MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia mallei NCTC 10229 chromosome I

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008836	CGAGCG	2	12	47	58	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008836	TGCCGA	2	12	2756	2767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008836	CGGGCG	2	12	15537	15548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008836	GCCGTT	2	12	22651	22662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008836	GGCGCG	2	12	23253	23264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008836	ACGCCG	2	12	73896	73907	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008836	GCGCCG	2	12	77521	77532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008836	CATGCG	2	12	106344	106355	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008836	GGCTGA	2	12	116740	116751	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008836	CCGTGC	2	12	140752	140763	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008836	GAAAAA	2	12	146773	146784	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008836	GCGTCG	2	12	153343	153354	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008836	GGTCAC	2	12	157968	157979	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008836	CGACGT	2	12	161365	161376	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008836	CGCCGT	2	12	161545	161556	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008836	CGGCGC	2	12	178450	178461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008836	GCGGAA	2	12	200704	200715	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008836	CGCGTG	2	12	202307	202318	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008836	GCTACG	2	12	219836	219847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008836	CGTCAC	2	12	219990	220001	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008836	GCGCGT	2	12	224265	224276	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008836	GTCGCC	2	12	247833	247844	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008836	CGCCCG	2	12	266508	266519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_008836	TCGCGC	2	12	276537	276548	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008836	CCTGTC	2	12	319529	319540	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008836	CCGGCG	2	12	330136	330147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008836	CGCCTG	4	24	366756	366779	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008836	TGCTTC	2	12	389592	389603	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008836	CGGTCG	2	12	476424	476435	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008836	CGCCCG	2	12	481676	481687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008836	GACGTC	2	12	486897	486908	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008836	GAGACG	2	12	493524	493535	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008836	GCTGTC	4	24	526831	526854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008836	GCCGTT	2	12	526855	526866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008836	GCCGCG	2	12	532390	532401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008836	CGACAG	3	18	546133	546150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008836	GGCTTC	2	12	580973	580984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008836	ACGCGC	2	12	581184	581195	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008836	CCGCGA	2	12	581367	581378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008836	CTCGCC	2	12	589294	589305	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_008836	TCGGCC	2	12	601431	601442	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008836	CGGACG	2	12	614047	614058	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008836	CCGCGT	2	12	625440	625451	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008836	GCCCGC	2	12	643276	643287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_008836	TTCGGT	3	18	643715	643732	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008836	GACTCG	4	24	643748	643771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008836	GACTTT	2	12	643772	643783	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008836	GCCCAT	3	18	645790	645807	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008836	GGGTTG	2	12	648075	648086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008836	CTCAGA	3	18	648127	648144	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008836	ACTCGG	2	12	648150	648161	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008836	CTTCGC	7	42	659761	659802	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008836	CTTCGA	2	12	667700	667711	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008836	ATCCGC	2	12	669601	669612	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008836	GCTTTC	2	12	670927	670938	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008836	CGTCAA	6	36	678138	678173	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008836	CAGCAA	2	12	678174	678185	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008836	TGCGCG	2	12	690221	690232	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008836	CGCCAT	2	12	693952	693963	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008836	ATGAGA	2	12	714606	714617	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008836	CCCGGC	2	12	715014	715025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008836	GCACGC	2	12	766120	766131	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008836	TAGCGC	2	12	771171	771182	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008836	GGGCGC	2	12	808761	808772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008836	CGTCCG	2	12	846119	846130	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008836	GTCACT	2	12	877598	877609	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008836	CGGCTC	2	12	886834	886845	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008836	GCCCCG	2	12	894394	894405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_008836	GCGCTC	2	12	905777	905788	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008836	GCCGTT	5	30	911364	911393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008836	CCGAAG	2	12	911984	911995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008836	CGAGCC	2	12	912043	912054	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008836	CTTTTG	2	12	926382	926393	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008836	CGAAGC	3	18	935473	935490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008836	CAAAGC	5	30	935491	935520	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008836	CGATGC	2	12	952971	952982	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008836	CCGATG	2	12	956666	956677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008836	CTTTTT	2	12	979921	979932	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008836	GCGCTC	2	12	992062	992073	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008836	GGCCGG	2	12	1003480	1003491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008836	CGCCGG	2	12	1015423	1015434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008836	AACGCA	2	12	1022436	1022447	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008836	TGACGA	2	12	1036757	1036768	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_008836	GTTCGC	2	12	1055487	1055498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008836	GCCACC	2	12	1138533	1138544	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_008836	ACGGGG	2	12	1159272	1159283	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_008836	TCCGAT	2	12	1205859	1205870	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008836	TCGCGA	2	12	1231399	1231410	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008836	GCGCCC	2	12	1234187	1234198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_008836	CGCACG	2	12	1240829	1240840	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008836	TGCGCC	2	12	1266246	1266257	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008836	CGCTCG	2	12	1312667	1312678	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008836	CTCTTT	2	12	1368546	1368557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008836	GCTTTC	2	12	1398720	1398731	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008836	GAGCGC	2	12	1405293	1405304	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008836	TCGCGC	2	12	1405387	1405398	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008836	CGATAT	2	12	1407861	1407872	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008836	TGCCGA	2	12	1426840	1426851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008836	CGGCCC	2	12	1467003	1467014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008836	ACGGAA	2	12	1480311	1480322	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_008836	AAGCGC	2	12	1480822	1480833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008836	CGAAAA	2	12	1514266	1514277	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_008836	ACGCGC	2	12	1548505	1548516	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008836	TTTCGC	2	12	1572800	1572811	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008836	GCTGAA	2	12	1588228	1588239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_008836	CATCGA	2	12	1612579	1612590	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008836	ATACGT	2	12	1668225	1668236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008836	TAAACC	2	12	1668242	1668253	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008836	CGACAA	2	12	1695200	1695211	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008836	CGGCCG	2	12	1698534	1698545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008836	GCAAGG	2	12	1722248	1722259	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008836	CCCGTT	2	12	1751042	1751053	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008836	GCGCGA	2	12	1766829	1766840	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008836	TTCGCC	2	12	1766847	1766858	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008836	GTATGC	2	12	1785966	1785977	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_008836	GCCAGT	3	18	1824040	1824057	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008836	ATCGAC	2	12	1827604	1827615	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008836	TCCGTT	2	12	1854100	1854111	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008836	GGCGTG	2	12	1855276	1855287	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_008836	TGCCTG	2	12	1862967	1862978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008836	CGCAGA	2	12	1866759	1866770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008836	CGCGGC	2	12	1869486	1869497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008836	GCGGGC	2	12	1895232	1895243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008836	GCATCG	2	12	1913321	1913332	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008836	AGTAAT	2	12	1938153	1938164	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008836	CGTTTT	2	12	1977588	1977599	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_008836	CATCCG	2	12	1978865	1978876	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008836	GCGGGC	2	12	1994329	1994340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008836	GGCGAC	2	12	1997628	1997639	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008836	CCCGTT	2	12	2005447	2005458	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008836	GTCGAG	2	12	2006219	2006230	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_008836	ACTGTC	2	12	2094036	2094047	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008836	GCACCG	2	12	2102621	2102632	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008836	CGGCCG	2	12	2103891	2103902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008836	ACGCCT	2	12	2104315	2104326	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008836	CGGCAA	2	12	2114554	2114565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008836	GCGCCG	2	12	2174670	2174681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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139	NC_008836	CGAATC	4	24	2283971	2283994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008836	ATGCGC	2	12	2294335	2294346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008836	CAAAAG	2	12	2300043	2300054	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_008836	GAAAAA	2	12	2318343	2318354	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_008836	CGGCGC	2	12	2402290	2402301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008836	CCGCGC	2	12	2403163	2403174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_008836	CCGCTG	4	24	2423941	2423964	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008836	GGGAGG	2	12	2425527	2425538	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008836	GCGGGC	2	12	2440603	2440614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_008836	TGCGCG	2	12	2457049	2457060	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_008836	ATCGAC	2	12	2578120	2578131	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.