MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 chromosome

Total Repeats: 7458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009004	TGTC	2	8	110	117	0 %	50 %	25 %	25 %	125622883
2	NC_009004	CTTG	2	8	138	145	0 %	50 %	25 %	25 %	125622883
3	NC_009004	AATC	2	8	286	293	50 %	25 %	0 %	25 %	125622883
4	NC_009004	ATGC	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	125622883
5	NC_009004	ACTT	2	8	644	651	25 %	50 %	0 %	25 %	125622883
6	NC_009004	TCAA	2	8	1678	1685	50 %	25 %	0 %	25 %	125622884
7	NC_009004	GAAA	2	8	1947	1954	75 %	0 %	25 %	0 %	125622884
8	NC_009004	ATCA	2	8	2139	2146	50 %	25 %	0 %	25 %	125622884
9	NC_009004	TTGA	2	8	2251	2258	25 %	50 %	25 %	0 %	125622884
10	NC_009004	CAAC	2	8	2381	2388	50 %	0 %	0 %	50 %	125622884
11	NC_009004	TATC	2	8	2501	2508	25 %	50 %	0 %	25 %	125622884
12	NC_009004	TGAT	2	8	2528	2535	25 %	50 %	25 %	0 %	125622884
13	NC_009004	GTAC	2	8	2650	2657	25 %	25 %	25 %	25 %	125622884
14	NC_009004	AATT	2	8	2659	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	125622884
15	NC_009004	TGTC	2	8	2709	2716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009004	GAAA	2	8	2898	2905	75 %	0 %	25 %	0 %	125622885
17	NC_009004	TTAT	2	8	3379	3386	25 %	75 %	0 %	0 %	125622885
18	NC_009004	AAAT	2	8	3507	3514	75 %	25 %	0 %	0 %	125622885
19	NC_009004	GACT	2	8	5184	5191	25 %	25 %	25 %	25 %	125622885
20	NC_009004	TATT	2	8	5433	5440	25 %	75 %	0 %	0 %	125622885
21	NC_009004	TCAT	2	8	5514	5521	25 %	50 %	0 %	25 %	125622885
22	NC_009004	TTTA	2	8	5621	5628	25 %	75 %	0 %	0 %	125622885
23	NC_009004	AACC	2	8	5638	5645	50 %	0 %	0 %	50 %	125622885
24	NC_009004	CAAT	2	8	5876	5883	50 %	25 %	0 %	25 %	125622885
25	NC_009004	ATGA	2	8	5986	5993	50 %	25 %	25 %	0 %	125622885
26	NC_009004	TTAT	2	8	6505	6512	25 %	75 %	0 %	0 %	125622886
27	NC_009004	AATT	2	8	7059	7066	50 %	50 %	0 %	0 %	125622886
28	NC_009004	TGAT	2	8	7263	7270	25 %	50 %	25 %	0 %	125622886
29	NC_009004	GAAA	2	8	7456	7463	75 %	0 %	25 %	0 %	125622886
30	NC_009004	TTTG	2	8	7954	7961	0 %	75 %	25 %	0 %	125622886
31	NC_009004	TCAA	2	8	8106	8113	50 %	25 %	0 %	25 %	125622886
32	NC_009004	GGCA	2	8	8232	8239	25 %	0 %	50 %	25 %	125622886
33	NC_009004	TAAA	2	8	8607	8614	75 %	25 %	0 %	0 %	125622886
34	NC_009004	GGAA	2	8	8761	8768	50 %	0 %	50 %	0 %	125622886
35	NC_009004	AGGT	2	8	9096	9103	25 %	25 %	50 %	0 %	125622886
36	NC_009004	CAGT	2	8	9114	9121	25 %	25 %	25 %	25 %	125622886
37	NC_009004	ATTT	2	8	9240	9247	25 %	75 %	0 %	0 %	125622886
38	NC_009004	AAAT	2	8	9990	9997	75 %	25 %	0 %	0 %	125622888
39	NC_009004	TGAG	2	8	10424	10431	25 %	25 %	50 %	0 %	125622888
40	NC_009004	TAAT	2	8	10726	10733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009004	AAAT	2	8	11017	11024	75 %	25 %	0 %	0 %	125622889
42	NC_009004	AATT	2	8	11160	11167	50 %	50 %	0 %	0 %	125622889
43	NC_009004	ACTT	2	8	11621	11628	25 %	50 %	0 %	25 %	125622889
44	NC_009004	GTGC	2	8	11648	11655	0 %	25 %	50 %	25 %	125622889
45	NC_009004	CAAA	2	8	11939	11946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009004	AAGG	2	8	11972	11979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009004	TCAG	2	8	12030	12037	25 %	25 %	25 %	25 %	125622890
48	NC_009004	ATCT	2	8	12073	12080	25 %	50 %	0 %	25 %	125622890
49	NC_009004	GGTT	2	8	12244	12251	0 %	50 %	50 %	0 %	125622890
50	NC_009004	TTGT	2	8	12799	12806	0 %	75 %	25 %	0 %	125622891
51	NC_009004	ATCT	2	8	12817	12824	25 %	50 %	0 %	25 %	125622891
52	NC_009004	TTTA	2	8	12895	12902	25 %	75 %	0 %	0 %	125622891
53	NC_009004	GCTA	2	8	13227	13234	25 %	25 %	25 %	25 %	125622891
54	NC_009004	TATG	2	8	13250	13257	25 %	50 %	25 %	0 %	125622891
55	NC_009004	AGGC	2	8	13387	13394	25 %	0 %	50 %	25 %	125622891
56	NC_009004	ATAG	2	8	13732	13739	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009004	TAAA	2	8	13794	13801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009004	ATTC	2	8	14153	14160	25 %	50 %	0 %	25 %	125622893
59	NC_009004	ATGA	2	8	14634	14641	50 %	25 %	25 %	0 %	125622894
60	NC_009004	CATG	2	8	14705	14712	25 %	25 %	25 %	25 %	125622894
61	NC_009004	GCGT	2	8	14737	14744	0 %	25 %	50 %	25 %	125622894
62	NC_009004	TGAT	2	8	16360	16367	25 %	50 %	25 %	0 %	125622895
63	NC_009004	AGTA	2	8	16668	16675	50 %	25 %	25 %	0 %	125622895
64	NC_009004	TCAA	2	8	16902	16909	50 %	25 %	0 %	25 %	125622895
65	NC_009004	AACC	2	8	17420	17427	50 %	0 %	0 %	50 %	125622895
66	NC_009004	AAAC	2	8	17455	17462	75 %	0 %	0 %	25 %	125622895
67	NC_009004	TGAG	2	8	18478	18485	25 %	25 %	50 %	0 %	125622895
68	NC_009004	TAAA	2	8	18742	18749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009004	CAAA	2	8	18831	18838	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009004	GAAT	2	8	19989	19996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009004	CTAT	2	8	20406	20413	25 %	50 %	0 %	25 %	125622899
72	NC_009004	AACT	2	8	20521	20528	50 %	25 %	0 %	25 %	125622899
73	NC_009004	AATA	2	8	20891	20898	75 %	25 %	0 %	0 %	125622899
74	NC_009004	TGCT	2	8	20961	20968	0 %	50 %	25 %	25 %	125622899
75	NC_009004	TGGT	2	8	21069	21076	0 %	50 %	50 %	0 %	125622899
76	NC_009004	AATT	2	8	21800	21807	50 %	50 %	0 %	0 %	125622900
77	NC_009004	ATTT	2	8	22056	22063	25 %	75 %	0 %	0 %	125622900
78	NC_009004	CAAA	2	8	22066	22073	75 %	0 %	0 %	25 %	125622900
79	NC_009004	AGTA	2	8	22128	22135	50 %	25 %	25 %	0 %	125622900
80	NC_009004	ATTG	2	8	22760	22767	25 %	50 %	25 %	0 %	125622901
81	NC_009004	GAAG	2	8	22988	22995	50 %	0 %	50 %	0 %	125622901
82	NC_009004	TACT	2	8	23197	23204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009004	AACA	2	8	23591	23598	75 %	0 %	0 %	25 %	125622902
84	NC_009004	TGCT	2	8	24061	24068	0 %	50 %	25 %	25 %	125622902
85	NC_009004	ATTT	2	8	24166	24173	25 %	75 %	0 %	0 %	125622902
86	NC_009004	ATCA	2	8	24197	24204	50 %	25 %	0 %	25 %	125622902
87	NC_009004	AAAC	2	8	24473	24480	75 %	0 %	0 %	25 %	125622902
88	NC_009004	TGAA	2	8	24559	24566	50 %	25 %	25 %	0 %	125622902
89	NC_009004	AAGA	2	8	24657	24664	75 %	0 %	25 %	0 %	125622902
90	NC_009004	TCAA	2	8	24671	24678	50 %	25 %	0 %	25 %	125622902
91	NC_009004	TGCT	2	8	24802	24809	0 %	50 %	25 %	25 %	125622902
92	NC_009004	CAAC	2	8	24831	24838	50 %	0 %	0 %	50 %	125622902
93	NC_009004	TGAT	2	8	25087	25094	25 %	50 %	25 %	0 %	125622902
94	NC_009004	GCGT	2	8	25784	25791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009004	TTTA	2	8	26426	26433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009004	CAAT	2	8	27110	27117	50 %	25 %	0 %	25 %	125622903
97	NC_009004	TGGC	2	8	27356	27363	0 %	25 %	50 %	25 %	125622903
98	NC_009004	AGGA	2	8	28546	28553	50 %	0 %	50 %	0 %	125622904
99	NC_009004	ATTG	2	8	28646	28653	25 %	50 %	25 %	0 %	125622904
100	NC_009004	AAGC	2	8	28920	28927	50 %	0 %	25 %	25 %	125622904
101	NC_009004	AAGA	2	8	29388	29395	75 %	0 %	25 %	0 %	125622904
102	NC_009004	GTAA	2	8	29544	29551	50 %	25 %	25 %	0 %	125622904
103	NC_009004	TTCA	2	8	30031	30038	25 %	50 %	0 %	25 %	125622904
104	NC_009004	ATCA	2	8	30385	30392	50 %	25 %	0 %	25 %	125622905
105	NC_009004	AATT	2	8	30417	30424	50 %	50 %	0 %	0 %	125622905
106	NC_009004	GCTG	2	8	30738	30745	0 %	25 %	50 %	25 %	125622905
107	NC_009004	TAAA	2	8	30915	30922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009004	AGTA	2	8	30928	30935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009004	AGAA	2	8	31695	31702	75 %	0 %	25 %	0 %	125622906
110	NC_009004	AGTC	2	8	31964	31971	25 %	25 %	25 %	25 %	125622906
111	NC_009004	CGAA	2	8	32291	32298	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009004	ATCA	2	8	32909	32916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009004	TCAA	2	8	32974	32981	50 %	25 %	0 %	25 %	125622907
114	NC_009004	TTTA	2	8	33013	33020	25 %	75 %	0 %	0 %	125622907
115	NC_009004	TTCA	2	8	33289	33296	25 %	50 %	0 %	25 %	125622907
116	NC_009004	AGTA	2	8	33907	33914	50 %	25 %	25 %	0 %	125622909
117	NC_009004	TATT	2	8	34422	34429	25 %	75 %	0 %	0 %	125622910
118	NC_009004	TGCA	2	8	34572	34579	25 %	25 %	25 %	25 %	125622910
119	NC_009004	GTTT	2	8	34616	34623	0 %	75 %	25 %	0 %	125622910
120	NC_009004	AATT	2	8	34926	34933	50 %	50 %	0 %	0 %	125622910
121	NC_009004	CGGT	2	8	35502	35509	0 %	25 %	50 %	25 %	125622911
122	NC_009004	CAGC	2	8	36184	36191	25 %	0 %	25 %	50 %	125622911
123	NC_009004	GAAA	2	8	36447	36454	75 %	0 %	25 %	0 %	125622911
124	NC_009004	GTTT	2	8	36460	36467	0 %	75 %	25 %	0 %	125622911
125	NC_009004	CCAG	2	8	36717	36724	25 %	0 %	25 %	50 %	125622911
126	NC_009004	AGTG	2	8	37184	37191	25 %	25 %	50 %	0 %	125622912
127	NC_009004	CTGA	2	8	37310	37317	25 %	25 %	25 %	25 %	125622912
128	NC_009004	CTTG	2	8	37848	37855	0 %	50 %	25 %	25 %	125622913
129	NC_009004	TTGT	2	8	37983	37990	0 %	75 %	25 %	0 %	125622913
130	NC_009004	TTGC	2	8	38046	38053	0 %	50 %	25 %	25 %	125622914
131	NC_009004	TCCG	2	8	38210	38217	0 %	25 %	25 %	50 %	125622914
132	NC_009004	TAAA	2	8	38751	38758	75 %	25 %	0 %	0 %	125622916
133	NC_009004	TTCA	2	8	38809	38816	25 %	50 %	0 %	25 %	125622916
134	NC_009004	GATA	2	8	39089	39096	50 %	25 %	25 %	0 %	125622917
135	NC_009004	TTTG	2	8	39433	39440	0 %	75 %	25 %	0 %	125622918
136	NC_009004	TTGT	2	8	39719	39726	0 %	75 %	25 %	0 %	125622919
137	NC_009004	TAAA	2	8	39808	39815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009004	TAAG	2	8	40167	40174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009004	CTGC	2	8	40447	40454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009004	GTTA	2	8	40487	40494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009004	AGTT	2	8	41212	41219	25 %	50 %	25 %	0 %	125622922
142	NC_009004	GATA	2	8	41407	41414	50 %	25 %	25 %	0 %	125622923
143	NC_009004	TGAT	2	8	42205	42212	25 %	50 %	25 %	0 %	125622924
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