MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanocorpusculum labreanum Z chromosome

Total Repeats: 22319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008942	ATC	2	6	1005	1010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484830
2	NC_008942	TAT	2	6	1109	1114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124484830
3	NC_008942	CCG	2	6	1197	1202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484830
4	NC_008942	TCA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484830
5	NC_008942	CGT	2	6	1265	1270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484830
6	NC_008942	CTC	2	6	1500	1505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484830
7	NC_008942	TCA	2	6	1546	1551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484830
8	NC_008942	CCG	2	6	1601	1606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484830
9	NC_008942	TCA	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484830
10	NC_008942	ATC	2	6	1644	1649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484830
11	NC_008942	GAC	2	6	1685	1690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484830
12	NC_008942	CAG	2	6	1855	1860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484831
13	NC_008942	TCC	2	6	1947	1952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484831
14	NC_008942	ACT	2	6	1974	1979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484831
15	NC_008942	ATG	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484831
16	NC_008942	TCG	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484831
17	NC_008942	TTA	2	6	2289	2294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124484831
18	NC_008942	TTC	2	6	2373	2378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484832
19	NC_008942	AGC	2	6	2557	2562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484832
20	NC_008942	ATC	2	6	2592	2597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484832
21	NC_008942	GAC	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484832
22	NC_008942	CGT	2	6	2642	2647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484832
23	NC_008942	GTT	2	6	2670	2675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124484832
24	NC_008942	ATC	2	6	2817	2822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484832
25	NC_008942	ATC	3	9	2886	2894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484832
26	NC_008942	TCT	2	6	2903	2908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484832
27	NC_008942	CGG	2	6	2962	2967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484832
28	NC_008942	GGC	2	6	3040	3045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484832
29	NC_008942	CCA	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124484832
30	NC_008942	TGA	2	6	3106	3111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484832
31	NC_008942	TGC	2	6	3137	3142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484832
32	NC_008942	GAG	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124484832
33	NC_008942	AGA	2	6	3204	3209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484832
34	NC_008942	CGA	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484832
35	NC_008942	AGC	2	6	3340	3345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484832
36	NC_008942	GCG	2	6	3382	3387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484832
37	NC_008942	ATC	2	6	3589	3594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484833
38	NC_008942	GCG	2	6	3619	3624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484833
39	NC_008942	ATC	2	6	3645	3650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484833
40	NC_008942	AGG	2	6	3688	3693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124484833
41	NC_008942	GAT	2	6	3701	3706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484833
42	NC_008942	CAG	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484833
43	NC_008942	ATG	2	6	3849	3854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484833
44	NC_008942	CAG	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484833
45	NC_008942	ATC	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484833
46	NC_008942	TGA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484833
47	NC_008942	GCA	2	6	4231	4236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484833
48	NC_008942	TGG	2	6	4324	4329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124484833
49	NC_008942	GCC	2	6	4416	4421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484833
50	NC_008942	GAA	2	6	4597	4602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484833
51	NC_008942	GAT	2	6	4608	4613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484833
52	NC_008942	CCT	2	6	4636	4641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484833
53	NC_008942	CAT	2	6	4766	4771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484833
54	NC_008942	CCT	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484833
55	NC_008942	GAA	2	6	5138	5143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484834
56	NC_008942	AGA	2	6	5170	5175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484834
57	NC_008942	GTC	2	6	5244	5249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484834
58	NC_008942	CAA	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124484834
59	NC_008942	AAC	2	6	5375	5380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124484834
60	NC_008942	GCA	2	6	5385	5390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
61	NC_008942	TCT	2	6	5468	5473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484834
62	NC_008942	CGG	2	6	5513	5518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484834
63	NC_008942	CCT	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484834
64	NC_008942	CGG	3	9	5609	5617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484834
65	NC_008942	GAC	2	6	5685	5690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
66	NC_008942	ATC	2	6	5787	5792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484834
67	NC_008942	GCA	2	6	5820	5825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
68	NC_008942	GCA	2	6	5856	5861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
69	NC_008942	TCC	2	6	5875	5880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484834
70	NC_008942	GCA	2	6	5892	5897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
71	NC_008942	GCA	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
72	NC_008942	AGA	2	6	5944	5949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484834
73	NC_008942	TTG	3	9	5989	5997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124484834
74	NC_008942	ATC	3	9	6000	6008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484834
75	NC_008942	CAT	2	6	6011	6016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484834
76	NC_008942	TTG	2	6	6124	6129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124484834
77	NC_008942	TAC	2	6	6159	6164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484834
78	NC_008942	ATC	2	6	6231	6236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484834
79	NC_008942	ATC	2	6	6282	6287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484834
80	NC_008942	GCA	2	6	6342	6347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
81	NC_008942	CCA	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124484834
82	NC_008942	GCA	2	6	6498	6503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
83	NC_008942	CGG	2	6	6632	6637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484834
84	NC_008942	CAG	2	6	6673	6678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
85	NC_008942	GCA	2	6	6687	6692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
86	NC_008942	AGA	2	6	6694	6699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484834
87	NC_008942	TCG	2	6	6700	6705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484834
88	NC_008942	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484834
89	NC_008942	AGC	2	6	6797	6802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
90	NC_008942	GAT	2	6	6812	6817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484834
91	NC_008942	TCT	2	6	6827	6832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484834
92	NC_008942	CGG	2	6	6884	6889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484834
93	NC_008942	TCC	2	6	6919	6924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484834
94	NC_008942	AAG	2	6	6969	6974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484834
95	NC_008942	CGG	2	6	6995	7000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484834
96	NC_008942	AGC	2	6	7022	7027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
97	NC_008942	TGT	2	6	7028	7033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124484834
98	NC_008942	CTG	2	6	7140	7145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484834
99	NC_008942	ATC	2	6	7251	7256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484835
100	NC_008942	AGC	2	6	7260	7265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484835
101	NC_008942	CTT	2	6	7330	7335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484835
102	NC_008942	CCG	2	6	7353	7358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484835
103	NC_008942	CAT	2	6	7399	7404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484835
104	NC_008942	CCT	2	6	7504	7509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484835
105	NC_008942	CTG	2	6	7777	7782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484836
106	NC_008942	ATC	2	6	7827	7832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484836
107	NC_008942	CAT	2	6	8405	8410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484837
108	NC_008942	ATT	2	6	8498	8503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124484837
109	NC_008942	CTG	2	6	8668	8673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484837
110	NC_008942	TCC	2	6	8686	8691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484837
111	NC_008942	TCA	2	6	8731	8736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484837
112	NC_008942	CGG	2	6	8839	8844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484837
113	NC_008942	CTC	2	6	8857	8862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484837
114	NC_008942	TCA	2	6	8994	8999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484838
115	NC_008942	GCT	3	9	9011	9019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484838
116	NC_008942	ATG	2	6	9074	9079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484838
117	NC_008942	GAC	2	6	9095	9100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484838
118	NC_008942	GAT	2	6	9164	9169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484838
119	NC_008942	GGC	2	6	9203	9208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484838
120	NC_008942	ACA	2	6	9252	9257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124484838
121	NC_008942	AGA	2	6	9298	9303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484838
122	NC_008942	CGC	2	6	9403	9408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484838
123	NC_008942	TCA	2	6	9544	9549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484838
124	NC_008942	AGA	2	6	9581	9586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484838
125	NC_008942	ACG	2	6	9795	9800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484838
126	NC_008942	ATC	2	6	9812	9817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484838
127	NC_008942	GGC	2	6	9977	9982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484838
128	NC_008942	CTC	2	6	9987	9992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484838
129	NC_008942	TCA	2	6	10002	10007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484838
130	NC_008942	GCA	2	6	10034	10039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484838
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132	NC_008942	TCA	2	6	10095	10100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484838
133	NC_008942	TGC	2	6	10605	10610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484839
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135	NC_008942	ATT	2	6	10858	10863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124484839
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142	NC_008942	CTG	2	6	11510	11515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484840
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500	NC_008942	CGA	2	6	41776	41781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484868

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