MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 chromosome

Total Repeats: 29437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009004	ATT	2	6	164	169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622883
2	NC_009004	GAT	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622883
3	NC_009004	ATG	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622883
4	NC_009004	CGT	2	6	274	279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125622883
5	NC_009004	TGA	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622883
6	NC_009004	GCA	2	6	412	417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125622883
7	NC_009004	TGG	2	6	468	473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125622883
8	NC_009004	GAT	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622883
9	NC_009004	AAG	2	6	683	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622883
10	NC_009004	ACT	2	6	826	831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125622883
11	NC_009004	CTA	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125622883
12	NC_009004	CAA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125622883
13	NC_009004	ATT	2	6	1121	1126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622883
14	NC_009004	TGG	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125622883
15	NC_009004	ACA	2	6	1270	1275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125622883
16	NC_009004	TAA	2	6	1539	1544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125622884
17	NC_009004	ATA	2	6	1703	1708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125622884
18	NC_009004	TTA	2	6	1747	1752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622884
19	NC_009004	GCT	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125622884
20	NC_009004	GTA	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622884
21	NC_009004	TTG	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622884
22	NC_009004	TTC	2	6	1917	1922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125622884
23	NC_009004	AGA	2	6	2097	2102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622884
24	NC_009004	ATG	2	6	2171	2176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622884
25	NC_009004	AAG	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622884
26	NC_009004	TCA	2	6	2195	2200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125622884
27	NC_009004	TTA	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622884
28	NC_009004	TGC	2	6	2328	2333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125622884
29	NC_009004	GAA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622884
30	NC_009004	AAG	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622884
31	NC_009004	GAA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622884
32	NC_009004	ATT	2	6	2814	2819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622885
33	NC_009004	GAA	2	6	2833	2838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
34	NC_009004	TAC	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125622885
35	NC_009004	CTT	2	6	2873	2878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125622885
36	NC_009004	CAG	2	6	2936	2941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125622885
37	NC_009004	AAC	2	6	2969	2974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125622885
38	NC_009004	TTA	2	6	2979	2984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622885
39	NC_009004	CAA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125622885
40	NC_009004	TTG	2	6	3296	3301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622885
41	NC_009004	CAG	2	6	3316	3321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125622885
42	NC_009004	GAA	2	6	3370	3375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
43	NC_009004	TGT	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622885
44	NC_009004	TGA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
45	NC_009004	GAT	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
46	NC_009004	CTT	2	6	3539	3544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125622885
47	NC_009004	TTA	2	6	3605	3610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622885
48	NC_009004	TGA	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
49	NC_009004	AGA	2	6	3636	3641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
50	NC_009004	CAG	2	6	3770	3775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125622885
51	NC_009004	AAG	2	6	3794	3799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
52	NC_009004	AAG	2	6	3836	3841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
53	NC_009004	GAT	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
54	NC_009004	TGA	2	6	3966	3971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
55	NC_009004	AGA	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
56	NC_009004	ACT	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125622885
57	NC_009004	AAT	2	6	4138	4143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125622885
58	NC_009004	TGA	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
59	NC_009004	TTG	2	6	4448	4453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622885
60	NC_009004	TGA	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
61	NC_009004	TGA	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
62	NC_009004	TTG	2	6	5138	5143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622885
63	NC_009004	CAG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125622885
64	NC_009004	TGA	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
65	NC_009004	AAG	2	6	5234	5239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
66	NC_009004	AGA	2	6	5304	5309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
67	NC_009004	TGA	2	6	5355	5360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
68	NC_009004	AGT	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
69	NC_009004	TGA	2	6	5427	5432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
70	NC_009004	GAA	2	6	5447	5452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
71	NC_009004	ATG	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622885
72	NC_009004	AGA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
73	NC_009004	GCA	2	6	5734	5739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125622885
74	NC_009004	GAA	3	9	5794	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622885
75	NC_009004	AAT	2	6	5886	5891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125622885
76	NC_009004	TTG	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622886
77	NC_009004	TGA	2	6	6304	6309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622886
78	NC_009004	AAG	2	6	6477	6482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622886
79	NC_009004	TGA	2	6	6517	6522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622886
80	NC_009004	ATA	2	6	6840	6845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125622886
81	NC_009004	ATT	2	6	6898	6903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622886
82	NC_009004	TTC	2	6	6934	6939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125622886
83	NC_009004	TAG	2	6	6996	7001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622886
84	NC_009004	TTG	2	6	7035	7040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622886
85	NC_009004	ATT	2	6	7118	7123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622886
86	NC_009004	AGA	2	6	7210	7215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622886
87	NC_009004	ATG	2	6	7251	7256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622886
88	NC_009004	CTT	2	6	7313	7318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125622886
89	NC_009004	AGA	2	6	7555	7560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622886
90	NC_009004	CTT	2	6	7625	7630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125622886
91	NC_009004	GAA	2	6	7655	7660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622886
92	NC_009004	AGA	2	6	7663	7668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622886
93	NC_009004	GCA	2	6	7706	7711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125622886
94	NC_009004	TAA	4	12	7783	7794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125622886
95	NC_009004	GTT	2	6	7829	7834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622886
96	NC_009004	CAA	2	6	8140	8145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125622886
97	NC_009004	TAT	2	6	8189	8194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622886
98	NC_009004	AAT	2	6	8339	8344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125622886
99	NC_009004	TGA	2	6	8439	8444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622886
100	NC_009004	AGA	2	6	8479	8484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622886
101	NC_009004	ATG	2	6	8745	8750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622886
102	NC_009004	GAA	2	6	8936	8941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622886
103	NC_009004	ATA	2	6	8955	8960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125622886
104	NC_009004	TGA	2	6	8974	8979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622886
105	NC_009004	AAG	2	6	8985	8990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622886
106	NC_009004	TCA	2	6	9019	9024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125622886
107	NC_009004	GCT	2	6	9026	9031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125622886
108	NC_009004	CTG	2	6	9177	9182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125622886
109	NC_009004	TGA	2	6	9265	9270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622886
110	NC_009004	TGA	2	6	9280	9285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622886
111	NC_009004	AAG	2	6	9381	9386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622886
112	NC_009004	TGA	2	6	9409	9414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622886
113	NC_009004	AGG	2	6	9631	9636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125622886
114	NC_009004	TGA	3	9	9856	9864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622887
115	NC_009004	ACC	2	6	10047	10052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125622888
116	NC_009004	GAC	2	6	10389	10394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125622888
117	NC_009004	CAG	2	6	10767	10772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125622889
118	NC_009004	CAA	2	6	10860	10865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125622889
119	NC_009004	CAA	2	6	10950	10955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125622889
120	NC_009004	GAG	2	6	11001	11006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125622889
121	NC_009004	ATT	2	6	11054	11059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622889
122	NC_009004	GTT	2	6	11063	11068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622889
123	NC_009004	TGA	3	9	11077	11085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622889
124	NC_009004	AAT	2	6	11102	11107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125622889
125	NC_009004	TGA	2	6	11320	11325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125622889
126	NC_009004	TTG	2	6	11357	11362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125622889
127	NC_009004	AGA	2	6	11398	11403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622889
128	NC_009004	GCG	2	6	11456	11461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125622889
129	NC_009004	GAA	3	9	11501	11509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125622889
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262	NC_009004	ATT	2	6	23016	23021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125622901
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