MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid A

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009007	CGGGC	2	10	518	527	0 %	0 %	60 %	40 %	125654606
2	NC_009007	CGCGG	2	10	723	732	0 %	0 %	60 %	40 %	125654606
3	NC_009007	GAGCG	2	10	2368	2377	20 %	0 %	60 %	20 %	125654607
4	NC_009007	GGCCC	2	10	2637	2646	0 %	0 %	40 %	60 %	125654607
5	NC_009007	GCCTC	2	10	2713	2722	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_009007	CGGCG	2	10	3282	3291	0 %	0 %	60 %	40 %	125654608
7	NC_009007	AGCGC	2	10	3389	3398	20 %	0 %	40 %	40 %	125654608
8	NC_009007	GGCCG	2	10	4032	4041	0 %	0 %	60 %	40 %	125654608
9	NC_009007	TCGAA	2	10	4617	4626	40 %	20 %	20 %	20 %	125654609
10	NC_009007	GGACC	2	10	6208	6217	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009007	TGCCC	2	10	6393	6402	0 %	20 %	20 %	60 %	125654610
12	NC_009007	GCCGC	2	10	7347	7356	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_009007	CGCGG	2	10	7701	7710	0 %	0 %	60 %	40 %	125654611
14	NC_009007	GCGCC	2	10	8198	8207	0 %	0 %	40 %	60 %	125654611
15	NC_009007	TCGGC	2	10	8977	8986	0 %	20 %	40 %	40 %	125654613
16	NC_009007	CGGGC	2	10	9212	9221	0 %	0 %	60 %	40 %	125654613
17	NC_009007	CGGCC	2	10	10566	10575	0 %	0 %	40 %	60 %	125654614
18	NC_009007	GGCGG	2	10	14888	14897	0 %	0 %	80 %	20 %	125654619
19	NC_009007	GCCGC	2	10	15255	15264	0 %	0 %	40 %	60 %	125654619
20	NC_009007	CGCGG	2	10	16200	16209	0 %	0 %	60 %	40 %	125654620
21	NC_009007	CCCCG	2	10	16548	16557	0 %	0 %	20 %	80 %	125654620
22	NC_009007	GGGCG	2	10	17389	17398	0 %	0 %	80 %	20 %	125654621
23	NC_009007	CAGGG	2	10	18450	18459	20 %	0 %	60 %	20 %	125654621
24	NC_009007	GCAGC	2	10	18632	18641	20 %	0 %	40 %	40 %	125654621
25	NC_009007	TGGCG	2	10	19969	19978	0 %	20 %	60 %	20 %	125654622
26	NC_009007	AGCCG	2	10	19999	20008	20 %	0 %	40 %	40 %	125654622
27	NC_009007	GCCGG	2	10	20188	20197	0 %	0 %	60 %	40 %	125654622
28	NC_009007	GCTCG	2	10	21172	21181	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
29	NC_009007	GCTCG	2	10	21508	21517	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
30	NC_009007	GCTCG	2	10	21748	21757	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
31	NC_009007	GCTCG	2	10	22324	22333	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
32	NC_009007	GCTCG	2	10	22900	22909	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
33	NC_009007	GCTCG	2	10	23140	23149	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
34	NC_009007	CTCGG	2	10	23261	23270	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
35	NC_009007	GCTCG	2	10	23476	23485	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
36	NC_009007	GCTCG	2	10	23620	23629	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
37	NC_009007	CTCGG	2	10	24077	24086	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
38	NC_009007	GCTCG	2	10	24292	24301	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
39	NC_009007	CTCGG	2	10	24437	24446	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
40	NC_009007	GCTCG	2	10	24724	24733	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
41	NC_009007	CTCGG	2	10	24773	24782	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
42	NC_009007	CTCGG	2	10	24869	24878	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
43	NC_009007	GCTCG	2	10	25108	25117	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
44	NC_009007	CCGCC	2	10	26071	26080	0 %	0 %	20 %	80 %	125654624
45	NC_009007	CGGGG	2	10	29475	29484	0 %	0 %	80 %	20 %	125654625
46	NC_009007	GCCGG	2	10	29745	29754	0 %	0 %	60 %	40 %	125654625
47	NC_009007	GGGGC	2	10	29760	29769	0 %	0 %	80 %	20 %	125654625
48	NC_009007	CCGGG	2	10	30339	30348	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_009007	AGCGC	2	10	34642	34651	20 %	0 %	40 %	40 %	125654631
50	NC_009007	GGAGG	2	10	35519	35528	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009007	GTCTG	2	10	35682	35691	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009007	CCGCA	2	10	36533	36542	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_009007	GGCAG	2	10	36865	36874	20 %	0 %	60 %	20 %	125654633
54	NC_009007	CCCGG	2	10	37381	37390	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_009007	CGGGA	2	10	37488	37497	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_009007	CGGGC	2	10	38128	38137	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_009007	GGCCC	2	10	38164	38173	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_009007	CCCCT	2	10	38286	38295	0 %	20 %	0 %	80 %	125654635
59	NC_009007	GCCCG	2	10	41719	41728	0 %	0 %	40 %	60 %	125654638
60	NC_009007	GGGCC	2	10	42324	42333	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_009007	CGGGG	2	10	43206	43215	0 %	0 %	80 %	20 %	125654640
62	NC_009007	CCGCC	2	10	43384	43393	0 %	0 %	20 %	80 %	125654640
63	NC_009007	CGGTG	2	10	43546	43555	0 %	20 %	60 %	20 %	125654640
64	NC_009007	GGGAA	2	10	44027	44036	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009007	GGTCC	2	10	45122	45131	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_009007	CCCGC	2	10	45761	45770	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
67	NC_009007	GGCAG	2	10	47600	47609	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009007	GCCGG	2	10	48748	48757	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_009007	GCGCG	2	10	48852	48861	0 %	0 %	60 %	40 %	125654645
70	NC_009007	CGGGC	2	10	49218	49227	0 %	0 %	60 %	40 %	125654646
71	NC_009007	CAGGA	2	10	50226	50235	40 %	0 %	40 %	20 %	125654647
72	NC_009007	GGCCC	2	10	50340	50349	0 %	0 %	40 %	60 %	125654647
73	NC_009007	GGCGC	2	10	51943	51952	0 %	0 %	60 %	40 %	125654649
74	NC_009007	GACGA	2	10	52026	52035	40 %	0 %	40 %	20 %	125654649
75	NC_009007	TGATC	2	10	53396	53405	20 %	40 %	20 %	20 %	125654650
76	NC_009007	CGCGC	2	10	53471	53480	0 %	0 %	40 %	60 %	125654650
77	NC_009007	ACCCG	2	10	54455	54464	20 %	0 %	20 %	60 %	125654651
78	NC_009007	GGCGG	2	10	54880	54889	0 %	0 %	80 %	20 %	125654651
79	NC_009007	GCCGC	2	10	54915	54924	0 %	0 %	40 %	60 %	125654651
80	NC_009007	TCCGG	2	10	55049	55058	0 %	20 %	40 %	40 %	125654651
81	NC_009007	GGCCA	2	10	56967	56976	20 %	0 %	40 %	40 %	125654653
82	NC_009007	GCAGG	2	10	58584	58593	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009007	GAACC	2	10	58794	58803	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_009007	CGAAA	2	10	59324	59333	60 %	0 %	20 %	20 %	125654655
85	NC_009007	TGCCC	2	10	59761	59770	0 %	20 %	20 %	60 %	125654655
86	NC_009007	GGCCG	2	10	60679	60688	0 %	0 %	60 %	40 %	125654656
87	NC_009007	GCGCA	2	10	60959	60968	20 %	0 %	40 %	40 %	125654657
88	NC_009007	CAGCG	2	10	61455	61464	20 %	0 %	40 %	40 %	125654657
89	NC_009007	TCCTG	2	10	61666	61675	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_009007	TGCGC	2	10	64042	64051	0 %	20 %	40 %	40 %	125654659
91	NC_009007	GCCGC	2	10	64723	64732	0 %	0 %	40 %	60 %	125654660
92	NC_009007	GCCGC	2	10	67457	67466	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
93	NC_009007	CAGAT	2	10	67753	67762	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009007	TCTGG	3	15	67889	67903	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_009007	ATGGC	2	10	69041	69050	20 %	20 %	40 %	20 %	125654662
96	NC_009007	CGGCT	2	10	70073	70082	0 %	20 %	40 %	40 %	125654662
97	NC_009007	TGCGC	2	10	72261	72270	0 %	20 %	40 %	40 %	125654666
98	NC_009007	TTCCC	2	10	75923	75932	0 %	40 %	0 %	60 %	125654668
99	NC_009007	GACCT	2	10	76311	76320	20 %	20 %	20 %	40 %	125654669
100	NC_009007	GAGCC	2	10	77120	77129	20 %	0 %	40 %	40 %	125654669
101	NC_009007	GGAGT	2	10	77661	77670	20 %	20 %	60 %	0 %	125654669
102	NC_009007	GACAA	2	10	77739	77748	60 %	0 %	20 %	20 %	125654669
103	NC_009007	TCGGC	2	10	78449	78458	0 %	20 %	40 %	40 %	125654669
104	NC_009007	CCCCG	2	10	80554	80563	0 %	0 %	20 %	80 %	125654671
105	NC_009007	CCATC	2	10	81068	81077	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_009007	ACCGC	2	10	81081	81090	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_009007	CACCG	2	10	81128	81137	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_009007	CACCG	2	10	81160	81169	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_009007	CACCG	2	10	81192	81201	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_009007	CACCG	2	10	81224	81233	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_009007	CACCG	2	10	81256	81265	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_009007	CACCG	2	10	81288	81297	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_009007	CACCG	2	10	81320	81329	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_009007	CACCG	2	10	81352	81361	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_009007	CACCG	2	10	81384	81393	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_009007	CACCG	2	10	81416	81425	20 %	0 %	20 %	60 %	125654672
117	NC_009007	GGAGG	2	10	83303	83312	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009007	GACGG	2	10	83425	83434	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009007	GGAGG	2	10	83441	83450	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009007	GGAGG	2	10	83579	83588	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009007	GGAGG	2	10	83717	83726	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009007	GACGG	2	10	83839	83848	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009007	GGAGG	2	10	83855	83864	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009007	GGAGG	2	10	83993	84002	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009007	GACGG	2	10	84115	84124	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009007	GGAGG	2	10	84131	84140	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009007	GGAGG	2	10	84269	84278	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009007	GACGG	2	10	84391	84400	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009007	GGAGG	2	10	84407	84416	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009007	GGAGG	2	10	84545	84554	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009007	GCCGC	2	10	85546	85555	0 %	0 %	40 %	60 %	125654673
132	NC_009007	AAGCG	2	10	86674	86683	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009007	GGCCA	2	10	87557	87566	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_009007	TGCCG	2	10	88969	88978	0 %	20 %	40 %	40 %	125654674
135	NC_009007	GGCCG	2	10	89242	89251	0 %	0 %	60 %	40 %	125654674
136	NC_009007	AGCGC	2	10	89517	89526	20 %	0 %	40 %	40 %	125654674
137	NC_009007	CGCTG	2	10	89706	89715	0 %	20 %	40 %	40 %	125654674
138	NC_009007	CGGCG	2	10	92415	92424	0 %	0 %	60 %	40 %	125654675
139	NC_009007	CCCGC	2	10	92959	92968	0 %	0 %	20 %	80 %	125654676
140	NC_009007	CCCGG	2	10	95499	95508	0 %	0 %	40 %	60 %	125654678
141	NC_009007	CGCCC	2	10	95799	95808	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
142	NC_009007	TCCGG	2	10	96294	96303	0 %	20 %	40 %	40 %	125654679
143	NC_009007	GCGCG	2	10	96452	96461	0 %	0 %	60 %	40 %	125654680
144	NC_009007	CCCTG	2	10	98316	98325	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_009007	CTGTC	2	10	99980	99989	0 %	40 %	20 %	40 %	125654682
146	NC_009007	CGGCA	2	10	101864	101873	20 %	0 %	40 %	40 %	125654684
147	NC_009007	TCTCC	2	10	102413	102422	0 %	40 %	0 %	60 %	125654684
148	NC_009007	CAGAT	2	10	102717	102726	40 %	20 %	20 %	20 %	125654684
149	NC_009007	CCGGC	2	10	102871	102880	0 %	0 %	40 %	60 %	125654685
150	NC_009007	GTGGC	2	10	102915	102924	0 %	20 %	60 %	20 %	125654685
151	NC_009007	GCTCA	2	10	103789	103798	20 %	20 %	20 %	40 %	125654686
152	NC_009007	CGATC	2	10	104340	104349	20 %	20 %	20 %	40 %	125654686
153	NC_009007	CCGCC	2	10	105304	105313	0 %	0 %	20 %	80 %	125654687
154	NC_009007	CCGCC	3	15	105466	105480	0 %	0 %	20 %	80 %	125654687
155	NC_009007	AGCCG	2	10	105649	105658	20 %	0 %	40 %	40 %	125654687
156	NC_009007	CCCCG	2	10	105695	105704	0 %	0 %	20 %	80 %	125654687
157	NC_009007	GTCTG	2	10	106057	106066	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
158	NC_009007	CGTCC	2	10	106434	106443	0 %	20 %	20 %	60 %	125654688
159	NC_009007	CGGCC	2	10	106961	106970	0 %	0 %	40 %	60 %	125654688
160	NC_009007	CTGCC	2	10	107782	107791	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
161	NC_009007	TTCCA	2	10	110446	110455	20 %	40 %	0 %	40 %	125654690
162	NC_009007	GGCTC	2	10	110711	110720	0 %	20 %	40 %	40 %	125654691
163	NC_009007	ACCGC	2	10	111137	111146	20 %	0 %	20 %	60 %	125654691

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.