MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylibium petroleiphilum PM1 plasmid RPME01

Total Repeats: 259

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008826	GCGT	2	8	10535	10542	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008826	ACAT	2	8	11960	11967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008826	GTAG	2	8	12957	12964	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008826	GGCC	2	8	13166	13173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008826	GCCC	2	8	13177	13184	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_008826	CCGA	2	8	13285	13292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008826	CCGT	2	8	15495	15502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008826	CGGC	2	8	21722	21729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008826	CGGA	2	8	27476	27483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008826	CCGG	2	8	32650	32657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008826	ACGT	2	8	33025	33032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008826	ACCG	2	8	33284	33291	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008826	TCTT	2	8	33354	33361	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008826	GGCT	2	8	33438	33445	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008826	AGCA	2	8	33983	33990	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008826	CCCG	2	8	34047	34054	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_008826	CGAC	2	8	34084	34091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008826	TCGC	2	8	34516	34523	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008826	CTGT	2	8	37838	37845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008826	CGGC	2	8	37861	37868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008826	ACTC	2	8	38688	38695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008826	GCGG	2	8	38819	38826	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008826	GGCC	2	8	38983	38990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008826	CGCC	2	8	42259	42266	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_008826	GGCC	2	8	43677	43684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008826	CTTC	2	8	53161	53168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008826	AGCG	2	8	54072	54079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008826	AAGG	2	8	54213	54220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008826	CTCG	2	8	62591	62598	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008826	GCAA	2	8	65217	65224	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008826	TATT	2	8	65415	65422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008826	GCCG	2	8	65787	65794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008826	TGAA	2	8	71430	71437	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008826	TCGG	2	8	74482	74489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008826	GTCG	2	8	74595	74602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008826	GCCG	2	8	74753	74760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008826	TTGC	2	8	74855	74862	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008826	TCGA	2	8	74947	74954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008826	TTTC	2	8	81337	81344	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008826	TCGT	2	8	82142	82149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008826	GCAC	2	8	84919	84926	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008826	GCCC	2	8	88527	88534	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_008826	GGGC	2	8	88549	88556	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008826	GAAA	2	8	88905	88912	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008826	TCGA	2	8	89116	89123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008826	CCAC	2	8	89127	89134	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_008826	AACC	2	8	89233	89240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008826	GTCT	2	8	89279	89286	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008826	TTCA	2	8	89900	89907	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008826	TCGC	2	8	94819	94826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008826	GACG	2	8	101767	101774	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008826	CGGC	2	8	103570	103577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008826	CAAT	2	8	105966	105973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008826	GCCG	2	8	106980	106987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008826	CGGG	2	8	107110	107117	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008826	GGCG	2	8	107287	107294	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008826	CGGT	2	8	107388	107395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008826	GGCG	2	8	107592	107599	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008826	CCGG	2	8	107787	107794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008826	GTTG	2	8	108222	108229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008826	GCGG	2	8	108231	108238	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008826	GCGT	2	8	108273	108280	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008826	TGGT	2	8	108483	108490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008826	ATGG	2	8	108917	108924	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008826	AAGG	2	8	113226	113233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008826	ACTG	2	8	116880	116887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008826	CCAA	2	8	120591	120598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008826	TCGG	2	8	121625	121632	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008826	CCTC	2	8	122129	122136	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_008826	CGGC	2	8	122138	122145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008826	GCTG	2	8	122309	122316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008826	TCTT	2	8	122998	123005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008826	CATC	2	8	127912	127919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008826	CAAC	2	8	128021	128028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008826	CCTG	2	8	128091	128098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008826	CAAC	2	8	128161	128168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008826	GGCC	2	8	128288	128295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008826	TGCG	2	8	128296	128303	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008826	CTTC	2	8	128852	128859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008826	CGGC	2	8	131436	131443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008826	GACC	2	8	133501	133508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008826	CCGC	2	8	133509	133516	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_008826	CCCG	2	8	134254	134261	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_008826	CCGC	2	8	135441	135448	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_008826	CTTT	2	8	135472	135479	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008826	TGCT	2	8	135501	135508	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008826	GAAC	2	8	135677	135684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008826	AGCG	2	8	136526	136533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008826	CCGC	2	8	137366	137373	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_008826	GCCA	2	8	142096	142103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008826	CGGC	2	8	143549	143556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008826	GTGC	2	8	150678	150685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008826	CGGC	2	8	161924	161931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008826	GCGG	2	8	162024	162031	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008826	GAAG	2	8	164226	164233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008826	AGCC	2	8	164264	164271	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008826	CTGA	2	8	164502	164509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008826	TTCA	2	8	164517	164524	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008826	GTCG	2	8	173140	173147	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008826	TCGA	2	8	173230	173237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008826	CCAG	2	8	174970	174977	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008826	GGTG	2	8	179251	179258	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008826	GCGA	2	8	184263	184270	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008826	GCGA	2	8	194020	194027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008826	TCCT	2	8	194833	194840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008826	GCCC	2	8	198130	198137	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_008826	CGAG	2	8	200770	200777	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008826	CTGC	2	8	200826	200833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008826	GATC	2	8	205487	205494	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008826	CCCG	2	8	216051	216058	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_008826	CGGG	2	8	217087	217094	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008826	CGCC	2	8	218751	218758	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_008826	ACCC	2	8	219416	219423	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_008826	TTCC	2	8	220114	220121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008826	CCGC	2	8	220217	220224	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_008826	CGGC	2	8	220262	220269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008826	CCCG	2	8	226536	226543	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_008826	CGGG	2	8	237213	237220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008826	CGCC	2	8	240605	240612	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_008826	GCCT	2	8	243082	243089	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008826	TCCG	2	8	243096	243103	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008826	ATGG	2	8	244247	244254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008826	GCCG	2	8	244868	244875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008826	GCGG	2	8	244958	244965	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008826	TCGT	2	8	247613	247620	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_008826	CTCG	2	8	249699	249706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008826	GCCT	2	8	250116	250123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008826	CGCC	3	12	257247	257258	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_008826	CCGC	2	8	263461	263468	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_008826	CCGC	2	8	264987	264994	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_008826	GATA	2	8	269537	269544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008826	AGGT	2	8	276902	276909	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008826	CTTC	2	8	282865	282872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008826	CGCC	2	8	283514	283521	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_008826	ACCT	2	8	283615	283622	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008826	GCAA	2	8	284135	284142	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008826	TGCG	2	8	284183	284190	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008826	CTTT	2	8	285319	285326	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008826	GTGG	2	8	286241	286248	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008826	GCCC	2	8	287033	287040	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_008826	ACCC	2	8	289828	289835	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_008826	TGCT	2	8	289922	289929	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008826	GCCG	2	8	290157	290164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008826	TTCG	2	8	291961	291968	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008826	GCAA	2	8	292100	292107	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008826	CGCC	2	8	298201	298208	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_008826	GCCG	2	8	302046	302053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008826	ATGC	2	8	303621	303628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008826	TCCC	2	8	304222	304229	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
150	NC_008826	TCGT	2	8	304318	304325	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008826	CTTC	2	8	308495	308502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_008826	CTTG	2	8	308637	308644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_008826	GCCC	2	8	310177	310184	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
154	NC_008826	TTTC	2	8	310205	310212	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_008826	AGGT	2	8	311754	311761	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008826	CTTG	2	8	311789	311796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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158	NC_008826	CAGC	2	8	329829	329836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
159	NC_008826	TGAA	2	8	332254	332261	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_008826	TCCT	2	8	348545	348552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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177	NC_008826	GCCG	2	8	400567	400574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
178	NC_008826	CGCC	2	8	408535	408542	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
179	NC_008826	GCAC	2	8	419668	419675	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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181	NC_008826	GGCC	2	8	428572	428579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
182	NC_008826	GGCC	2	8	430768	430775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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186	NC_008826	GCCG	2	8	432637	432644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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193	NC_008826	CTTC	2	8	473435	473442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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258	NC_008826	GCCG	2	8	599374	599381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.