MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid A

Total Repeats: 299

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009007	CCGG	2	8	595	602	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
2	NC_009007	GGCG	2	8	606	613	0 %	0 %	75 %	25 %	125654606
3	NC_009007	AGGC	2	8	641	648	25 %	0 %	50 %	25 %	125654606
4	NC_009007	GCCG	2	8	702	709	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
5	NC_009007	GGGC	2	8	891	898	0 %	0 %	75 %	25 %	125654606
6	NC_009007	GAAC	2	8	1476	1483	50 %	0 %	25 %	25 %	125654606
7	NC_009007	GGGC	2	8	1977	1984	0 %	0 %	75 %	25 %	125654607
8	NC_009007	GCGG	2	8	2622	2629	0 %	0 %	75 %	25 %	125654607
9	NC_009007	CGAG	2	8	2658	2665	25 %	0 %	50 %	25 %	125654607
10	NC_009007	TCGC	2	8	2983	2990	0 %	25 %	25 %	50 %	125654608
11	NC_009007	CGGA	2	8	3191	3198	25 %	0 %	50 %	25 %	125654608
12	NC_009007	GGCC	2	8	3557	3564	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
13	NC_009007	CCGG	2	8	3614	3621	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
14	NC_009007	AGCC	2	8	3832	3839	25 %	0 %	25 %	50 %	125654608
15	NC_009007	GCGG	2	8	3888	3895	0 %	0 %	75 %	25 %	125654608
16	NC_009007	AGGA	2	8	4631	4638	50 %	0 %	50 %	0 %	125654609
17	NC_009007	GGCG	2	8	5007	5014	0 %	0 %	75 %	25 %	125654609
18	NC_009007	GATC	2	8	5091	5098	25 %	25 %	25 %	25 %	125654609
19	NC_009007	GGCA	2	8	5200	5207	25 %	0 %	50 %	25 %	125654609
20	NC_009007	CCAC	2	8	6644	6651	25 %	0 %	0 %	75 %	125654610
21	NC_009007	GGGC	2	8	6738	6745	0 %	0 %	75 %	25 %	125654610
22	NC_009007	GGGC	2	8	6804	6811	0 %	0 %	75 %	25 %	125654610
23	NC_009007	CCGC	2	8	7814	7821	0 %	0 %	25 %	75 %	125654611
24	NC_009007	CTGG	2	8	8282	8289	0 %	25 %	50 %	25 %	125654611
25	NC_009007	GATC	2	8	8492	8499	25 %	25 %	25 %	25 %	125654612
26	NC_009007	GGTG	2	8	8665	8672	0 %	25 %	75 %	0 %	125654612
27	NC_009007	CGCC	2	8	8696	8703	0 %	0 %	25 %	75 %	125654612
28	NC_009007	CCAC	2	8	9148	9155	25 %	0 %	0 %	75 %	125654613
29	NC_009007	TCGA	2	8	9204	9211	25 %	25 %	25 %	25 %	125654613
30	NC_009007	TGGG	2	8	9282	9289	0 %	25 %	75 %	0 %	125654613
31	NC_009007	CGAC	2	8	9328	9335	25 %	0 %	25 %	50 %	125654613
32	NC_009007	GACC	2	8	9788	9795	25 %	0 %	25 %	50 %	125654613
33	NC_009007	CGAC	2	8	10263	10270	25 %	0 %	25 %	50 %	125654614
34	NC_009007	GGGC	2	8	10504	10511	0 %	0 %	75 %	25 %	125654614
35	NC_009007	GCCT	2	8	10538	10545	0 %	25 %	25 %	50 %	125654614
36	NC_009007	CCGG	2	8	10714	10721	0 %	0 %	50 %	50 %	125654614
37	NC_009007	ATCT	2	8	11443	11450	25 %	50 %	0 %	25 %	125654615
38	NC_009007	ACCG	2	8	11695	11702	25 %	0 %	25 %	50 %	125654615
39	NC_009007	CCCG	2	8	12075	12082	0 %	0 %	25 %	75 %	125654616
40	NC_009007	GGGC	2	8	12270	12277	0 %	0 %	75 %	25 %	125654616
41	NC_009007	CCGG	2	8	12363	12370	0 %	0 %	50 %	50 %	125654616
42	NC_009007	CCGA	2	8	12920	12927	25 %	0 %	25 %	50 %	125654617
43	NC_009007	GCCG	2	8	13366	13373	0 %	0 %	50 %	50 %	125654617
44	NC_009007	GCGA	2	8	13428	13435	25 %	0 %	50 %	25 %	125654617
45	NC_009007	GACC	2	8	14137	14144	25 %	0 %	25 %	50 %	125654618
46	NC_009007	GGGC	2	8	14410	14417	0 %	0 %	75 %	25 %	125654618
47	NC_009007	TCGC	2	8	14594	14601	0 %	25 %	25 %	50 %	125654618
48	NC_009007	GGCC	2	8	14741	14748	0 %	0 %	50 %	50 %	125654619
49	NC_009007	CGTC	2	8	14775	14782	0 %	25 %	25 %	50 %	125654619
50	NC_009007	GGCG	2	8	14824	14831	0 %	0 %	75 %	25 %	125654619
51	NC_009007	CCCG	2	8	15640	15647	0 %	0 %	25 %	75 %	125654620
52	NC_009007	GCCC	2	8	15752	15759	0 %	0 %	25 %	75 %	125654620
53	NC_009007	GCCG	2	8	16114	16121	0 %	0 %	50 %	50 %	125654620
54	NC_009007	CCCG	2	8	17524	17531	0 %	0 %	25 %	75 %	125654621
55	NC_009007	CGGG	2	8	17727	17734	0 %	0 %	75 %	25 %	125654621
56	NC_009007	CCGG	2	8	18419	18426	0 %	0 %	50 %	50 %	125654621
57	NC_009007	CCCG	2	8	18521	18528	0 %	0 %	25 %	75 %	125654621
58	NC_009007	GCCC	2	8	18550	18557	0 %	0 %	25 %	75 %	125654621
59	NC_009007	GGGC	2	8	19030	19037	0 %	0 %	75 %	25 %	125654622
60	NC_009007	GCGG	2	8	19292	19299	0 %	0 %	75 %	25 %	125654622
61	NC_009007	CGGC	2	8	19356	19363	0 %	0 %	50 %	50 %	125654622
62	NC_009007	GACC	2	8	19406	19413	25 %	0 %	25 %	50 %	125654622
63	NC_009007	GGGC	2	8	19711	19718	0 %	0 %	75 %	25 %	125654622
64	NC_009007	CCGG	2	8	19735	19742	0 %	0 %	50 %	50 %	125654622
65	NC_009007	GATC	2	8	19765	19772	25 %	25 %	25 %	25 %	125654622
66	NC_009007	CCGG	2	8	20031	20038	0 %	0 %	50 %	50 %	125654622
67	NC_009007	GGGC	2	8	20692	20699	0 %	0 %	75 %	25 %	125654622
68	NC_009007	GGCG	2	8	22195	22202	0 %	0 %	75 %	25 %	125654623
69	NC_009007	CGCC	2	8	26340	26347	0 %	0 %	25 %	75 %	125654624
70	NC_009007	CGGG	2	8	26966	26973	0 %	0 %	75 %	25 %	125654624
71	NC_009007	CCGA	2	8	27087	27094	25 %	0 %	25 %	50 %	125654624
72	NC_009007	GTCG	2	8	27371	27378	0 %	25 %	50 %	25 %	125654624
73	NC_009007	CGCC	2	8	27541	27548	0 %	0 %	25 %	75 %	125654624
74	NC_009007	CGGT	2	8	27687	27694	0 %	25 %	50 %	25 %	125654624
75	NC_009007	GTCG	2	8	28049	28056	0 %	25 %	50 %	25 %	125654624
76	NC_009007	CGCC	2	8	28219	28226	0 %	0 %	25 %	75 %	125654624
77	NC_009007	CGCC	2	8	28321	28328	0 %	0 %	25 %	75 %	125654624
78	NC_009007	CGGT	2	8	28365	28372	0 %	25 %	50 %	25 %	125654624
79	NC_009007	GCCC	2	8	28411	28418	0 %	0 %	25 %	75 %	125654624
80	NC_009007	GGGC	2	8	28732	28739	0 %	0 %	75 %	25 %	125654624
81	NC_009007	GCCT	2	8	29341	29348	0 %	25 %	25 %	50 %	125654625
82	NC_009007	CGCC	2	8	29941	29948	0 %	0 %	25 %	75 %	125654626
83	NC_009007	CAGG	2	8	29971	29978	25 %	0 %	50 %	25 %	125654626
84	NC_009007	CGGG	2	8	30069	30076	0 %	0 %	75 %	25 %	125654626
85	NC_009007	GCGA	2	8	30180	30187	25 %	0 %	50 %	25 %	125654626
86	NC_009007	GAGC	2	8	30188	30195	25 %	0 %	50 %	25 %	125654626
87	NC_009007	GTCC	2	8	30388	30395	0 %	25 %	25 %	50 %	125654627
88	NC_009007	GGGC	2	8	30398	30405	0 %	0 %	75 %	25 %	125654627
89	NC_009007	TCCT	2	8	30560	30567	0 %	50 %	0 %	50 %	125654627
90	NC_009007	CGGG	2	8	30772	30779	0 %	0 %	75 %	25 %	125654627
91	NC_009007	GGTG	2	8	31100	31107	0 %	25 %	75 %	0 %	125654627
92	NC_009007	CCGC	2	8	33579	33586	0 %	0 %	25 %	75 %	125654630
93	NC_009007	TCGG	2	8	34962	34969	0 %	25 %	50 %	25 %	125654631
94	NC_009007	CGGG	2	8	36142	36149	0 %	0 %	75 %	25 %	125654632
95	NC_009007	GCCC	2	8	36295	36302	0 %	0 %	25 %	75 %	125654632
96	NC_009007	CAGC	2	8	36313	36320	25 %	0 %	25 %	50 %	125654632
97	NC_009007	GCCT	2	8	36628	36635	0 %	25 %	25 %	50 %	125654633
98	NC_009007	GCTC	2	8	36907	36914	0 %	25 %	25 %	50 %	125654633
99	NC_009007	TTCA	2	8	37967	37974	25 %	50 %	0 %	25 %	125654634
100	NC_009007	GCCG	2	8	39593	39600	0 %	0 %	50 %	50 %	125654637
101	NC_009007	AGCG	2	8	39622	39629	25 %	0 %	50 %	25 %	125654637
102	NC_009007	CCGG	2	8	41462	41469	0 %	0 %	50 %	50 %	125654638
103	NC_009007	CGAG	2	8	41628	41635	25 %	0 %	50 %	25 %	125654638
104	NC_009007	TCCA	2	8	41834	41841	25 %	25 %	0 %	50 %	125654638
105	NC_009007	CGGC	2	8	41868	41875	0 %	0 %	50 %	50 %	125654638
106	NC_009007	GGAT	2	8	43281	43288	25 %	25 %	50 %	0 %	125654640
107	NC_009007	CGGG	2	8	43354	43361	0 %	0 %	75 %	25 %	125654640
108	NC_009007	GCGA	2	8	43416	43423	25 %	0 %	50 %	25 %	125654640
109	NC_009007	CGCC	2	8	43492	43499	0 %	0 %	25 %	75 %	125654640
110	NC_009007	CGCC	2	8	43864	43871	0 %	0 %	25 %	75 %	125654640
111	NC_009007	CGTC	2	8	44615	44622	0 %	25 %	25 %	50 %	125654641
112	NC_009007	GGGC	2	8	44646	44653	0 %	0 %	75 %	25 %	125654641
113	NC_009007	GGCG	2	8	45899	45906	0 %	0 %	75 %	25 %	125654642
114	NC_009007	GGGC	2	8	46085	46092	0 %	0 %	75 %	25 %	125654642
115	NC_009007	CCGC	2	8	46663	46670	0 %	0 %	25 %	75 %	125654643
116	NC_009007	GCCC	2	8	46689	46696	0 %	0 %	25 %	75 %	125654643
117	NC_009007	CGCC	2	8	46853	46860	0 %	0 %	25 %	75 %	125654643
118	NC_009007	CGCC	2	8	46901	46908	0 %	0 %	25 %	75 %	125654643
119	NC_009007	GGGC	2	8	47063	47070	0 %	0 %	75 %	25 %	125654643
120	NC_009007	CTCG	2	8	48347	48354	0 %	25 %	25 %	50 %	125654644
121	NC_009007	GGCC	2	8	48401	48408	0 %	0 %	50 %	50 %	125654644
122	NC_009007	CGGC	2	8	48433	48440	0 %	0 %	50 %	50 %	125654644
123	NC_009007	GACC	2	8	48554	48561	25 %	0 %	25 %	50 %	125654644
124	NC_009007	GACC	2	8	48934	48941	25 %	0 %	25 %	50 %	125654645
125	NC_009007	GGCG	2	8	49587	49594	0 %	0 %	75 %	25 %	125654646
126	NC_009007	GCTG	2	8	49906	49913	0 %	25 %	50 %	25 %	125654647
127	NC_009007	CGCA	2	8	50001	50008	25 %	0 %	25 %	50 %	125654647
128	NC_009007	CCGG	2	8	50353	50360	0 %	0 %	50 %	50 %	125654647
129	NC_009007	TGCT	2	8	50968	50975	0 %	50 %	25 %	25 %	125654648
130	NC_009007	GCCC	2	8	51212	51219	0 %	0 %	25 %	75 %	125654648
131	NC_009007	GCCC	2	8	51443	51450	0 %	0 %	25 %	75 %	125654648
132	NC_009007	CCGC	2	8	51596	51603	0 %	0 %	25 %	75 %	125654648
133	NC_009007	AGCC	2	8	51625	51632	25 %	0 %	25 %	50 %	125654648
134	NC_009007	GCAG	2	8	51733	51740	25 %	0 %	50 %	25 %	125654649
135	NC_009007	CGGT	2	8	51885	51892	0 %	25 %	50 %	25 %	125654649
136	NC_009007	CCGG	2	8	51966	51973	0 %	0 %	50 %	50 %	125654649
137	NC_009007	CCGG	2	8	51989	51996	0 %	0 %	50 %	50 %	125654649
138	NC_009007	CGAC	2	8	52311	52318	25 %	0 %	25 %	50 %	125654649
139	NC_009007	TGGC	2	8	53551	53558	0 %	25 %	50 %	25 %	125654650
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.