MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methylibium petroleiphilum PM1 chromosome

Total Repeats: 3036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008825	CAGCAC	2	12	4007722	4007733	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	124268974
3002	NC_008825	ACGCGC	2	12	4010328	4010339	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268975
3003	NC_008825	TCTCGA	2	12	4010518	4010529	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	124268975
3004	NC_008825	GATGCC	2	12	4010824	4010835	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268976
3005	NC_008825	CCGCTC	2	12	4011712	4011723	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	124268977
3006	NC_008825	GCGCTG	2	12	4011799	4011810	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268977
3007	NC_008825	GCCGAT	2	12	4012453	4012464	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268977
3008	NC_008825	CGAGCT	2	12	4012515	4012526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268977
3009	NC_008825	AAGCCG	2	12	4013042	4013053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124268977
3010	NC_008825	CGAGCG	3	18	4013148	4013165	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	124268977
3011	NC_008825	GAACAG	2	12	4017608	4017619	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	124268983
3012	NC_008825	CCAGCG	2	12	4017730	4017741	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268983
3013	NC_008825	GGGCCT	2	12	4019318	4019329	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268985
3014	NC_008825	GCATCG	2	12	4020169	4020180	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268985
3015	NC_008825	TGCCCG	2	12	4021025	4021036	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	124268986
3016	NC_008825	CAGGCC	2	12	4021081	4021092	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268986
3017	NC_008825	TCCGCC	2	12	4021422	4021433	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	124268986
3018	NC_008825	TGCGGA	2	12	4022227	4022238	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	124268987
3019	NC_008825	GCGCTG	2	12	4023976	4023987	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268988
3020	NC_008825	GCTTCG	2	12	4024478	4024489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124268989
3021	NC_008825	GCCCGG	2	12	4025918	4025929	0 %	0 %	50 %	50 %	124268991
3022	NC_008825	CGTCGA	2	12	4026906	4026917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268992
3023	NC_008825	TGCCCA	2	12	4027823	4027834	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	124268993
3024	NC_008825	CGCGGC	2	12	4027844	4027855	0 %	0 %	50 %	50 %	124268993
3025	NC_008825	GCGCCT	2	12	4027931	4027942	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	124268993
3026	NC_008825	CGCTGG	2	12	4028273	4028284	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268994
3027	NC_008825	CTCGAC	2	12	4029478	4029489	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	124268994
3028	NC_008825	TGCAGG	2	12	4029992	4030003	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	124268994
3029	NC_008825	CAGCAC	2	12	4034791	4034802	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	124269001
3030	NC_008825	CGTGCG	2	12	4035775	4035786	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124269003
3031	NC_008825	CGACTA	2	12	4038345	4038356	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	124269006
3032	NC_008825	CGGTAG	2	12	4039631	4039642	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	124269007
3033	NC_008825	GCCGCG	2	12	4040278	4040289	0 %	0 %	50 %	50 %	124269008
3034	NC_008825	TCGCGA	2	12	4041317	4041328	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124269008
3035	NC_008825	TCACGG	2	12	4042847	4042858	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124269009
3036	NC_008825	CGGCGC	2	12	4042995	4043006	0 %	0 %	50 %	50 %	124269009

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.