MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylibium petroleiphilum PM1 plasmid RPME01

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008826	GCCGGC	2	12	27496	27507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008826	CGGCCG	2	12	31031	31042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008826	ATACAG	2	12	33204	33215	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008826	GCTGAA	2	12	62604	62615	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008826	CCTTTT	2	12	84153	84164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008826	GGCGCA	2	12	87383	87394	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008826	GGGTGC	2	12	107810	107821	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008826	GGAACA	2	12	150635	150646	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008826	GGCCGC	2	12	186218	186229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008826	GGCCGC	2	12	192185	192196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008826	GCGCGT	2	12	194070	194081	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008826	GACCAC	2	12	195024	195035	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008826	AGGCCG	2	12	246006	246017	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008826	CTGGGA	2	12	250022	250033	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008826	GCTTCG	2	12	250074	250085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008826	CGGCGC	2	12	308784	308795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008826	AACGCC	2	12	359269	359280	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008826	TGCGCA	2	12	402574	402585	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008826	TGCGCA	2	12	434644	434655	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008826	GCGGCC	2	12	438965	438976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008826	GCTGAA	2	12	521576	521587	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_008826	GCCCGT	2	12	523092	523103	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008826	GTGTGC	2	12	561913	561924	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008826	CCACCT	2	12	592425	592436	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.