MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanocorpusculum labreanum Z chromosome

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008942	CCCTCC	2	12	317	328	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
2	NC_008942	GAGTAA	2	12	24192	24203	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008942	TATTTG	2	12	142785	142796	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008942	ACTCTC	2	12	302509	302520	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008942	AGATGT	2	12	310098	310109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008942	AGGATA	2	12	451393	451404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008942	CAAAAA	3	18	488560	488577	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008942	TCTTTT	2	12	555310	555321	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008942	CATTTT	2	12	570153	570164	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008942	TGAACA	2	12	601315	601326	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008942	CTTTTT	2	12	608186	608197	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008942	GGAAAG	2	12	666090	666101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008942	GGCGGA	2	12	705736	705747	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008942	AGAAAG	2	12	705935	705946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008942	TGATAT	2	12	706334	706345	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008942	AATGAA	2	12	746190	746201	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008942	ATTTTC	2	12	746328	746339	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008942	TTATAA	2	12	768682	768693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008942	GAGAAT	2	12	787357	787368	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008942	GATCTC	2	12	799095	799106	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008942	TTATAT	2	12	801521	801532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008942	TTGCGA	2	12	830423	830434	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008942	GACATT	2	12	830668	830679	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008942	ATAAAA	2	12	842539	842550	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008942	TAACAC	2	12	849097	849108	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008942	TACGGG	2	12	873438	873449	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008942	TCTCCC	2	12	877231	877242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_008942	TTCATC	2	12	881195	881206	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008942	GATGCA	2	12	896829	896840	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008942	CGAAAT	2	12	899030	899041	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008942	GAACAG	2	12	899331	899342	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008942	TTTTTC	2	12	899532	899543	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008942	ATATTA	2	12	901509	901520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008942	TTTTTC	2	12	966808	966819	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008942	GGAGAT	2	12	978841	978852	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008942	ATTTGT	2	12	979182	979193	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008942	GATAAA	2	12	1011505	1011516	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008942	GAAAAA	2	12	1022651	1022662	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008942	TTGCTC	2	12	1042870	1042881	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008942	ATCAAC	2	12	1071198	1071209	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008942	TGAAAT	2	12	1158972	1158983	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008942	AAATCG	2	12	1159004	1159015	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008942	CATCCA	2	12	1166399	1166410	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008942	GAAAAA	2	12	1197998	1198009	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008942	AAAAGA	2	12	1236187	1236198	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008942	CAAACA	2	12	1241939	1241950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008942	TTCAGA	2	12	1276717	1276728	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008942	TGAGAG	2	12	1301648	1301659	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008942	TAAATT	2	12	1318215	1318226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008942	CAAAAC	2	12	1343697	1343708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008942	AAAAAT	2	12	1422911	1422922	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008942	TGATAT	2	12	1460707	1460718	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008942	TTCATT	2	12	1461581	1461592	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008942	ATTACT	2	12	1461824	1461835	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008942	ATTCCG	2	12	1473103	1473114	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008942	TAGTGA	2	12	1536311	1536322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008942	ACCATT	2	12	1537513	1537524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008942	AAAATC	2	12	1593787	1593798	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_008942	CGATCG	2	12	1616364	1616375	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008942	ACCGGT	2	12	1616422	1616433	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008942	ACATAT	2	12	1634995	1635006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008942	CCAGAT	2	12	1648330	1648341	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008942	AAATAT	2	12	1657267	1657278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008942	GGTTTT	2	12	1674302	1674313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008942	TTCTTT	2	12	1688015	1688026	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008942	TAATAT	2	12	1714042	1714053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008942	TTAATA	3	18	1785894	1785911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008942	TATTAA	2	12	1790178	1790189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008942	TCATTC	2	12	1796539	1796550	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.