MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid A

Total Repeats: 396

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009007	CCGG	2	8	595	602	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
2	NC_009007	GGCG	2	8	606	613	0 %	0 %	75 %	25 %	125654606
3	NC_009007	AGGC	2	8	641	648	25 %	0 %	50 %	25 %	125654606
4	NC_009007	GCCG	2	8	702	709	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
5	NC_009007	GGGC	2	8	891	898	0 %	0 %	75 %	25 %	125654606
6	NC_009007	GAAC	2	8	1476	1483	50 %	0 %	25 %	25 %	125654606
7	NC_009007	GGGC	2	8	1977	1984	0 %	0 %	75 %	25 %	125654607
8	NC_009007	GCGG	2	8	2622	2629	0 %	0 %	75 %	25 %	125654607
9	NC_009007	CGAG	2	8	2658	2665	25 %	0 %	50 %	25 %	125654607
10	NC_009007	CGCT	2	8	2810	2817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009007	TCGC	2	8	2983	2990	0 %	25 %	25 %	50 %	125654608
12	NC_009007	CGGA	2	8	3191	3198	25 %	0 %	50 %	25 %	125654608
13	NC_009007	GGCC	2	8	3557	3564	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
14	NC_009007	CCGG	2	8	3614	3621	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
15	NC_009007	AGCC	2	8	3832	3839	25 %	0 %	25 %	50 %	125654608
16	NC_009007	GCGG	2	8	3888	3895	0 %	0 %	75 %	25 %	125654608
17	NC_009007	AGGA	2	8	4631	4638	50 %	0 %	50 %	0 %	125654609
18	NC_009007	GGCG	2	8	5007	5014	0 %	0 %	75 %	25 %	125654609
19	NC_009007	GATC	2	8	5091	5098	25 %	25 %	25 %	25 %	125654609
20	NC_009007	GGCA	2	8	5200	5207	25 %	0 %	50 %	25 %	125654609
21	NC_009007	GCCT	2	8	5834	5841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009007	AGTT	2	8	5847	5854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009007	GGAC	2	8	6032	6039	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009007	CCGG	2	8	6229	6236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009007	CCAC	2	8	6644	6651	25 %	0 %	0 %	75 %	125654610
26	NC_009007	GGGC	2	8	6738	6745	0 %	0 %	75 %	25 %	125654610
27	NC_009007	GGGC	2	8	6804	6811	0 %	0 %	75 %	25 %	125654610
28	NC_009007	CCGC	2	8	7814	7821	0 %	0 %	25 %	75 %	125654611
29	NC_009007	CTGG	2	8	8282	8289	0 %	25 %	50 %	25 %	125654611
30	NC_009007	GATC	2	8	8492	8499	25 %	25 %	25 %	25 %	125654612
31	NC_009007	GGTG	2	8	8665	8672	0 %	25 %	75 %	0 %	125654612
32	NC_009007	CGCC	2	8	8696	8703	0 %	0 %	25 %	75 %	125654612
33	NC_009007	CCAC	2	8	9148	9155	25 %	0 %	0 %	75 %	125654613
34	NC_009007	TCGA	2	8	9204	9211	25 %	25 %	25 %	25 %	125654613
35	NC_009007	TGGG	2	8	9282	9289	0 %	25 %	75 %	0 %	125654613
36	NC_009007	CGAC	2	8	9328	9335	25 %	0 %	25 %	50 %	125654613
37	NC_009007	GACC	2	8	9788	9795	25 %	0 %	25 %	50 %	125654613
38	NC_009007	CGAC	2	8	10263	10270	25 %	0 %	25 %	50 %	125654614
39	NC_009007	GGGC	2	8	10504	10511	0 %	0 %	75 %	25 %	125654614
40	NC_009007	GCCT	2	8	10538	10545	0 %	25 %	25 %	50 %	125654614
41	NC_009007	CCGG	2	8	10714	10721	0 %	0 %	50 %	50 %	125654614
42	NC_009007	ATCT	2	8	11443	11450	25 %	50 %	0 %	25 %	125654615
43	NC_009007	ACCG	2	8	11695	11702	25 %	0 %	25 %	50 %	125654615
44	NC_009007	CCCG	2	8	12075	12082	0 %	0 %	25 %	75 %	125654616
45	NC_009007	GGGC	2	8	12270	12277	0 %	0 %	75 %	25 %	125654616
46	NC_009007	CCGG	2	8	12363	12370	0 %	0 %	50 %	50 %	125654616
47	NC_009007	CGCC	2	8	12691	12698	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_009007	CCGA	2	8	12920	12927	25 %	0 %	25 %	50 %	125654617
49	NC_009007	GCCG	2	8	13366	13373	0 %	0 %	50 %	50 %	125654617
50	NC_009007	GCGA	2	8	13428	13435	25 %	0 %	50 %	25 %	125654617
51	NC_009007	GACC	2	8	14137	14144	25 %	0 %	25 %	50 %	125654618
52	NC_009007	GGGC	2	8	14410	14417	0 %	0 %	75 %	25 %	125654618
53	NC_009007	TCGC	2	8	14594	14601	0 %	25 %	25 %	50 %	125654618
54	NC_009007	GGCC	2	8	14741	14748	0 %	0 %	50 %	50 %	125654619
55	NC_009007	CGTC	2	8	14775	14782	0 %	25 %	25 %	50 %	125654619
56	NC_009007	GGCG	2	8	14824	14831	0 %	0 %	75 %	25 %	125654619
57	NC_009007	CCCG	2	8	15640	15647	0 %	0 %	25 %	75 %	125654620
58	NC_009007	GCCC	2	8	15752	15759	0 %	0 %	25 %	75 %	125654620
59	NC_009007	GCCG	2	8	16114	16121	0 %	0 %	50 %	50 %	125654620
60	NC_009007	CCCG	2	8	17524	17531	0 %	0 %	25 %	75 %	125654621
61	NC_009007	CGGG	2	8	17727	17734	0 %	0 %	75 %	25 %	125654621
62	NC_009007	CCGG	2	8	18419	18426	0 %	0 %	50 %	50 %	125654621
63	NC_009007	CCCG	2	8	18521	18528	0 %	0 %	25 %	75 %	125654621
64	NC_009007	GCCC	2	8	18550	18557	0 %	0 %	25 %	75 %	125654621
65	NC_009007	CGGG	2	8	18872	18879	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009007	TCCC	2	8	18887	18894	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_009007	GGGC	2	8	19030	19037	0 %	0 %	75 %	25 %	125654622
68	NC_009007	GCGG	2	8	19292	19299	0 %	0 %	75 %	25 %	125654622
69	NC_009007	CGGC	2	8	19356	19363	0 %	0 %	50 %	50 %	125654622
70	NC_009007	GACC	2	8	19406	19413	25 %	0 %	25 %	50 %	125654622
71	NC_009007	GGGC	2	8	19711	19718	0 %	0 %	75 %	25 %	125654622
72	NC_009007	CCGG	2	8	19735	19742	0 %	0 %	50 %	50 %	125654622
73	NC_009007	GATC	2	8	19765	19772	25 %	25 %	25 %	25 %	125654622
74	NC_009007	CCGG	2	8	20031	20038	0 %	0 %	50 %	50 %	125654622
75	NC_009007	GGGC	2	8	20692	20699	0 %	0 %	75 %	25 %	125654622
76	NC_009007	TGCG	2	8	20932	20939	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009007	GGCG	2	8	22195	22202	0 %	0 %	75 %	25 %	125654623
78	NC_009007	CGCC	2	8	26340	26347	0 %	0 %	25 %	75 %	125654624
79	NC_009007	CGGG	2	8	26966	26973	0 %	0 %	75 %	25 %	125654624
80	NC_009007	CCGA	2	8	27087	27094	25 %	0 %	25 %	50 %	125654624
81	NC_009007	GTCG	2	8	27371	27378	0 %	25 %	50 %	25 %	125654624
82	NC_009007	CGCC	2	8	27541	27548	0 %	0 %	25 %	75 %	125654624
83	NC_009007	CGGT	2	8	27687	27694	0 %	25 %	50 %	25 %	125654624
84	NC_009007	GTCG	2	8	28049	28056	0 %	25 %	50 %	25 %	125654624
85	NC_009007	CGCC	2	8	28219	28226	0 %	0 %	25 %	75 %	125654624
86	NC_009007	CGCC	2	8	28321	28328	0 %	0 %	25 %	75 %	125654624
87	NC_009007	CGGT	2	8	28365	28372	0 %	25 %	50 %	25 %	125654624
88	NC_009007	GCCC	2	8	28411	28418	0 %	0 %	25 %	75 %	125654624
89	NC_009007	GGGC	2	8	28732	28739	0 %	0 %	75 %	25 %	125654624
90	NC_009007	CGGG	2	8	29039	29046	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009007	CCCT	2	8	29066	29073	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_009007	GCCT	2	8	29341	29348	0 %	25 %	25 %	50 %	125654625
93	NC_009007	CGCC	2	8	29941	29948	0 %	0 %	25 %	75 %	125654626
94	NC_009007	CAGG	2	8	29971	29978	25 %	0 %	50 %	25 %	125654626
95	NC_009007	CGGG	2	8	30069	30076	0 %	0 %	75 %	25 %	125654626
96	NC_009007	GCGA	2	8	30180	30187	25 %	0 %	50 %	25 %	125654626
97	NC_009007	GAGC	2	8	30188	30195	25 %	0 %	50 %	25 %	125654626
98	NC_009007	CCGC	2	8	30314	30321	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_009007	GTCC	2	8	30388	30395	0 %	25 %	25 %	50 %	125654627
100	NC_009007	GGGC	2	8	30398	30405	0 %	0 %	75 %	25 %	125654627
101	NC_009007	TCCT	2	8	30560	30567	0 %	50 %	0 %	50 %	125654627
102	NC_009007	CGGG	2	8	30772	30779	0 %	0 %	75 %	25 %	125654627
103	NC_009007	GGTG	2	8	31100	31107	0 %	25 %	75 %	0 %	125654627
104	NC_009007	CCGC	2	8	33579	33586	0 %	0 %	25 %	75 %	125654630
105	NC_009007	GCGG	2	8	33951	33958	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009007	GCCG	2	8	34093	34100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009007	TCGG	2	8	34962	34969	0 %	25 %	50 %	25 %	125654631
108	NC_009007	CGGG	2	8	35537	35544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009007	TCGG	2	8	35618	35625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009007	CCCG	2	8	35837	35844	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_009007	CGGG	2	8	36142	36149	0 %	0 %	75 %	25 %	125654632
112	NC_009007	GCCC	2	8	36295	36302	0 %	0 %	25 %	75 %	125654632
113	NC_009007	CAGC	2	8	36313	36320	25 %	0 %	25 %	50 %	125654632
114	NC_009007	GCCT	2	8	36628	36635	0 %	25 %	25 %	50 %	125654633
115	NC_009007	GCTC	2	8	36907	36914	0 %	25 %	25 %	50 %	125654633
116	NC_009007	GCCA	2	8	37145	37152	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009007	AAGA	2	8	37179	37186	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009007	TTCA	2	8	37967	37974	25 %	50 %	0 %	25 %	125654634
119	NC_009007	CGGG	2	8	38784	38791	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009007	GCGG	2	8	39510	39517	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009007	GCCG	2	8	39593	39600	0 %	0 %	50 %	50 %	125654637
122	NC_009007	AGCG	2	8	39622	39629	25 %	0 %	50 %	25 %	125654637
123	NC_009007	CGCC	2	8	40861	40868	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_009007	CCGG	2	8	41462	41469	0 %	0 %	50 %	50 %	125654638
125	NC_009007	CGAG	2	8	41628	41635	25 %	0 %	50 %	25 %	125654638
126	NC_009007	TCCA	2	8	41834	41841	25 %	25 %	0 %	50 %	125654638
127	NC_009007	CGGC	2	8	41868	41875	0 %	0 %	50 %	50 %	125654638
128	NC_009007	CGGG	2	8	42625	42632	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009007	CGGG	2	8	42916	42923	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009007	GGAT	2	8	43281	43288	25 %	25 %	50 %	0 %	125654640
131	NC_009007	CGGG	2	8	43354	43361	0 %	0 %	75 %	25 %	125654640
132	NC_009007	GCGA	2	8	43416	43423	25 %	0 %	50 %	25 %	125654640
133	NC_009007	CGCC	2	8	43492	43499	0 %	0 %	25 %	75 %	125654640
134	NC_009007	CGCC	2	8	43864	43871	0 %	0 %	25 %	75 %	125654640
135	NC_009007	CGTC	2	8	44615	44622	0 %	25 %	25 %	50 %	125654641
136	NC_009007	GGGC	2	8	44646	44653	0 %	0 %	75 %	25 %	125654641
137	NC_009007	CGGC	2	8	45028	45035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009007	GCCC	2	8	45273	45280	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_009007	CATC	2	8	45373	45380	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009007	CCGG	2	8	45424	45431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009007	TCCG	2	8	45658	45665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009007	GGCG	2	8	45899	45906	0 %	0 %	75 %	25 %	125654642
143	NC_009007	GGGC	2	8	46085	46092	0 %	0 %	75 %	25 %	125654642
144	NC_009007	CCGC	2	8	46663	46670	0 %	0 %	25 %	75 %	125654643
145	NC_009007	GCCC	2	8	46689	46696	0 %	0 %	25 %	75 %	125654643
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.