MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid A

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009007	CGGGC	2	10	518	527	0 %	0 %	60 %	40 %	125654606
2	NC_009007	CGCGG	2	10	723	732	0 %	0 %	60 %	40 %	125654606
3	NC_009007	GAGCG	2	10	2368	2377	20 %	0 %	60 %	20 %	125654607
4	NC_009007	GGCCC	2	10	2637	2646	0 %	0 %	40 %	60 %	125654607
5	NC_009007	CGGCG	2	10	3282	3291	0 %	0 %	60 %	40 %	125654608
6	NC_009007	AGCGC	2	10	3389	3398	20 %	0 %	40 %	40 %	125654608
7	NC_009007	GGCCG	2	10	4032	4041	0 %	0 %	60 %	40 %	125654608
8	NC_009007	TCGAA	2	10	4617	4626	40 %	20 %	20 %	20 %	125654609
9	NC_009007	TGCCC	2	10	6393	6402	0 %	20 %	20 %	60 %	125654610
10	NC_009007	CGCGG	2	10	7701	7710	0 %	0 %	60 %	40 %	125654611
11	NC_009007	GCGCC	2	10	8198	8207	0 %	0 %	40 %	60 %	125654611
12	NC_009007	TCGGC	2	10	8977	8986	0 %	20 %	40 %	40 %	125654613
13	NC_009007	CGGGC	2	10	9212	9221	0 %	0 %	60 %	40 %	125654613
14	NC_009007	CGGCC	2	10	10566	10575	0 %	0 %	40 %	60 %	125654614
15	NC_009007	GGCGG	2	10	14888	14897	0 %	0 %	80 %	20 %	125654619
16	NC_009007	GCCGC	2	10	15255	15264	0 %	0 %	40 %	60 %	125654619
17	NC_009007	CGCGG	2	10	16200	16209	0 %	0 %	60 %	40 %	125654620
18	NC_009007	CCCCG	2	10	16548	16557	0 %	0 %	20 %	80 %	125654620
19	NC_009007	GGGCG	2	10	17389	17398	0 %	0 %	80 %	20 %	125654621
20	NC_009007	CAGGG	2	10	18450	18459	20 %	0 %	60 %	20 %	125654621
21	NC_009007	GCAGC	2	10	18632	18641	20 %	0 %	40 %	40 %	125654621
22	NC_009007	TGGCG	2	10	19969	19978	0 %	20 %	60 %	20 %	125654622
23	NC_009007	AGCCG	2	10	19999	20008	20 %	0 %	40 %	40 %	125654622
24	NC_009007	GCCGG	2	10	20188	20197	0 %	0 %	60 %	40 %	125654622
25	NC_009007	GCTCG	2	10	21172	21181	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
26	NC_009007	GCTCG	2	10	21508	21517	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
27	NC_009007	GCTCG	2	10	21748	21757	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
28	NC_009007	GCTCG	2	10	22324	22333	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
29	NC_009007	GCTCG	2	10	22900	22909	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
30	NC_009007	GCTCG	2	10	23140	23149	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
31	NC_009007	CTCGG	2	10	23261	23270	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
32	NC_009007	GCTCG	2	10	23476	23485	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
33	NC_009007	GCTCG	2	10	23620	23629	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
34	NC_009007	CTCGG	2	10	24077	24086	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
35	NC_009007	GCTCG	2	10	24292	24301	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
36	NC_009007	CTCGG	2	10	24437	24446	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
37	NC_009007	GCTCG	2	10	24724	24733	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
38	NC_009007	CTCGG	2	10	24773	24782	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
39	NC_009007	CTCGG	2	10	24869	24878	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
40	NC_009007	GCTCG	2	10	25108	25117	0 %	20 %	40 %	40 %	125654623
41	NC_009007	CCGCC	2	10	26071	26080	0 %	0 %	20 %	80 %	125654624
42	NC_009007	CGGGG	2	10	29475	29484	0 %	0 %	80 %	20 %	125654625
43	NC_009007	GCCGG	2	10	29745	29754	0 %	0 %	60 %	40 %	125654625
44	NC_009007	GGGGC	2	10	29760	29769	0 %	0 %	80 %	20 %	125654625
45	NC_009007	AGCGC	2	10	34642	34651	20 %	0 %	40 %	40 %	125654631
46	NC_009007	GGCAG	2	10	36865	36874	20 %	0 %	60 %	20 %	125654633
47	NC_009007	CCCCT	2	10	38286	38295	0 %	20 %	0 %	80 %	125654635
48	NC_009007	GCCCG	2	10	41719	41728	0 %	0 %	40 %	60 %	125654638
49	NC_009007	CGGGG	2	10	43206	43215	0 %	0 %	80 %	20 %	125654640
50	NC_009007	CCGCC	2	10	43384	43393	0 %	0 %	20 %	80 %	125654640
51	NC_009007	CGGTG	2	10	43546	43555	0 %	20 %	60 %	20 %	125654640
52	NC_009007	GCGCG	2	10	48852	48861	0 %	0 %	60 %	40 %	125654645
53	NC_009007	CGGGC	2	10	49218	49227	0 %	0 %	60 %	40 %	125654646
54	NC_009007	CAGGA	2	10	50226	50235	40 %	0 %	40 %	20 %	125654647
55	NC_009007	GGCCC	2	10	50340	50349	0 %	0 %	40 %	60 %	125654647
56	NC_009007	GGCGC	2	10	51943	51952	0 %	0 %	60 %	40 %	125654649
57	NC_009007	GACGA	2	10	52026	52035	40 %	0 %	40 %	20 %	125654649
58	NC_009007	TGATC	2	10	53396	53405	20 %	40 %	20 %	20 %	125654650
59	NC_009007	CGCGC	2	10	53471	53480	0 %	0 %	40 %	60 %	125654650
60	NC_009007	ACCCG	2	10	54455	54464	20 %	0 %	20 %	60 %	125654651
61	NC_009007	GGCGG	2	10	54880	54889	0 %	0 %	80 %	20 %	125654651
62	NC_009007	GCCGC	2	10	54915	54924	0 %	0 %	40 %	60 %	125654651
63	NC_009007	TCCGG	2	10	55049	55058	0 %	20 %	40 %	40 %	125654651
64	NC_009007	GGCCA	2	10	56967	56976	20 %	0 %	40 %	40 %	125654653
65	NC_009007	CGAAA	2	10	59324	59333	60 %	0 %	20 %	20 %	125654655
66	NC_009007	TGCCC	2	10	59761	59770	0 %	20 %	20 %	60 %	125654655
67	NC_009007	GGCCG	2	10	60679	60688	0 %	0 %	60 %	40 %	125654656
68	NC_009007	GCGCA	2	10	60959	60968	20 %	0 %	40 %	40 %	125654657
69	NC_009007	CAGCG	2	10	61455	61464	20 %	0 %	40 %	40 %	125654657
70	NC_009007	TGCGC	2	10	64042	64051	0 %	20 %	40 %	40 %	125654659
71	NC_009007	GCCGC	2	10	64723	64732	0 %	0 %	40 %	60 %	125654660
72	NC_009007	ATGGC	2	10	69041	69050	20 %	20 %	40 %	20 %	125654662
73	NC_009007	CGGCT	2	10	70073	70082	0 %	20 %	40 %	40 %	125654662
74	NC_009007	TGCGC	2	10	72261	72270	0 %	20 %	40 %	40 %	125654666
75	NC_009007	TTCCC	2	10	75923	75932	0 %	40 %	0 %	60 %	125654668
76	NC_009007	GACCT	2	10	76311	76320	20 %	20 %	20 %	40 %	125654669
77	NC_009007	GAGCC	2	10	77120	77129	20 %	0 %	40 %	40 %	125654669
78	NC_009007	GGAGT	2	10	77661	77670	20 %	20 %	60 %	0 %	125654669
79	NC_009007	GACAA	2	10	77739	77748	60 %	0 %	20 %	20 %	125654669
80	NC_009007	TCGGC	2	10	78449	78458	0 %	20 %	40 %	40 %	125654669
81	NC_009007	CCCCG	2	10	80554	80563	0 %	0 %	20 %	80 %	125654671
82	NC_009007	CACCG	2	10	81416	81425	20 %	0 %	20 %	60 %	125654672
83	NC_009007	GCCGC	2	10	85546	85555	0 %	0 %	40 %	60 %	125654673
84	NC_009007	TGCCG	2	10	88969	88978	0 %	20 %	40 %	40 %	125654674
85	NC_009007	GGCCG	2	10	89242	89251	0 %	0 %	60 %	40 %	125654674
86	NC_009007	AGCGC	2	10	89517	89526	20 %	0 %	40 %	40 %	125654674
87	NC_009007	CGCTG	2	10	89706	89715	0 %	20 %	40 %	40 %	125654674
88	NC_009007	CGGCG	2	10	92415	92424	0 %	0 %	60 %	40 %	125654675
89	NC_009007	CCCGC	2	10	92959	92968	0 %	0 %	20 %	80 %	125654676
90	NC_009007	CCCGG	2	10	95499	95508	0 %	0 %	40 %	60 %	125654678
91	NC_009007	TCCGG	2	10	96294	96303	0 %	20 %	40 %	40 %	125654679
92	NC_009007	GCGCG	2	10	96452	96461	0 %	0 %	60 %	40 %	125654680
93	NC_009007	CTGTC	2	10	99980	99989	0 %	40 %	20 %	40 %	125654682
94	NC_009007	CGGCA	2	10	101864	101873	20 %	0 %	40 %	40 %	125654684
95	NC_009007	TCTCC	2	10	102413	102422	0 %	40 %	0 %	60 %	125654684
96	NC_009007	CAGAT	2	10	102717	102726	40 %	20 %	20 %	20 %	125654684
97	NC_009007	CCGGC	2	10	102871	102880	0 %	0 %	40 %	60 %	125654685
98	NC_009007	GTGGC	2	10	102915	102924	0 %	20 %	60 %	20 %	125654685
99	NC_009007	GCTCA	2	10	103789	103798	20 %	20 %	20 %	40 %	125654686
100	NC_009007	CGATC	2	10	104340	104349	20 %	20 %	20 %	40 %	125654686
101	NC_009007	CCGCC	2	10	105304	105313	0 %	0 %	20 %	80 %	125654687
102	NC_009007	CCGCC	3	15	105466	105480	0 %	0 %	20 %	80 %	125654687
103	NC_009007	AGCCG	2	10	105649	105658	20 %	0 %	40 %	40 %	125654687
104	NC_009007	CCCCG	2	10	105695	105704	0 %	0 %	20 %	80 %	125654687
105	NC_009007	CGTCC	2	10	106434	106443	0 %	20 %	20 %	60 %	125654688
106	NC_009007	CGGCC	2	10	106961	106970	0 %	0 %	40 %	60 %	125654688
107	NC_009007	TTCCA	2	10	110446	110455	20 %	40 %	0 %	40 %	125654690
108	NC_009007	GGCTC	2	10	110711	110720	0 %	20 %	40 %	40 %	125654691
109	NC_009007	ACCGC	2	10	111137	111146	20 %	0 %	20 %	60 %	125654691

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.