MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 chromosome

Total Repeats: 2099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009004	AAAGT	2	10	3938	3947	60 %	20 %	20 %	0 %	125622885
2	NC_009004	GAGGT	2	10	7476	7485	20 %	20 %	60 %	0 %	125622886
3	NC_009004	ATTAT	2	10	9479	9488	40 %	60 %	0 %	0 %	125622886
4	NC_009004	AAGCA	2	10	10177	10186	60 %	0 %	20 %	20 %	125622888
5	NC_009004	AAATG	2	10	11880	11889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009004	ATGGT	2	10	12733	12742	20 %	40 %	40 %	0 %	125622891
7	NC_009004	GCATG	2	10	14852	14861	20 %	20 %	40 %	20 %	125622894
8	NC_009004	ATTTT	2	10	15682	15691	20 %	80 %	0 %	0 %	125622895
9	NC_009004	AAATG	2	10	15974	15983	60 %	20 %	20 %	0 %	125622895
10	NC_009004	TGCGA	2	10	16991	17000	20 %	20 %	40 %	20 %	125622895
11	NC_009004	TACTT	2	10	17636	17645	20 %	60 %	0 %	20 %	125622895
12	NC_009004	TGATT	2	10	19703	19712	20 %	60 %	20 %	0 %	125622898
13	NC_009004	TGGTA	2	10	24998	25007	20 %	40 %	40 %	0 %	125622902
14	NC_009004	CTTAA	2	10	26057	26066	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009004	AAGTC	2	10	26198	26207	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009004	TATAA	2	10	26453	26462	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009004	TGGCT	2	10	26996	27005	0 %	40 %	40 %	20 %	125622903
18	NC_009004	ATTTT	2	10	27091	27100	20 %	80 %	0 %	0 %	125622903
19	NC_009004	AGAGA	2	10	28009	28018	60 %	0 %	40 %	0 %	125622903
20	NC_009004	CAAAA	2	10	28357	28366	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009004	CTATC	2	10	33228	33237	20 %	40 %	0 %	40 %	125622907
22	NC_009004	ATTTT	2	10	35005	35014	20 %	80 %	0 %	0 %	125622910
23	NC_009004	CTTTC	2	10	35845	35854	0 %	60 %	0 %	40 %	125622911
24	NC_009004	CAATC	2	10	37701	37710	40 %	20 %	0 %	40 %	125622913
25	NC_009004	TGCCT	2	10	38517	38526	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_009004	TTTTC	2	10	38852	38861	0 %	80 %	0 %	20 %	125622917
27	NC_009004	TTTAC	2	10	39958	39967	20 %	60 %	0 %	20 %	125622920
28	NC_009004	TTTAA	2	10	40238	40247	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009004	CTAAT	2	10	40620	40629	40 %	40 %	0 %	20 %	125622921
30	NC_009004	AGAAA	2	10	40905	40914	80 %	0 %	20 %	0 %	125622922
31	NC_009004	CGGAG	2	10	41063	41072	20 %	0 %	60 %	20 %	125622922
32	NC_009004	ATGAA	2	10	42449	42458	60 %	20 %	20 %	0 %	125622925
33	NC_009004	TCATT	2	10	42860	42869	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009004	AAAAT	2	10	45004	45013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009004	CAAAA	2	10	45158	45167	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009004	TTTGA	2	10	45499	45508	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009004	TTTTG	2	10	45982	45991	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009004	GAAAA	2	10	46591	46600	80 %	0 %	20 %	0 %	125622930
39	NC_009004	ATAAA	2	10	49043	49052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009004	TTTAC	2	10	49458	49467	20 %	60 %	0 %	20 %	125622933
41	NC_009004	TGCCT	2	10	50420	50429	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009004	AATAA	2	10	51600	51609	80 %	20 %	0 %	0 %	125622936
43	NC_009004	TATAA	2	10	55279	55288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009004	TAAGC	2	10	56129	56138	40 %	20 %	20 %	20 %	125622941
45	NC_009004	TTTAA	2	10	56467	56476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009004	TGGAT	2	10	56689	56698	20 %	40 %	40 %	0 %	125622942
47	NC_009004	AAAAG	2	10	57154	57163	80 %	0 %	20 %	0 %	125622943
48	NC_009004	TCAAA	2	10	57322	57331	60 %	20 %	0 %	20 %	125622943
49	NC_009004	GTGAG	2	10	60219	60228	20 %	20 %	60 %	0 %	125622945
50	NC_009004	AGTAA	2	10	60788	60797	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009004	AATTA	2	10	61501	61510	60 %	40 %	0 %	0 %	125622946
52	NC_009004	ATTAT	2	10	61774	61783	40 %	60 %	0 %	0 %	125622946
53	NC_009004	AATCA	2	10	65834	65843	60 %	20 %	0 %	20 %	125622950
54	NC_009004	AATTT	2	10	66427	66436	40 %	60 %	0 %	0 %	125622950
55	NC_009004	GCTTG	2	10	69521	69530	0 %	40 %	40 %	20 %	125622953
56	NC_009004	TCCAT	2	10	69872	69881	20 %	40 %	0 %	40 %	125622953
57	NC_009004	AAAAT	2	10	73783	73792	80 %	20 %	0 %	0 %	125622957
58	NC_009004	AGTTT	2	10	74983	74992	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009004	ATTAA	2	10	75758	75767	60 %	40 %	0 %	0 %	125622959
60	NC_009004	GTCTT	2	10	76029	76038	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009004	CAAAT	2	10	78853	78862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009004	CAAGC	2	10	81184	81193	40 %	0 %	20 %	40 %	125622964
63	NC_009004	CCATT	2	10	83425	83434	20 %	40 %	0 %	40 %	125622966
64	NC_009004	GAAGT	2	10	83869	83878	40 %	20 %	40 %	0 %	125622967
65	NC_009004	TACTA	2	10	85799	85808	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009004	ACAAG	2	10	86149	86158	60 %	0 %	20 %	20 %	125622969
67	NC_009004	TCCAA	2	10	86305	86314	40 %	20 %	0 %	40 %	125622969
68	NC_009004	TGAGT	2	10	88657	88666	20 %	40 %	40 %	0 %	125622971
69	NC_009004	TGAAA	2	10	89173	89182	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009004	AATTT	2	10	90590	90599	40 %	60 %	0 %	0 %	125622974
71	NC_009004	ACTGG	2	10	91421	91430	20 %	20 %	40 %	20 %	125622975
72	NC_009004	GTAAA	2	10	93215	93224	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009004	TTATT	2	10	94209	94218	20 %	80 %	0 %	0 %	125622979
74	NC_009004	TCTTT	2	10	95395	95404	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009004	TTGCT	2	10	95696	95705	0 %	60 %	20 %	20 %	125622980
76	NC_009004	TGAGT	2	10	97071	97080	20 %	40 %	40 %	0 %	125622981
77	NC_009004	GCAGA	2	10	97686	97695	40 %	0 %	40 %	20 %	125622982
78	NC_009004	AAGCT	2	10	100413	100422	40 %	20 %	20 %	20 %	125622985
79	NC_009004	TGGAT	2	10	101408	101417	20 %	40 %	40 %	0 %	125622986
80	NC_009004	ATAAA	2	10	103797	103806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009004	CAAGA	2	10	104794	104803	60 %	0 %	20 %	20 %	125622991
82	NC_009004	ATAGA	2	10	105665	105674	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009004	AAAGA	2	10	109285	109294	80 %	0 %	20 %	0 %	125622994
84	NC_009004	AGAGT	2	10	109695	109704	40 %	20 %	40 %	0 %	125622995
85	NC_009004	TGGTT	2	10	110368	110377	0 %	60 %	40 %	0 %	125622995
86	NC_009004	TATGA	2	10	112980	112989	40 %	40 %	20 %	0 %	125622998
87	NC_009004	TCGTA	2	10	113435	113444	20 %	40 %	20 %	20 %	125622998
88	NC_009004	TTATA	2	10	114200	114209	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009004	GAAGC	2	10	114682	114691	40 %	0 %	40 %	20 %	125623000
90	NC_009004	TACAA	2	10	115483	115492	60 %	20 %	0 %	20 %	125623001
91	NC_009004	GATTT	2	10	118537	118546	20 %	60 %	20 %	0 %	125623003
92	NC_009004	TCAAA	2	10	120967	120976	60 %	20 %	0 %	20 %	125623006
93	NC_009004	TCGCA	2	10	124595	124604	20 %	20 %	20 %	40 %	125623009
94	NC_009004	TATTC	2	10	125428	125437	20 %	60 %	0 %	20 %	125623010
95	NC_009004	TTTTA	2	10	127602	127611	20 %	80 %	0 %	0 %	125623012
96	NC_009004	AATAA	2	10	128543	128552	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009004	AAATG	2	10	128859	128868	60 %	20 %	20 %	0 %	125623013
98	NC_009004	CAAAA	2	10	128988	128997	80 %	0 %	0 %	20 %	125623013
99	NC_009004	ATTTT	2	10	129698	129707	20 %	80 %	0 %	0 %	125623014
100	NC_009004	TTGTC	2	10	130078	130087	0 %	60 %	20 %	20 %	125623014
101	NC_009004	TATAT	2	10	130813	130822	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009004	ATTTG	2	10	133580	133589	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009004	GCTCC	2	10	133882	133891	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_009004	TGGAT	2	10	134083	134092	20 %	40 %	40 %	0 %	125623017
105	NC_009004	GAAGG	2	10	134162	134171	40 %	0 %	60 %	0 %	125623017
106	NC_009004	AATTA	2	10	135064	135073	60 %	40 %	0 %	0 %	125623017
107	NC_009004	ATTTT	2	10	135970	135979	20 %	80 %	0 %	0 %	125623018
108	NC_009004	TTTTC	2	10	137274	137283	0 %	80 %	0 %	20 %	125623019
109	NC_009004	ACCAG	2	10	137708	137717	40 %	0 %	20 %	40 %	125623019
110	NC_009004	CCAAA	2	10	137819	137828	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009004	TGGCT	2	10	138782	138791	0 %	40 %	40 %	20 %	125623021
112	NC_009004	TCAAA	2	10	139360	139369	60 %	20 %	0 %	20 %	125623022
113	NC_009004	TTTTA	2	10	139633	139642	20 %	80 %	0 %	0 %	125623022
114	NC_009004	TTTTA	2	10	139963	139972	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009004	CAGGT	2	10	141833	141842	20 %	20 %	40 %	20 %	125623025
116	NC_009004	GTTTG	2	10	141894	141903	0 %	60 %	40 %	0 %	125623025
117	NC_009004	AGGAT	2	10	142352	142361	40 %	20 %	40 %	0 %	125623026
118	NC_009004	TTTAC	2	10	143859	143868	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009004	TTGTT	2	10	144806	144815	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009004	TAAAA	2	10	145186	145195	80 %	20 %	0 %	0 %	125623031
121	NC_009004	TTAAC	2	10	152904	152913	40 %	40 %	0 %	20 %	125623041
122	NC_009004	AAACA	2	10	153660	153669	80 %	0 %	0 %	20 %	125623041
123	NC_009004	TTTTA	2	10	154507	154516	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009004	ATTTT	2	10	158192	158201	20 %	80 %	0 %	0 %	125623045
125	NC_009004	CCTTT	2	10	160628	160637	0 %	60 %	0 %	40 %	125623048
126	NC_009004	TAATT	2	10	162689	162698	40 %	60 %	0 %	0 %	125623049
127	NC_009004	TACAA	2	10	163631	163640	60 %	20 %	0 %	20 %	125623050
128	NC_009004	TTTTA	2	10	164391	164400	20 %	80 %	0 %	0 %	125623051
129	NC_009004	TGATT	2	10	166009	166018	20 %	60 %	20 %	0 %	125623053
130	NC_009004	GATTG	2	10	167401	167410	20 %	40 %	40 %	0 %	125623054
131	NC_009004	TAAAA	2	10	169406	169415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009004	AGCCA	2	10	169507	169516	40 %	0 %	20 %	40 %	125623056
133	NC_009004	TTGGC	2	10	170402	170411	0 %	40 %	40 %	20 %	125623056
134	NC_009004	AAAGT	2	10	171276	171285	60 %	20 %	20 %	0 %	125623058
135	NC_009004	AATTT	2	10	171435	171444	40 %	60 %	0 %	0 %	125623058
136	NC_009004	ATTTA	2	10	174742	174751	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009004	CCAAA	2	10	176538	176547	60 %	0 %	0 %	40 %	125623064
138	NC_009004	GTAAA	2	10	178735	178744	60 %	20 %	20 %	0 %	125623067
139	NC_009004	AAATT	2	10	179889	179898	60 %	40 %	0 %	0 %	125623068
140	NC_009004	TAAAT	2	10	181682	181691	60 %	40 %	0 %	0 %	125623070
141	NC_009004	AAATA	2	10	187518	187527	80 %	20 %	0 %	0 %	125623075
142	NC_009004	TCCTT	2	10	188469	188478	0 %	60 %	0 %	40 %	125623076
143	NC_009004	AAAAT	2	10	188484	188493	80 %	20 %	0 %	0 %	125623076
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147	NC_009004	TAAAA	2	10	194117	194126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_009004	TGATA	2	10	211768	211777	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009004	AAAGA	2	10	214196	214205	80 %	0 %	20 %	0 %	125623102
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181	NC_009004	AAAAT	2	10	239505	239514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_009004	TGAAT	2	10	239607	239616	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_009004	TTTTA	2	10	243276	243285	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_009004	TTGGC	2	10	246510	246519	0 %	40 %	40 %	20 %	125623134
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187	NC_009004	TTCGT	2	10	247250	247259	0 %	60 %	20 %	20 %	125623134
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248	NC_009004	TAAAA	2	10	309582	309591	80 %	20 %	0 %	0 %	125623193
249	NC_009004	CTTAT	2	10	310317	310326	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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259	NC_009004	TTCTA	2	10	324663	324672	20 %	60 %	0 %	20 %	125623207
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262	NC_009004	TTTGC	2	10	328338	328347	0 %	60 %	20 %	20 %	125623211
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270	NC_009004	TAAAA	2	10	338201	338210	80 %	20 %	0 %	0 %	125623220
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