MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid A

Total Repeats: 373

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009007	CGC	2	6	2683	2688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009007	CGC	2	6	2779	2784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009007	ACC	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009007	CGT	2	6	2863	2868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009007	GGA	2	6	2922	2927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009007	GGA	2	6	4118	4123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009007	GCC	2	6	4159	4164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009007	AAC	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009007	CGG	2	6	5880	5885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009007	GAG	2	6	5902	5907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009007	CGG	2	6	6163	6168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009007	GCC	2	6	6172	6177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_009007	GCA	2	6	6247	6252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009007	CGG	2	6	6341	6346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009007	GCT	2	6	12479	12484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009007	CGC	2	6	12549	12554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_009007	CGG	2	6	12588	12593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009007	CCG	2	6	12685	12690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_009007	CGC	2	6	12805	12810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009007	GCC	2	6	13640	13645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009007	CGG	2	6	13676	13681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009007	GGC	2	6	13696	13701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009007	CGG	2	6	13707	13712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009007	CGG	2	6	14608	14613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009007	GGC	2	6	18837	18842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009007	GAG	2	6	18916	18921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009007	CGC	2	6	20738	20743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_009007	AGG	2	6	20813	20818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009007	CGG	2	6	20832	20837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009007	GCG	2	6	20838	20843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009007	CCG	2	6	20859	20864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009007	GAA	2	6	20869	20874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009007	TGG	2	6	20912	20917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009007	GGA	2	6	25681	25686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009007	TCT	2	6	25687	25692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009007	CGG	3	9	25715	25723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009007	GAG	2	6	29122	29127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009007	GGC	2	6	30289	30294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009007	CGG	2	6	30328	30333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009007	CGC	2	6	33887	33892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009007	CGG	2	6	33987	33992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009007	CAA	2	6	34032	34037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009007	TCT	2	6	34075	34080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009007	GGC	2	6	34101	34106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009007	GCC	2	6	34174	34179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009007	CCG	2	6	34223	34228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009007	TCG	2	6	35262	35267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009007	TGC	2	6	35292	35297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009007	CGG	2	6	35370	35375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009007	GCG	2	6	35439	35444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009007	GCC	2	6	35561	35566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_009007	TGG	2	6	35610	35615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009007	GGC	2	6	35626	35631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009007	CGC	2	6	35727	35732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_009007	CTG	2	6	35768	35773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009007	GGC	2	6	37312	37317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009007	GCC	2	6	37408	37413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_009007	CGG	2	6	37443	37448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009007	AGG	2	6	37514	37519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009007	CGG	2	6	37606	37611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009007	GGA	2	6	37629	37634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009007	CGG	3	9	37639	37647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009007	CGG	2	6	38107	38112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009007	CTC	2	6	38155	38160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_009007	GCG	2	6	38182	38187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009007	GCG	2	6	38686	38691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009007	GCC	2	6	38707	38712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009007	GAC	2	6	38762	38767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009007	AGG	2	6	38835	38840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009007	CGC	2	6	39468	39473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_009007	CGG	2	6	40641	40646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009007	AGC	2	6	40677	40682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009007	CGC	2	6	40735	40740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_009007	TGG	2	6	40816	40821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009007	GCC	2	6	40941	40946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009007	CGC	2	6	41021	41026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009007	CGC	2	6	41100	41105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_009007	AGC	2	6	41118	41123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009007	ACC	2	6	41136	41141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009007	GGC	2	6	41142	41147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009007	CAG	2	6	41177	41182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009007	TCG	2	6	41298	41303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009007	GGC	2	6	42193	42198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009007	GCC	2	6	42313	42318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_009007	CGC	2	6	42341	42346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009007	CGG	2	6	42397	42402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009007	GCC	2	6	42576	42581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_009007	GAG	2	6	42583	42588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009007	GCC	2	6	42953	42958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009007	GCC	2	6	42965	42970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_009007	GCC	2	6	42995	43000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009007	GGA	2	6	43061	43066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009007	CGG	2	6	43103	43108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009007	GGC	2	6	44040	44045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009007	CGG	2	6	44912	44917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009007	GCG	2	6	44920	44925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009007	GCG	2	6	44931	44936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009007	GCC	2	6	44955	44960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_009007	CGG	2	6	44969	44974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009007	GGC	2	6	44984	44989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009007	ACC	2	6	45060	45065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009007	CGG	2	6	45114	45119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009007	CAG	2	6	45191	45196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009007	CGT	2	6	45235	45240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009007	GGC	2	6	45254	45259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009007	GCC	3	9	45289	45297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_009007	CCG	2	6	45323	45328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_009007	CGC	2	6	45329	45334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_009007	GCC	4	12	45336	45347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_009007	CGG	2	6	45350	45355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009007	AGC	3	9	45360	45368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009007	CGG	2	6	45385	45390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009007	CGC	2	6	45395	45400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_009007	AGC	3	9	45405	45413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009007	GCG	2	6	45436	45441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009007	CCA	2	6	45538	45543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_009007	GGC	2	6	45564	45569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009007	CTC	2	6	45596	45601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_009007	CCT	2	6	45628	45633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_009007	CGG	2	6	47526	47531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009007	GCG	2	6	47552	47557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009007	GGC	2	6	47569	47574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009007	CCG	2	6	47660	47665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009007	AGG	2	6	47704	47709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009007	GGC	2	6	47786	47791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009007	CGC	2	6	47838	47843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_009007	TGC	2	6	47847	47852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009007	CCG	2	6	50389	50394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_009007	CGG	2	6	50445	50450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009007	GTG	2	6	50556	50561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009007	GGC	2	6	55438	55443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009007	ATA	2	6	56537	56542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009007	GCC	3	9	56557	56565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_009007	GAC	2	6	57797	57802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009007	GCG	2	6	58666	58671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009007	CTC	2	6	58739	58744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_009007	CGC	2	6	58809	58814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_009007	CGG	2	6	58826	58831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009007	GGA	2	6	58884	58889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009007	GGC	2	6	58958	58963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009007	CGG	2	6	59030	59035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009007	GGC	2	6	59081	59086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.