MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid A

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009007	CGCT	2	8	2810	2817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009007	GCCT	2	8	5834	5841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009007	AGTT	2	8	5847	5854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009007	GGAC	2	8	6032	6039	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009007	CCGG	2	8	6229	6236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009007	CGCC	2	8	12691	12698	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_009007	CGGG	2	8	18872	18879	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009007	TCCC	2	8	18887	18894	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_009007	TGCG	2	8	20932	20939	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009007	CGGG	2	8	29039	29046	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009007	CCCT	2	8	29066	29073	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_009007	CCGC	2	8	30314	30321	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_009007	GCGG	2	8	33951	33958	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009007	GCCG	2	8	34093	34100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009007	CGGG	2	8	35537	35544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009007	TCGG	2	8	35618	35625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009007	CCCG	2	8	35837	35844	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_009007	GCCA	2	8	37145	37152	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009007	AAGA	2	8	37179	37186	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009007	CGGG	2	8	38784	38791	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009007	GCGG	2	8	39510	39517	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009007	CGCC	2	8	40861	40868	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_009007	CGGG	2	8	42625	42632	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009007	CGGG	2	8	42916	42923	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009007	CGGC	2	8	45028	45035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009007	GCCC	2	8	45273	45280	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_009007	CATC	2	8	45373	45380	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009007	CCGG	2	8	45424	45431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009007	TCCG	2	8	45658	45665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009007	ATGG	2	8	47506	47513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009007	GCCC	2	8	47667	47674	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_009007	TCCC	2	8	56499	56506	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_009007	GGGC	2	8	58684	58691	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009007	CCGG	2	8	58834	58841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009007	CCGG	2	8	58920	58927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009007	GAGG	2	8	65240	65247	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009007	TTGG	2	8	65332	65339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009007	GGAT	2	8	65729	65736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009007	GCCG	2	8	65864	65871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009007	ACGC	2	8	66125	66132	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009007	CGGT	2	8	66996	67003	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009007	AGCG	2	8	67300	67307	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009007	GATC	2	8	67355	67362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009007	TCGG	2	8	67561	67568	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009007	GGAT	2	8	67636	67643	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009007	GCTG	2	8	67720	67727	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009007	ACCG	2	8	68011	68018	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009007	AGAC	2	8	68260	68267	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009007	GGCG	2	8	68521	68528	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009007	GGCG	2	8	68663	68670	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009007	AGGT	2	8	70919	70926	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009007	GCCG	2	8	83324	83331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009007	GCCG	2	8	83462	83469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009007	GCCG	2	8	83600	83607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009007	GCCG	2	8	83738	83745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009007	GCCG	2	8	83876	83883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009007	GCCG	2	8	84014	84021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009007	GCCG	2	8	84152	84159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009007	GCCG	2	8	84290	84297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009007	GCCG	2	8	84428	84435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009007	GCCG	2	8	84566	84573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009007	CTGC	2	8	85720	85727	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009007	TTCG	2	8	86449	86456	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009007	CGGC	2	8	87009	87016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009007	TCAC	2	8	87121	87128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009007	CTGC	2	8	87453	87460	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009007	TCGC	2	8	87518	87525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009007	GCAC	3	12	87850	87861	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009007	CCCG	2	8	88294	88301	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_009007	AGCC	2	8	90661	90668	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009007	CGCT	2	8	90804	90811	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009007	CGGA	2	8	91192	91199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009007	CGGC	2	8	91364	91371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009007	GCGG	2	8	91445	91452	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009007	GGCG	2	8	94921	94928	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009007	TCCC	2	8	94958	94965	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_009007	AAGG	2	8	95823	95830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009007	GCCC	2	8	98509	98516	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_009007	CCCG	2	8	98553	98560	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_009007	CGAC	2	8	98707	98714	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009007	CGGA	2	8	98935	98942	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009007	CGGG	2	8	99180	99187	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009007	GCCG	2	8	99270	99277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009007	CGGG	2	8	99298	99305	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009007	TGCG	2	8	99626	99633	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009007	AAGG	2	8	100374	100381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009007	CGGG	2	8	100478	100485	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009007	CGTC	2	8	100518	100525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009007	CGCC	2	8	100587	100594	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_009007	GCCG	2	8	105053	105060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009007	GGGC	2	8	106175	106182	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009007	CTGC	2	8	107925	107932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009007	CCAG	2	8	108071	108078	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009007	AATG	2	8	112871	112878	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009007	CGTC	2	8	113749	113756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009007	CGCC	2	8	113989	113996	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_009007	CGGC	2	8	114018	114025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.