MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 chromosome

Total Repeats: 1542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009004	AAAGT	2	10	3938	3947	60 %	20 %	20 %	0 %	125622885
2	NC_009004	GAGGT	2	10	7476	7485	20 %	20 %	60 %	0 %	125622886
3	NC_009004	ATTAT	2	10	9479	9488	40 %	60 %	0 %	0 %	125622886
4	NC_009004	AAGCA	2	10	10177	10186	60 %	0 %	20 %	20 %	125622888
5	NC_009004	ATGGT	2	10	12733	12742	20 %	40 %	40 %	0 %	125622891
6	NC_009004	GCATG	2	10	14852	14861	20 %	20 %	40 %	20 %	125622894
7	NC_009004	ATTTT	2	10	15682	15691	20 %	80 %	0 %	0 %	125622895
8	NC_009004	AAATG	2	10	15974	15983	60 %	20 %	20 %	0 %	125622895
9	NC_009004	TGCGA	2	10	16991	17000	20 %	20 %	40 %	20 %	125622895
10	NC_009004	TACTT	2	10	17636	17645	20 %	60 %	0 %	20 %	125622895
11	NC_009004	TGATT	2	10	19703	19712	20 %	60 %	20 %	0 %	125622898
12	NC_009004	TGGTA	2	10	24998	25007	20 %	40 %	40 %	0 %	125622902
13	NC_009004	TGGCT	2	10	26996	27005	0 %	40 %	40 %	20 %	125622903
14	NC_009004	ATTTT	2	10	27091	27100	20 %	80 %	0 %	0 %	125622903
15	NC_009004	AGAGA	2	10	28009	28018	60 %	0 %	40 %	0 %	125622903
16	NC_009004	CTATC	2	10	33228	33237	20 %	40 %	0 %	40 %	125622907
17	NC_009004	ATTTT	2	10	35005	35014	20 %	80 %	0 %	0 %	125622910
18	NC_009004	CTTTC	2	10	35845	35854	0 %	60 %	0 %	40 %	125622911
19	NC_009004	CAATC	2	10	37701	37710	40 %	20 %	0 %	40 %	125622913
20	NC_009004	TTTTC	2	10	38852	38861	0 %	80 %	0 %	20 %	125622917
21	NC_009004	TTTAC	2	10	39958	39967	20 %	60 %	0 %	20 %	125622920
22	NC_009004	CTAAT	2	10	40620	40629	40 %	40 %	0 %	20 %	125622921
23	NC_009004	AGAAA	2	10	40905	40914	80 %	0 %	20 %	0 %	125622922
24	NC_009004	CGGAG	2	10	41063	41072	20 %	0 %	60 %	20 %	125622922
25	NC_009004	ATGAA	2	10	42449	42458	60 %	20 %	20 %	0 %	125622925
26	NC_009004	GAAAA	2	10	46591	46600	80 %	0 %	20 %	0 %	125622930
27	NC_009004	TTTAC	2	10	49458	49467	20 %	60 %	0 %	20 %	125622933
28	NC_009004	AATAA	2	10	51600	51609	80 %	20 %	0 %	0 %	125622936
29	NC_009004	TAAGC	2	10	56129	56138	40 %	20 %	20 %	20 %	125622941
30	NC_009004	TGGAT	2	10	56689	56698	20 %	40 %	40 %	0 %	125622942
31	NC_009004	AAAAG	2	10	57154	57163	80 %	0 %	20 %	0 %	125622943
32	NC_009004	TCAAA	2	10	57322	57331	60 %	20 %	0 %	20 %	125622943
33	NC_009004	GTGAG	2	10	60219	60228	20 %	20 %	60 %	0 %	125622945
34	NC_009004	AATTA	2	10	61501	61510	60 %	40 %	0 %	0 %	125622946
35	NC_009004	ATTAT	2	10	61774	61783	40 %	60 %	0 %	0 %	125622946
36	NC_009004	AATCA	2	10	65834	65843	60 %	20 %	0 %	20 %	125622950
37	NC_009004	AATTT	2	10	66427	66436	40 %	60 %	0 %	0 %	125622950
38	NC_009004	GCTTG	2	10	69521	69530	0 %	40 %	40 %	20 %	125622953
39	NC_009004	TCCAT	2	10	69872	69881	20 %	40 %	0 %	40 %	125622953
40	NC_009004	AAAAT	2	10	73783	73792	80 %	20 %	0 %	0 %	125622957
41	NC_009004	ATTAA	2	10	75758	75767	60 %	40 %	0 %	0 %	125622959
42	NC_009004	CAAGC	2	10	81184	81193	40 %	0 %	20 %	40 %	125622964
43	NC_009004	CCATT	2	10	83425	83434	20 %	40 %	0 %	40 %	125622966
44	NC_009004	GAAGT	2	10	83869	83878	40 %	20 %	40 %	0 %	125622967
45	NC_009004	ACAAG	2	10	86149	86158	60 %	0 %	20 %	20 %	125622969
46	NC_009004	TCCAA	2	10	86305	86314	40 %	20 %	0 %	40 %	125622969
47	NC_009004	TGAGT	2	10	88657	88666	20 %	40 %	40 %	0 %	125622971
48	NC_009004	AATTT	2	10	90590	90599	40 %	60 %	0 %	0 %	125622974
49	NC_009004	ACTGG	2	10	91421	91430	20 %	20 %	40 %	20 %	125622975
50	NC_009004	TTATT	2	10	94209	94218	20 %	80 %	0 %	0 %	125622979
51	NC_009004	TTGCT	2	10	95696	95705	0 %	60 %	20 %	20 %	125622980
52	NC_009004	TGAGT	2	10	97071	97080	20 %	40 %	40 %	0 %	125622981
53	NC_009004	GCAGA	2	10	97686	97695	40 %	0 %	40 %	20 %	125622982
54	NC_009004	AAGCT	2	10	100413	100422	40 %	20 %	20 %	20 %	125622985
55	NC_009004	TGGAT	2	10	101408	101417	20 %	40 %	40 %	0 %	125622986
56	NC_009004	CAAGA	2	10	104794	104803	60 %	0 %	20 %	20 %	125622991
57	NC_009004	AAAGA	2	10	109285	109294	80 %	0 %	20 %	0 %	125622994
58	NC_009004	AGAGT	2	10	109695	109704	40 %	20 %	40 %	0 %	125622995
59	NC_009004	TGGTT	2	10	110368	110377	0 %	60 %	40 %	0 %	125622995
60	NC_009004	TATGA	2	10	112980	112989	40 %	40 %	20 %	0 %	125622998
61	NC_009004	TCGTA	2	10	113435	113444	20 %	40 %	20 %	20 %	125622998
62	NC_009004	GAAGC	2	10	114682	114691	40 %	0 %	40 %	20 %	125623000
63	NC_009004	TACAA	2	10	115483	115492	60 %	20 %	0 %	20 %	125623001
64	NC_009004	GATTT	2	10	118537	118546	20 %	60 %	20 %	0 %	125623003
65	NC_009004	TCAAA	2	10	120967	120976	60 %	20 %	0 %	20 %	125623006
66	NC_009004	TCGCA	2	10	124595	124604	20 %	20 %	20 %	40 %	125623009
67	NC_009004	TATTC	2	10	125428	125437	20 %	60 %	0 %	20 %	125623010
68	NC_009004	TTTTA	2	10	127602	127611	20 %	80 %	0 %	0 %	125623012
69	NC_009004	AAATG	2	10	128859	128868	60 %	20 %	20 %	0 %	125623013
70	NC_009004	CAAAA	2	10	128988	128997	80 %	0 %	0 %	20 %	125623013
71	NC_009004	ATTTT	2	10	129698	129707	20 %	80 %	0 %	0 %	125623014
72	NC_009004	TTGTC	2	10	130078	130087	0 %	60 %	20 %	20 %	125623014
73	NC_009004	TGGAT	2	10	134083	134092	20 %	40 %	40 %	0 %	125623017
74	NC_009004	GAAGG	2	10	134162	134171	40 %	0 %	60 %	0 %	125623017
75	NC_009004	AATTA	2	10	135064	135073	60 %	40 %	0 %	0 %	125623017
76	NC_009004	ATTTT	2	10	135970	135979	20 %	80 %	0 %	0 %	125623018
77	NC_009004	TTTTC	2	10	137274	137283	0 %	80 %	0 %	20 %	125623019
78	NC_009004	ACCAG	2	10	137708	137717	40 %	0 %	20 %	40 %	125623019
79	NC_009004	TGGCT	2	10	138782	138791	0 %	40 %	40 %	20 %	125623021
80	NC_009004	TCAAA	2	10	139360	139369	60 %	20 %	0 %	20 %	125623022
81	NC_009004	TTTTA	2	10	139633	139642	20 %	80 %	0 %	0 %	125623022
82	NC_009004	CAGGT	2	10	141833	141842	20 %	20 %	40 %	20 %	125623025
83	NC_009004	GTTTG	2	10	141894	141903	0 %	60 %	40 %	0 %	125623025
84	NC_009004	AGGAT	2	10	142352	142361	40 %	20 %	40 %	0 %	125623026
85	NC_009004	TAAAA	2	10	145186	145195	80 %	20 %	0 %	0 %	125623031
86	NC_009004	TTAAC	2	10	152904	152913	40 %	40 %	0 %	20 %	125623041
87	NC_009004	AAACA	2	10	153660	153669	80 %	0 %	0 %	20 %	125623041
88	NC_009004	ATTTT	2	10	158192	158201	20 %	80 %	0 %	0 %	125623045
89	NC_009004	CCTTT	2	10	160628	160637	0 %	60 %	0 %	40 %	125623048
90	NC_009004	TAATT	2	10	162689	162698	40 %	60 %	0 %	0 %	125623049
91	NC_009004	TACAA	2	10	163631	163640	60 %	20 %	0 %	20 %	125623050
92	NC_009004	TTTTA	2	10	164391	164400	20 %	80 %	0 %	0 %	125623051
93	NC_009004	TGATT	2	10	166009	166018	20 %	60 %	20 %	0 %	125623053
94	NC_009004	GATTG	2	10	167401	167410	20 %	40 %	40 %	0 %	125623054
95	NC_009004	AGCCA	2	10	169507	169516	40 %	0 %	20 %	40 %	125623056
96	NC_009004	TTGGC	2	10	170402	170411	0 %	40 %	40 %	20 %	125623056
97	NC_009004	AAAGT	2	10	171276	171285	60 %	20 %	20 %	0 %	125623058
98	NC_009004	AATTT	2	10	171435	171444	40 %	60 %	0 %	0 %	125623058
99	NC_009004	CCAAA	2	10	176538	176547	60 %	0 %	0 %	40 %	125623064
100	NC_009004	GTAAA	2	10	178735	178744	60 %	20 %	20 %	0 %	125623067
101	NC_009004	AAATT	2	10	179889	179898	60 %	40 %	0 %	0 %	125623068
102	NC_009004	TAAAT	2	10	181682	181691	60 %	40 %	0 %	0 %	125623070
103	NC_009004	AAATA	2	10	187518	187527	80 %	20 %	0 %	0 %	125623075
104	NC_009004	TCCTT	2	10	188469	188478	0 %	60 %	0 %	40 %	125623076
105	NC_009004	AAAAT	2	10	188484	188493	80 %	20 %	0 %	0 %	125623076
106	NC_009004	ACTAA	2	10	188523	188532	60 %	20 %	0 %	20 %	125623076
107	NC_009004	AAAAG	2	10	189023	189032	80 %	0 %	20 %	0 %	125623076
108	NC_009004	TGGCT	2	10	195712	195721	0 %	40 %	40 %	20 %	125623083
109	NC_009004	TTCAA	2	10	197051	197060	40 %	40 %	0 %	20 %	125623085
110	NC_009004	TGATT	2	10	197723	197732	20 %	60 %	20 %	0 %	125623086
111	NC_009004	GCAAA	2	10	200211	200220	60 %	0 %	20 %	20 %	125623088
112	NC_009004	ACAAA	2	10	200577	200586	80 %	0 %	0 %	20 %	125623088
113	NC_009004	ATTTA	2	10	202459	202468	40 %	60 %	0 %	0 %	125623090
114	NC_009004	TAATT	2	10	204105	204114	40 %	60 %	0 %	0 %	125623092
115	NC_009004	CAATT	2	10	204200	204209	40 %	40 %	0 %	20 %	125623092
116	NC_009004	TCTTA	2	10	204677	204686	20 %	60 %	0 %	20 %	125623092
117	NC_009004	GATTG	2	10	207165	207174	20 %	40 %	40 %	0 %	125623094
118	NC_009004	TAAAT	2	10	209761	209770	60 %	40 %	0 %	0 %	125623097
119	NC_009004	TAAAT	2	10	210996	211005	60 %	40 %	0 %	0 %	125623099
120	NC_009004	AATTA	2	10	211070	211079	60 %	40 %	0 %	0 %	125623099
121	NC_009004	AAAGA	2	10	214196	214205	80 %	0 %	20 %	0 %	125623102
122	NC_009004	AGAAA	2	10	217332	217341	80 %	0 %	20 %	0 %	125623104
123	NC_009004	TATCC	2	10	217383	217392	20 %	40 %	0 %	40 %	125623104
124	NC_009004	TTTTG	2	10	218390	218399	0 %	80 %	20 %	0 %	125623105
125	NC_009004	ATTTA	4	20	218781	218800	40 %	60 %	0 %	0 %	125623106
126	NC_009004	GGGAT	2	10	221814	221823	20 %	20 %	60 %	0 %	125623107
127	NC_009004	TGAGA	2	10	227509	227518	40 %	20 %	40 %	0 %	125623115
128	NC_009004	AGTAA	2	10	229282	229291	60 %	20 %	20 %	0 %	125623117
129	NC_009004	GCGAG	2	10	229452	229461	20 %	0 %	60 %	20 %	125623118
130	NC_009004	CTTGT	2	10	229500	229509	0 %	60 %	20 %	20 %	125623118
131	NC_009004	GGCTT	2	10	232260	232269	0 %	40 %	40 %	20 %	125623120
132	NC_009004	GATTT	2	10	233750	233759	20 %	60 %	20 %	0 %	125623122
133	NC_009004	TTTTA	2	10	233956	233965	20 %	80 %	0 %	0 %	125623122
134	NC_009004	TCAAG	2	10	235629	235638	40 %	20 %	20 %	20 %	125623124
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