MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylibium petroleiphilum PM1 plasmid RPME01

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008826	ACCCA	2	10	1398	1407	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_008826	CGGTG	2	10	7465	7474	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008826	CTTTG	2	10	13312	13321	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008826	GCCGT	2	10	34026	34035	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_008826	CTTCG	2	10	34165	34174	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008826	CGGGC	2	10	35237	35246	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_008826	AGCGA	2	10	37130	37139	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008826	CTCGG	2	10	37224	37233	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_008826	GCCCT	2	10	39065	39074	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_008826	CGGCC	2	10	53345	53354	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_008826	CCGGT	2	10	56336	56345	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_008826	GCCCT	2	10	66516	66525	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_008826	CAACC	2	10	73636	73645	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_008826	TCACC	2	10	74719	74728	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_008826	GCGCA	2	10	85868	85877	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_008826	TGGGG	2	10	87423	87432	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008826	GCACC	2	10	89219	89228	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_008826	GGTTC	2	10	104832	104841	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_008826	AAGAA	2	10	105892	105901	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008826	AGGTG	2	10	107058	107067	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008826	GGTCT	2	10	107763	107772	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008826	GCGGG	2	10	108502	108511	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008826	ACGAG	2	10	115018	115027	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_008826	CGCAA	2	10	116861	116870	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_008826	CCCGA	2	10	117486	117495	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_008826	ACCCC	2	10	120625	120634	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
27	NC_008826	GCGCC	2	10	122418	122427	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_008826	GAAAG	2	10	134204	134213	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008826	CTGAA	2	10	143168	143177	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008826	CCCCT	2	10	161893	161902	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
31	NC_008826	CCACG	2	10	169676	169685	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_008826	AGCGA	2	10	174696	174705	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008826	TGAGT	2	10	176939	176948	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008826	GCCGC	2	10	197400	197409	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
35	NC_008826	CGGCC	2	10	198837	198846	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_008826	CCGGC	2	10	200840	200849	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_008826	CTTTT	2	10	204709	204718	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008826	CGCAG	2	10	211661	211670	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_008826	CGAAT	2	10	214761	214770	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008826	CTTTT	2	10	216750	216759	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008826	TGTCG	2	10	220012	220021	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008826	CCGGC	2	10	220225	220234	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_008826	CCGCG	2	10	233805	233814	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44	NC_008826	AGCGC	2	10	244086	244095	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_008826	CCTGG	2	10	250102	250111	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_008826	CCGAT	2	10	279122	279131	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_008826	TCGCG	2	10	279152	279161	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_008826	CACAC	2	10	280904	280913	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
49	NC_008826	AAGGA	2	10	280988	280997	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008826	TACAC	2	10	289896	289905	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_008826	TTTCC	2	10	303486	303495	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_008826	GCAGC	2	10	308436	308445	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_008826	CTTCT	2	10	313610	313619	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_008826	GATAG	2	10	315649	315658	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008826	GCAAA	2	10	329667	329676	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008826	CGGCG	2	10	332373	332382	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_008826	TACAC	2	10	332933	332942	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_008826	TGTCG	2	10	342049	342058	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008826	ATCGG	2	10	342504	342513	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008826	TTTTC	2	10	342516	342525	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_008826	TCTCC	2	10	345148	345157	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_008826	CCATC	2	10	348470	348479	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_008826	CCAAC	2	10	361218	361227	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_008826	CGCGC	2	10	398973	398982	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65	NC_008826	AGGCC	2	10	400071	400080	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_008826	CTGGC	2	10	400550	400559	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_008826	CGCGC	2	10	431043	431052	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
68	NC_008826	AGGCC	2	10	432141	432150	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_008826	CTGGC	2	10	432620	432629	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_008826	CGCAC	2	10	457698	457707	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
71	NC_008826	CGACC	2	10	460507	460516	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_008826	GCGCG	2	10	475820	475829	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_008826	GTCCC	2	10	475954	475963	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_008826	CCAGC	2	10	479883	479892	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_008826	GCGCC	2	10	481467	481476	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_008826	CGGGC	2	10	485090	485099	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_008826	TGGCT	2	10	504636	504645	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008826	CATGG	2	10	510280	510289	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_008826	GCTGC	2	10	514505	514514	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_008826	TGCGC	2	10	514984	514993	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_008826	TGAGC	2	10	525186	525195	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_008826	CTCGA	2	10	525418	525427	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_008826	CCTCA	2	10	525622	525631	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NC_008826	TGCGC	2	10	528757	528766	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_008826	TCCCG	2	10	539745	539754	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_008826	GCGAA	2	10	564330	564339	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_008826	CCGCG	2	10	580546	580555	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.