MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008818	GGACGG	2	12	68430	68441	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008818	GCCGGG	2	12	77601	77612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008818	CCTGGC	2	12	117390	117401	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008818	CAGCTA	2	12	128924	128935	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008818	GTGTTA	2	12	130243	130254	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008818	CTATTG	2	12	130788	130799	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008818	TTTAGA	2	12	148551	148562	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008818	TACCTT	2	12	159141	159152	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008818	GCTAAG	2	12	163707	163718	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008818	TACTCC	2	12	180925	180936	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008818	CACGGC	2	12	182565	182576	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008818	GCAGCC	2	12	185343	185354	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008818	AGCCCC	2	12	185446	185457	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_008818	TAGCTC	2	12	186067	186078	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008818	GTTGCT	2	12	205371	205382	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008818	TTGCTA	2	12	221246	221257	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008818	CAAGAG	2	12	252284	252295	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008818	TTAAGC	2	12	365924	365935	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008818	AGCAGT	2	12	374149	374160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008818	GTAGCT	2	12	381883	381894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_008818	AGGGGA	2	12	442389	442400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008818	AATGAG	2	12	457746	457757	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008818	GAAGAG	2	12	461356	461367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008818	TAGCTG	2	12	466392	466403	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008818	ATCTAA	2	12	469222	469233	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008818	GCGGTT	2	12	469982	469993	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008818	GATACT	2	12	471156	471167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008818	GAGCTG	2	12	484233	484244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008818	TATAAA	2	12	528892	528903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008818	TTAGGG	2	12	549593	549604	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008818	ATACCC	2	12	569551	569562	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008818	GGTTGA	2	12	570421	570432	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008818	GCTAGA	2	12	594969	594980	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008818	GCCGAG	2	12	598623	598634	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008818	CTGCAG	2	12	611406	611417	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008818	AAGACG	2	12	634206	634217	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008818	CCGAGA	2	12	667159	667170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008818	AGGTTG	2	12	676344	676355	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008818	GCTGGT	2	12	677145	677156	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008818	GCAATA	2	12	702629	702640	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008818	CCTCGC	2	12	740356	740367	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_008818	GTGCTA	2	12	799259	799270	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008818	AGAGCC	2	12	811192	811203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008818	TCACCG	2	12	817386	817397	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008818	AGCCAC	2	12	818285	818296	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008818	AGATGA	2	12	818500	818511	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008818	ACCCTT	2	12	834974	834985	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008818	CTGAAG	2	12	860523	860534	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008818	TTTTAG	2	12	865363	865374	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008818	GATGGC	2	12	872812	872823	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008818	CTCCTT	2	12	885849	885860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008818	TAAAAC	2	12	923764	923775	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008818	TGTACT	2	12	926812	926823	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008818	TGACGC	2	12	935919	935930	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008818	TACAGC	2	12	944974	944985	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008818	TGCCAT	2	12	1006196	1006207	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008818	GCCGAC	2	12	1072643	1072654	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008818	CCAGAT	2	12	1080851	1080862	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008818	CGGGGG	2	12	1099026	1099037	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_008818	AGCTGC	2	12	1142602	1142613	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008818	TCCGCC	2	12	1172255	1172266	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008818	CCGGAG	2	12	1173718	1173729	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008818	GGAGCT	2	12	1174324	1174335	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008818	ACCCTC	2	12	1175859	1175870	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_008818	GTAGGC	2	12	1176032	1176043	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008818	TTCCAT	2	12	1186118	1186129	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008818	GTTAGC	2	12	1215666	1215677	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008818	GCTGCA	2	12	1274553	1274564	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008818	TAAGCG	2	12	1277675	1277686	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008818	ATGCGT	2	12	1298937	1298948	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008818	CTCGCT	2	12	1310676	1310687	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008818	ATCCTA	2	12	1310727	1310738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008818	TGTGCT	2	12	1320306	1320317	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008818	TGGCGG	2	12	1334704	1334715	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_008818	GTGTGG	2	12	1343719	1343730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008818	GTTACC	2	12	1351131	1351142	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008818	ATACCT	2	12	1351805	1351816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008818	CTCGTC	2	12	1352730	1352741	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008818	AACCAC	2	12	1409637	1409648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008818	TGTAGC	2	12	1414172	1414183	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008818	ATTTGT	2	12	1448669	1448680	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008818	ACGAGG	2	12	1455936	1455947	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_008818	TAGCCC	2	12	1461607	1461618	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008818	GCCTAG	2	12	1475567	1475578	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008818	TACGGC	2	12	1476933	1476944	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008818	CTATAT	2	12	1489055	1489066	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_008818	GTGTAG	2	12	1489094	1489105	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008818	TTGAAA	2	12	1491157	1491168	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008818	TAATGA	2	12	1496921	1496932	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008818	ATATGT	2	12	1497002	1497013	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008818	TATGTT	2	12	1497673	1497684	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008818	TGTAAT	2	12	1513367	1513378	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008818	ATAAGA	2	12	1538976	1538987	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008818	CCAAGA	2	12	1543135	1543146	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008818	CCCCGC	2	12	1544264	1544275	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
96	NC_008818	GGAGAG	2	12	1555450	1555461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008818	AGCCAT	2	12	1577208	1577219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008818	GCACTA	2	12	1608286	1608297	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008818	GTGCAA	2	12	1608868	1608879	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_008818	GGAAGA	2	12	1608927	1608938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008818	GAAGGT	2	12	1618135	1618146	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008818	TATAGC	2	12	1657792	1657803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_008818	TTTCCC	2	12	1662154	1662165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008818	CTCGGC	2	12	1662430	1662441	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.