MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid A

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009007	GCCTC	2	10	2713	2722	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_009007	GGACC	2	10	6208	6217	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009007	GCCGC	2	10	7347	7356	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_009007	CCGGG	2	10	30339	30348	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009007	GGAGG	2	10	35519	35528	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009007	GTCTG	2	10	35682	35691	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009007	CCGCA	2	10	36533	36542	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_009007	CCCGG	2	10	37381	37390	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_009007	CGGGA	2	10	37488	37497	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009007	CGGGC	2	10	38128	38137	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009007	GGCCC	2	10	38164	38173	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_009007	GGGCC	2	10	42324	42333	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009007	GGGAA	2	10	44027	44036	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009007	GGTCC	2	10	45122	45131	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009007	CCCGC	2	10	45761	45770	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
16	NC_009007	GGCAG	2	10	47600	47609	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009007	GCCGG	2	10	48748	48757	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009007	GCAGG	2	10	58584	58593	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009007	GAACC	2	10	58794	58803	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009007	TCCTG	2	10	61666	61675	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009007	GCCGC	2	10	67457	67466	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_009007	CAGAT	2	10	67753	67762	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009007	TCTGG	3	15	67889	67903	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009007	CCATC	2	10	81068	81077	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_009007	ACCGC	2	10	81081	81090	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009007	CACCG	2	10	81128	81137	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_009007	CACCG	2	10	81160	81169	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_009007	CACCG	2	10	81192	81201	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_009007	CACCG	2	10	81224	81233	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_009007	CACCG	2	10	81256	81265	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_009007	CACCG	2	10	81288	81297	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_009007	CACCG	2	10	81320	81329	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_009007	CACCG	2	10	81352	81361	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_009007	CACCG	2	10	81384	81393	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_009007	GGAGG	2	10	83303	83312	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009007	GACGG	2	10	83425	83434	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009007	GGAGG	2	10	83441	83450	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009007	GGAGG	2	10	83579	83588	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009007	GGAGG	2	10	83717	83726	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009007	GACGG	2	10	83839	83848	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009007	GGAGG	2	10	83855	83864	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009007	GGAGG	2	10	83993	84002	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009007	GACGG	2	10	84115	84124	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009007	GGAGG	2	10	84131	84140	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009007	GGAGG	2	10	84269	84278	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009007	GACGG	2	10	84391	84400	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009007	GGAGG	2	10	84407	84416	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009007	GGAGG	2	10	84545	84554	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009007	AAGCG	2	10	86674	86683	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009007	GGCCA	2	10	87557	87566	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_009007	CGCCC	2	10	95799	95808	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
52	NC_009007	CCCTG	2	10	98316	98325	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_009007	GTCTG	2	10	106057	106066	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009007	CTGCC	2	10	107782	107791	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.