MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylibium petroleiphilum PM1 chromosome

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008825	GCATGC	2	12	1591	1602	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008825	CACGAC	2	12	31349	31360	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008825	GAGACG	2	12	110729	110740	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008825	CGGCCC	2	12	116801	116812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_008825	CGAAGG	2	12	130510	130521	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008825	CGCGAG	2	12	233686	233697	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008825	TGCGGT	2	12	243007	243018	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008825	TGGAGT	2	12	322868	322879	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008825	TCCCGG	2	12	366445	366456	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008825	CAGCGG	2	12	398949	398960	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008825	TTTGCA	2	12	438792	438803	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008825	GCGAGG	2	12	448153	448164	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_008825	CCGGGG	2	12	559479	559490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008825	GACACG	2	12	596442	596453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008825	TGCCGC	2	12	669225	669236	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008825	CGGGCC	2	12	742496	742507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008825	CCCGGC	2	12	803746	803757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008825	CGGGCA	2	12	892901	892912	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008825	ACGCTG	2	12	911010	911021	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008825	CCGCGG	2	12	991533	991544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008825	CGCGGC	2	12	991912	991923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008825	ATCGCC	2	12	1011956	1011967	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008825	TGTCGA	2	12	1099628	1099639	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008825	GGTCGT	2	12	1121886	1121897	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008825	CGTTTT	2	12	1162860	1162871	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008825	GTCGGC	2	12	1177674	1177685	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008825	GGGTGG	2	12	1208537	1208548	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008825	CCCGGC	2	12	1226510	1226521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008825	GGGCGC	2	12	1234837	1234848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008825	GGAACA	2	12	1269468	1269479	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008825	CCCGGC	2	12	1409661	1409672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008825	GGGTTG	2	12	1463138	1463149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008825	CGCCGG	2	12	1472230	1472241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008825	CGGCCG	2	12	1475233	1475244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008825	TCCTTG	2	12	1476717	1476728	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008825	CAAGAA	2	12	1512905	1512916	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008825	GCCACC	2	12	1534921	1534932	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_008825	CGGCCT	2	12	1555963	1555974	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008825	GGCGGG	2	12	1572660	1572671	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008825	GGTAAC	2	12	1659305	1659316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008825	CGCGTA	2	12	1717613	1717624	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008825	GTCGTG	2	12	1719900	1719911	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008825	CGGCGT	2	12	1772342	1772353	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008825	GGAAGG	2	12	1785777	1785788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008825	CGTCAC	2	12	1817829	1817840	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008825	GTTGGC	2	12	1819344	1819355	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008825	CAGCGG	2	12	1824808	1824819	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008825	GCGGCT	2	12	1843983	1843994	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008825	GCCGCG	2	12	1867071	1867082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008825	GGGCGA	2	12	1981389	1981400	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008825	CTTTGT	2	12	2038935	2038946	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008825	GCGCAG	2	12	2091653	2091664	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008825	CCTCGA	2	12	2107733	2107744	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008825	GACGGC	2	12	2171172	2171183	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008825	CACGGC	2	12	2198588	2198599	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008825	TCGAAG	2	12	2200131	2200142	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008825	CGCTGG	2	12	2211590	2211601	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008825	GAAGCC	2	12	2227599	2227610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008825	GCAGGT	2	12	2227704	2227715	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_008825	TAGCAG	2	12	2249933	2249944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_008825	ACGGCG	2	12	2288424	2288435	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008825	AGGGCA	2	12	2302620	2302631	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_008825	GCCTGG	2	12	2335846	2335857	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008825	CGATGG	2	12	2360058	2360069	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_008825	GCGCCG	2	12	2373952	2373963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008825	GTTCTG	2	12	2384737	2384748	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008825	CGGTTG	2	12	2501253	2501264	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008825	GCCGAT	2	12	2508482	2508493	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008825	CGGTTT	2	12	2561714	2561725	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008825	TCGCTT	2	12	2575235	2575246	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008825	TGGGCC	2	12	2585391	2585402	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008825	GGCCGC	2	12	2626430	2626441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008825	GGTCGG	2	12	2687918	2687929	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008825	CCCACC	2	12	2704126	2704137	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
75	NC_008825	TGCCCG	2	12	2774659	2774670	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008825	CCCCGA	2	12	2781706	2781717	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_008825	GCGGCC	2	12	2805335	2805346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008825	TTCCGG	2	12	2810916	2810927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008825	GAGCGC	2	12	3142303	3142314	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008825	GCACGC	2	12	3334020	3334031	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008825	GTCACC	2	12	3340342	3340353	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008825	CGTCAC	2	12	3340390	3340401	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008825	GAACGC	2	12	3379781	3379792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008825	GCCGCG	2	12	3525957	3525968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008825	CAACTG	2	12	3561727	3561738	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008825	CCGGAC	2	12	3576741	3576752	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008825	GGCCCA	2	12	3673726	3673737	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008825	GCCAGG	2	12	3673837	3673848	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008825	ACATGA	2	12	3673885	3673896	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_008825	TGAGGC	2	12	3695941	3695952	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_008825	GCCTCA	2	12	3695991	3696002	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008825	CCGGGT	2	12	3740373	3740384	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008825	ACGCCC	2	12	3748591	3748602	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_008825	CCGCCC	2	12	3762390	3762401	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
95	NC_008825	GCCGGC	2	12	3903966	3903977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008825	ACCGCC	2	12	3925978	3925989	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008825	CCGCAC	2	12	3931615	3931626	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_008825	GTCGCG	2	12	3983483	3983494	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.