MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid A

Total Repeats: 360

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009007	GA	3	6	32	37	50 %	0 %	50 %	0 %	125654606
2	NC_009007	CG	3	6	437	442	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
3	NC_009007	CG	3	6	462	467	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
4	NC_009007	CG	3	6	477	482	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
5	NC_009007	GC	3	6	571	576	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
6	NC_009007	GC	3	6	1008	1013	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
7	NC_009007	GC	3	6	1261	1266	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
8	NC_009007	GC	3	6	1916	1921	0 %	0 %	50 %	50 %	125654607
9	NC_009007	GC	4	8	2350	2357	0 %	0 %	50 %	50 %	125654607
10	NC_009007	CG	4	8	3007	3014	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
11	NC_009007	GC	3	6	3407	3412	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
12	NC_009007	GC	5	10	3534	3543	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
13	NC_009007	TC	3	6	4099	4104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009007	CG	4	8	4131	4138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009007	CG	4	8	4187	4194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009007	GC	3	6	4499	4504	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
17	NC_009007	GC	3	6	4542	4547	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
18	NC_009007	GC	3	6	4851	4856	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
19	NC_009007	CG	3	6	4903	4908	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
20	NC_009007	GC	3	6	5267	5272	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
21	NC_009007	CG	3	6	5457	5462	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
22	NC_009007	GC	3	6	5484	5489	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
23	NC_009007	GA	3	6	5559	5564	50 %	0 %	50 %	0 %	125654609
24	NC_009007	CG	4	8	5598	5605	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
25	NC_009007	TA	4	8	5861	5868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009007	GC	5	10	6014	6023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009007	GC	4	8	6083	6090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009007	GC	3	6	6198	6203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009007	CG	3	6	6302	6307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009007	GC	3	6	6594	6599	0 %	0 %	50 %	50 %	125654610
31	NC_009007	CG	3	6	8127	8132	0 %	0 %	50 %	50 %	125654611
32	NC_009007	GA	3	6	8744	8749	50 %	0 %	50 %	0 %	125654612
33	NC_009007	GC	5	10	8886	8895	0 %	0 %	50 %	50 %	125654612
34	NC_009007	GC	3	6	9082	9087	0 %	0 %	50 %	50 %	125654613
35	NC_009007	GC	3	6	9440	9445	0 %	0 %	50 %	50 %	125654613
36	NC_009007	CG	3	6	9930	9935	0 %	0 %	50 %	50 %	125654613
37	NC_009007	GC	3	6	10013	10018	0 %	0 %	50 %	50 %	125654614
38	NC_009007	CG	3	6	10097	10102	0 %	0 %	50 %	50 %	125654614
39	NC_009007	GC	3	6	10372	10377	0 %	0 %	50 %	50 %	125654614
40	NC_009007	CG	3	6	10470	10475	0 %	0 %	50 %	50 %	125654614
41	NC_009007	GC	3	6	10553	10558	0 %	0 %	50 %	50 %	125654614
42	NC_009007	TC	3	6	10597	10602	0 %	50 %	0 %	50 %	125654614
43	NC_009007	GC	3	6	11039	11044	0 %	0 %	50 %	50 %	125654615
44	NC_009007	GC	3	6	11719	11724	0 %	0 %	50 %	50 %	125654616
45	NC_009007	GC	3	6	11804	11809	0 %	0 %	50 %	50 %	125654616
46	NC_009007	CG	3	6	11916	11921	0 %	0 %	50 %	50 %	125654616
47	NC_009007	CG	3	6	11977	11982	0 %	0 %	50 %	50 %	125654616
48	NC_009007	GC	3	6	12069	12074	0 %	0 %	50 %	50 %	125654616
49	NC_009007	CG	3	6	12115	12120	0 %	0 %	50 %	50 %	125654616
50	NC_009007	GC	4	8	12516	12523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009007	GC	3	6	12530	12535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009007	TC	3	6	12629	12634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009007	GC	3	6	12755	12760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009007	CG	3	6	12890	12895	0 %	0 %	50 %	50 %	125654617
55	NC_009007	GC	3	6	13115	13120	0 %	0 %	50 %	50 %	125654617
56	NC_009007	GC	3	6	13335	13340	0 %	0 %	50 %	50 %	125654617
57	NC_009007	CG	3	6	13386	13391	0 %	0 %	50 %	50 %	125654617
58	NC_009007	CG	3	6	13393	13398	0 %	0 %	50 %	50 %	125654617
59	NC_009007	CG	3	6	13452	13457	0 %	0 %	50 %	50 %	125654617
60	NC_009007	GC	5	10	13661	13670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009007	CG	4	8	13723	13730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009007	GC	3	6	13908	13913	0 %	0 %	50 %	50 %	125654618
63	NC_009007	CG	3	6	14440	14445	0 %	0 %	50 %	50 %	125654618
64	NC_009007	CG	3	6	14504	14509	0 %	0 %	50 %	50 %	125654618
65	NC_009007	GC	3	6	14673	14678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009007	CG	3	6	15662	15667	0 %	0 %	50 %	50 %	125654620
67	NC_009007	CG	3	6	15811	15816	0 %	0 %	50 %	50 %	125654620
68	NC_009007	CG	3	6	15852	15857	0 %	0 %	50 %	50 %	125654620
69	NC_009007	CG	3	6	15939	15944	0 %	0 %	50 %	50 %	125654620
70	NC_009007	CG	3	6	16006	16011	0 %	0 %	50 %	50 %	125654620
71	NC_009007	CG	4	8	16085	16092	0 %	0 %	50 %	50 %	125654620
72	NC_009007	GC	4	8	16126	16133	0 %	0 %	50 %	50 %	125654620
73	NC_009007	GC	3	6	16232	16237	0 %	0 %	50 %	50 %	125654620
74	NC_009007	CG	3	6	16288	16293	0 %	0 %	50 %	50 %	125654620
75	NC_009007	CG	3	6	16366	16371	0 %	0 %	50 %	50 %	125654620
76	NC_009007	GC	3	6	16770	16775	0 %	0 %	50 %	50 %	125654621
77	NC_009007	GC	3	6	16873	16878	0 %	0 %	50 %	50 %	125654621
78	NC_009007	GC	3	6	16921	16926	0 %	0 %	50 %	50 %	125654621
79	NC_009007	CG	3	6	17045	17050	0 %	0 %	50 %	50 %	125654621
80	NC_009007	GC	3	6	17377	17382	0 %	0 %	50 %	50 %	125654621
81	NC_009007	GC	3	6	17719	17724	0 %	0 %	50 %	50 %	125654621
82	NC_009007	CG	3	6	17756	17761	0 %	0 %	50 %	50 %	125654621
83	NC_009007	GC	3	6	18023	18028	0 %	0 %	50 %	50 %	125654621
84	NC_009007	CG	4	8	18334	18341	0 %	0 %	50 %	50 %	125654621
85	NC_009007	CG	3	6	18507	18512	0 %	0 %	50 %	50 %	125654621
86	NC_009007	CG	3	6	18752	18757	0 %	0 %	50 %	50 %	125654621
87	NC_009007	CG	3	6	18910	18915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009007	CG	4	8	19866	19873	0 %	0 %	50 %	50 %	125654622
89	NC_009007	GA	3	6	19992	19997	50 %	0 %	50 %	0 %	125654622
90	NC_009007	GA	3	6	20665	20670	50 %	0 %	50 %	0 %	125654622
91	NC_009007	CG	3	6	20822	20827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009007	GC	3	6	21492	21497	0 %	0 %	50 %	50 %	125654623
93	NC_009007	GC	3	6	21624	21629	0 %	0 %	50 %	50 %	125654623
94	NC_009007	GC	3	6	21672	21677	0 %	0 %	50 %	50 %	125654623
95	NC_009007	GC	3	6	22008	22013	0 %	0 %	50 %	50 %	125654623
96	NC_009007	GC	3	6	22680	22685	0 %	0 %	50 %	50 %	125654623
97	NC_009007	GC	3	6	22824	22829	0 %	0 %	50 %	50 %	125654623
98	NC_009007	TC	3	6	23164	23169	0 %	50 %	0 %	50 %	125654623
99	NC_009007	GC	3	6	25272	25277	0 %	0 %	50 %	50 %	125654623
100	NC_009007	CT	3	6	25635	25640	0 %	50 %	0 %	50 %	125654623
101	NC_009007	CG	3	6	25797	25802	0 %	0 %	50 %	50 %	125654624
102	NC_009007	GC	3	6	26241	26246	0 %	0 %	50 %	50 %	125654624
103	NC_009007	CG	3	6	26267	26272	0 %	0 %	50 %	50 %	125654624
104	NC_009007	GC	3	6	27175	27180	0 %	0 %	50 %	50 %	125654624
105	NC_009007	CG	3	6	27852	27857	0 %	0 %	50 %	50 %	125654624
106	NC_009007	GC	3	6	28531	28536	0 %	0 %	50 %	50 %	125654624
107	NC_009007	CG	3	6	29116	29121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009007	CG	3	6	29648	29653	0 %	0 %	50 %	50 %	125654625
109	NC_009007	CG	4	8	29737	29744	0 %	0 %	50 %	50 %	125654625
110	NC_009007	GC	5	10	29999	30008	0 %	0 %	50 %	50 %	125654626
111	NC_009007	GC	3	6	30247	30252	0 %	0 %	50 %	50 %	125654626
112	NC_009007	GC	3	6	30582	30587	0 %	0 %	50 %	50 %	125654627
113	NC_009007	CG	3	6	30853	30858	0 %	0 %	50 %	50 %	125654627
114	NC_009007	TC	3	6	31085	31090	0 %	50 %	0 %	50 %	125654627
115	NC_009007	GA	3	6	31210	31215	50 %	0 %	50 %	0 %	125654628
116	NC_009007	CG	4	8	31463	31470	0 %	0 %	50 %	50 %	125654628
117	NC_009007	CG	3	6	32181	32186	0 %	0 %	50 %	50 %	125654629
118	NC_009007	GC	3	6	32256	32261	0 %	0 %	50 %	50 %	125654629
119	NC_009007	GC	3	6	32544	32549	0 %	0 %	50 %	50 %	125654629
120	NC_009007	CG	3	6	32607	32612	0 %	0 %	50 %	50 %	125654629
121	NC_009007	GC	3	6	32797	32802	0 %	0 %	50 %	50 %	125654629
122	NC_009007	CG	4	8	33219	33226	0 %	0 %	50 %	50 %	125654630
123	NC_009007	GC	3	6	33328	33333	0 %	0 %	50 %	50 %	125654630
124	NC_009007	GC	3	6	33591	33596	0 %	0 %	50 %	50 %	125654630
125	NC_009007	CG	3	6	33690	33695	0 %	0 %	50 %	50 %	125654630
126	NC_009007	TC	3	6	33814	33819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009007	GC	3	6	34262	34267	0 %	0 %	50 %	50 %	125654631
128	NC_009007	CG	3	6	34305	34310	0 %	0 %	50 %	50 %	125654631
129	NC_009007	GC	3	6	34523	34528	0 %	0 %	50 %	50 %	125654631
130	NC_009007	GC	5	10	34564	34573	0 %	0 %	50 %	50 %	125654631
131	NC_009007	CG	3	6	34608	34613	0 %	0 %	50 %	50 %	125654631
132	NC_009007	GC	3	6	34796	34801	0 %	0 %	50 %	50 %	125654631
133	NC_009007	AG	3	6	34943	34948	50 %	0 %	50 %	0 %	125654631
134	NC_009007	GC	3	6	35020	35025	0 %	0 %	50 %	50 %	125654631
135	NC_009007	CG	3	6	35072	35077	0 %	0 %	50 %	50 %	125654631
136	NC_009007	GC	3	6	35274	35279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009007	GC	4	8	35404	35411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009007	CG	3	6	35497	35502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009007	GC	3	6	35643	35648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009007	CG	3	6	35745	35750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009007	GC	3	6	35914	35919	0 %	0 %	50 %	50 %	125654632
142	NC_009007	CG	3	6	36031	36036	0 %	0 %	50 %	50 %	125654632
143	NC_009007	CG	3	6	36352	36357	0 %	0 %	50 %	50 %	125654632
144	NC_009007	TC	3	6	36561	36566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009007	CG	3	6	36964	36969	0 %	0 %	50 %	50 %	125654633
146	NC_009007	GC	3	6	37696	37701	0 %	0 %	50 %	50 %	125654634
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.