TGC	2	6	7480	7485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654702
134	NC_009008	GCC	2	6	7521	7526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654702
135	NC_009008	ATC	2	6	7543	7548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654702
136	NC_009008	CGC	2	6	7643	7648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654702
137	NC_009008	ATG	2	6	7782	7787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654702
138	NC_009008	GGC	2	6	7860	7865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654702
139	NC_009008	TGG	2	6	7978	7983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654702
140	NC_009008	CGG	2	6	7987	7992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654702
141	NC_009008	CGG	2	6	8083	8088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654702
142	NC_009008	GGA	2	6	8181	8186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009008	CCA	2	6	8303	8308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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