MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid E

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009008	CG	3	6	207	212	0 %	0 %	50 %	50 %	125654694
2	NC_009008	GC	3	6	335	340	0 %	0 %	50 %	50 %	125654694
3	NC_009008	GC	3	6	1106	1111	0 %	0 %	50 %	50 %	125654695
4	NC_009008	CG	3	6	1295	1300	0 %	0 %	50 %	50 %	125654695
5	NC_009008	GC	3	6	1361	1366	0 %	0 %	50 %	50 %	125654695
6	NC_009008	CG	3	6	1839	1844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009008	CG	3	6	1879	1884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009008	GC	3	6	2029	2034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009008	GC	3	6	2660	2665	0 %	0 %	50 %	50 %	125654696
10	NC_009008	GC	4	8	3267	3274	0 %	0 %	50 %	50 %	125654696
11	NC_009008	GC	3	6	3723	3728	0 %	0 %	50 %	50 %	125654697
12	NC_009008	GC	3	6	4006	4011	0 %	0 %	50 %	50 %	125654697
13	NC_009008	CG	3	6	4181	4186	0 %	0 %	50 %	50 %	125654697
14	NC_009008	GC	3	6	4195	4200	0 %	0 %	50 %	50 %	125654697
15	NC_009008	GC	3	6	4254	4259	0 %	0 %	50 %	50 %	125654697
16	NC_009008	GC	4	8	5281	5288	0 %	0 %	50 %	50 %	125654699
17	NC_009008	TA	3	6	5594	5599	50 %	50 %	0 %	0 %	125654699
18	NC_009008	GC	3	6	6511	6516	0 %	0 %	50 %	50 %	125654700
19	NC_009008	CT	3	6	6661	6666	0 %	50 %	0 %	50 %	125654700
20	NC_009008	CG	3	6	6674	6679	0 %	0 %	50 %	50 %	125654700
21	NC_009008	CG	3	6	6884	6889	0 %	0 %	50 %	50 %	125654701
22	NC_009008	TC	3	6	6893	6898	0 %	50 %	0 %	50 %	125654701
23	NC_009008	AT	3	6	6944	6949	50 %	50 %	0 %	0 %	125654701
24	NC_009008	GC	3	6	7360	7365	0 %	0 %	50 %	50 %	125654702
25	NC_009008	TC	3	6	7614	7619	0 %	50 %	0 %	50 %	125654702
26	NC_009008	TC	3	6	7915	7920	0 %	50 %	0 %	50 %	125654702
27	NC_009008	CG	3	6	8175	8180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009008	CG	3	6	10123	10128	0 %	0 %	50 %	50 %	125654705
29	NC_009008	GA	4	8	10184	10191	50 %	0 %	50 %	0 %	125654705
30	NC_009008	CG	3	6	10427	10432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009008	CG	3	6	10668	10673	0 %	0 %	50 %	50 %	125654706
32	NC_009008	GC	3	6	11116	11121	0 %	0 %	50 %	50 %	125654706
33	NC_009008	GC	3	6	11142	11147	0 %	0 %	50 %	50 %	125654706
34	NC_009008	AG	3	6	12410	12415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009008	AC	3	6	12484	12489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009008	CG	3	6	14619	14624	0 %	0 %	50 %	50 %	125654708
37	NC_009008	GC	3	6	15026	15031	0 %	0 %	50 %	50 %	125654708
38	NC_009008	CG	3	6	15188	15193	0 %	0 %	50 %	50 %	125654708
39	NC_009008	AG	3	6	15700	15705	50 %	0 %	50 %	0 %	125654708
40	NC_009008	GA	3	6	15822	15827	50 %	0 %	50 %	0 %	125654708
41	NC_009008	GC	3	6	15949	15954	0 %	0 %	50 %	50 %	125654708
42	NC_009008	GC	3	6	15977	15982	0 %	0 %	50 %	50 %	125654708
43	NC_009008	GC	3	6	16045	16050	0 %	0 %	50 %	50 %	125654709
44	NC_009008	CG	3	6	16106	16111	0 %	0 %	50 %	50 %	125654709
45	NC_009008	GA	3	6	16211	16216	50 %	0 %	50 %	0 %	125654709
46	NC_009008	GC	3	6	16469	16474	0 %	0 %	50 %	50 %	125654709
47	NC_009008	CG	3	6	17016	17021	0 %	0 %	50 %	50 %	125654710
48	NC_009008	GC	3	6	17149	17154	0 %	0 %	50 %	50 %	125654710
49	NC_009008	CG	3	6	17326	17331	0 %	0 %	50 %	50 %	125654710
50	NC_009008	CG	4	8	17635	17642	0 %	0 %	50 %	50 %	125654710
51	NC_009008	CG	3	6	17859	17864	0 %	0 %	50 %	50 %	125654710
52	NC_009008	CG	3	6	18343	18348	0 %	0 %	50 %	50 %	125654710
53	NC_009008	GC	3	6	18391	18396	0 %	0 %	50 %	50 %	125654710
54	NC_009008	CG	3	6	19532	19537	0 %	0 %	50 %	50 %	125654711
55	NC_009008	GC	4	8	20201	20208	0 %	0 %	50 %	50 %	125654711
56	NC_009008	GC	3	6	20297	20302	0 %	0 %	50 %	50 %	125654711
57	NC_009008	CG	3	6	20337	20342	0 %	0 %	50 %	50 %	125654711
58	NC_009008	CG	3	6	20435	20440	0 %	0 %	50 %	50 %	125654712
59	NC_009008	CG	3	6	20657	20662	0 %	0 %	50 %	50 %	125654712
60	NC_009008	GC	4	8	20684	20691	0 %	0 %	50 %	50 %	125654712
61	NC_009008	CG	3	6	20775	20780	0 %	0 %	50 %	50 %	125654712
62	NC_009008	GC	3	6	21455	21460	0 %	0 %	50 %	50 %	125654713
63	NC_009008	CG	3	6	22672	22677	0 %	0 %	50 %	50 %	125654714
64	NC_009008	AG	4	8	23455	23462	50 %	0 %	50 %	0 %	125654715
65	NC_009008	GC	3	6	24101	24106	0 %	0 %	50 %	50 %	125654716
66	NC_009008	CG	3	6	24739	24744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009008	CT	4	8	25911	25918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009008	CG	3	6	26884	26889	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
69	NC_009008	GC	3	6	26960	26965	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
70	NC_009008	GC	3	6	27213	27218	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
71	NC_009008	CG	3	6	27415	27420	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
72	NC_009008	GC	3	6	27554	27559	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
73	NC_009008	AG	3	6	28288	28293	50 %	0 %	50 %	0 %	125654718
74	NC_009008	GC	3	6	29161	29166	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
75	NC_009008	GC	3	6	29307	29312	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
76	NC_009008	CG	3	6	29338	29343	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
77	NC_009008	GC	3	6	31203	31208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009008	GC	3	6	31219	31224	0 %	0 %	50 %	50 %	125654719
79	NC_009008	CG	4	8	31979	31986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009008	GC	3	6	33596	33601	0 %	0 %	50 %	50 %	125654720
81	NC_009008	AT	3	6	33734	33739	50 %	50 %	0 %	0 %	125654720
82	NC_009008	CA	4	8	33978	33985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009008	CA	3	6	33994	33999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009008	AT	3	6	34345	34350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009008	GT	3	6	34688	34693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009008	CG	3	6	34939	34944	0 %	0 %	50 %	50 %	125654721
87	NC_009008	TC	3	6	34948	34953	0 %	50 %	0 %	50 %	125654721
88	NC_009008	AT	3	6	34993	34998	50 %	50 %	0 %	0 %	125654721
89	NC_009008	CG	3	6	36265	36270	0 %	0 %	50 %	50 %	125654722
90	NC_009008	GC	3	6	37088	37093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.