MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 793

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008818	AGACA	2	10	7318	7327	60 %	0 %	20 %	20 %	124026914
2	NC_008818	ATACT	2	10	11477	11486	40 %	40 %	0 %	20 %	124026918
3	NC_008818	GCCGG	2	10	12943	12952	0 %	0 %	60 %	40 %	124026919
4	NC_008818	TGAAG	2	10	14295	14304	40 %	20 %	40 %	0 %	124026921
5	NC_008818	TATAG	2	10	14692	14701	40 %	40 %	20 %	0 %	124026921
6	NC_008818	GCATA	2	10	16939	16948	40 %	20 %	20 %	20 %	124026925
7	NC_008818	TAGCC	2	10	18086	18095	20 %	20 %	20 %	40 %	124026926
8	NC_008818	CGTTC	2	10	18583	18592	0 %	40 %	20 %	40 %	124026926
9	NC_008818	ATAGG	2	10	29549	29558	40 %	20 %	40 %	0 %	124026939
10	NC_008818	GGGCA	2	10	30923	30932	20 %	0 %	60 %	20 %	124026940
11	NC_008818	TAACG	2	10	31911	31920	40 %	20 %	20 %	20 %	124026942
12	NC_008818	GCTGA	2	10	35279	35288	20 %	20 %	40 %	20 %	124026946
13	NC_008818	TATGC	2	10	36910	36919	20 %	40 %	20 %	20 %	124026949
14	NC_008818	AGCGT	2	10	39210	39219	20 %	20 %	40 %	20 %	124026951
15	NC_008818	TCGGT	2	10	40820	40829	0 %	40 %	40 %	20 %	124026953
16	NC_008818	CTTCT	2	10	41515	41524	0 %	60 %	0 %	40 %	124026953
17	NC_008818	AGGCT	2	10	44124	44133	20 %	20 %	40 %	20 %	124026957
18	NC_008818	CAAGC	2	10	44165	44174	40 %	0 %	20 %	40 %	124026957
19	NC_008818	TGGGA	2	10	45589	45598	20 %	20 %	60 %	0 %	124026958
20	NC_008818	AGCTA	2	10	46028	46037	40 %	20 %	20 %	20 %	124026958
21	NC_008818	TGCCG	2	10	50325	50334	0 %	20 %	40 %	40 %	124026963
22	NC_008818	GACAG	2	10	50922	50931	40 %	0 %	40 %	20 %	124026965
23	NC_008818	GCGAG	2	10	52077	52086	20 %	0 %	60 %	20 %	124026966
24	NC_008818	ACAAG	2	10	53389	53398	60 %	0 %	20 %	20 %	124026966
25	NC_008818	TCGTA	2	10	56691	56700	20 %	40 %	20 %	20 %	124026968
26	NC_008818	TGTAC	2	10	57804	57813	20 %	40 %	20 %	20 %	124026969
27	NC_008818	AGTGT	2	10	60553	60562	20 %	40 %	40 %	0 %	124026971
28	NC_008818	CCAGC	2	10	62127	62136	20 %	0 %	20 %	60 %	124026971
29	NC_008818	AGCAG	2	10	64331	64340	40 %	0 %	40 %	20 %	124026974
30	NC_008818	AGGGT	2	10	65587	65596	20 %	20 %	60 %	0 %	124026976
31	NC_008818	AAGTG	2	10	67588	67597	40 %	20 %	40 %	0 %	124026977
32	NC_008818	GTTGA	2	10	69815	69824	20 %	40 %	40 %	0 %	124026979
33	NC_008818	CGGTG	2	10	70614	70623	0 %	20 %	60 %	20 %	124026980
34	NC_008818	GCACG	2	10	72226	72235	20 %	0 %	40 %	40 %	124026981
35	NC_008818	CCTAG	2	10	79802	79811	20 %	20 %	20 %	40 %	124026988
36	NC_008818	CGTGA	2	10	83884	83893	20 %	20 %	40 %	20 %	124026993
37	NC_008818	GCTGA	2	10	84014	84023	20 %	20 %	40 %	20 %	124026994
38	NC_008818	AGAGG	2	10	88021	88030	40 %	0 %	60 %	0 %	124026997
39	NC_008818	ACTAC	2	10	93800	93809	40 %	20 %	0 %	40 %	124027004
40	NC_008818	ACAAG	2	10	96328	96337	60 %	0 %	20 %	20 %	124027007
41	NC_008818	CCTCT	2	10	96802	96811	0 %	40 %	0 %	60 %	124027007
42	NC_008818	GACAG	2	10	102121	102130	40 %	0 %	40 %	20 %	124027014
43	NC_008818	GGTAT	2	10	103670	103679	20 %	40 %	40 %	0 %	124027015
44	NC_008818	TCACC	2	10	105096	105105	20 %	20 %	0 %	60 %	124027017
45	NC_008818	TGCGC	2	10	105971	105980	0 %	20 %	40 %	40 %	124027018
46	NC_008818	TCGGC	2	10	108680	108689	0 %	20 %	40 %	40 %	124027022
47	NC_008818	GCTTG	2	10	110599	110608	0 %	40 %	40 %	20 %	124027026
48	NC_008818	CACAC	2	10	111262	111271	40 %	0 %	0 %	60 %	124027026
49	NC_008818	CCCAG	2	10	115548	115557	20 %	0 %	20 %	60 %	124027031
50	NC_008818	CTCCC	2	10	116040	116049	0 %	20 %	0 %	80 %	124027031
51	NC_008818	GCCGG	2	10	122448	122457	0 %	0 %	60 %	40 %	124027037
52	NC_008818	TACAC	2	10	123538	123547	40 %	20 %	0 %	40 %	124027038
53	NC_008818	ACGAC	2	10	124063	124072	40 %	0 %	20 %	40 %	124027039
54	NC_008818	CATGG	2	10	126829	126838	20 %	20 %	40 %	20 %	124027040
55	NC_008818	CTGGT	2	10	126855	126864	0 %	40 %	40 %	20 %	124027040
56	NC_008818	AAGAG	2	10	128693	128702	60 %	0 %	40 %	0 %	124027040
57	NC_008818	CCACA	2	10	132215	132224	40 %	0 %	0 %	60 %	124027042
58	NC_008818	CTTGC	2	10	132909	132918	0 %	40 %	20 %	40 %	124027043
59	NC_008818	GGTAA	2	10	133962	133971	40 %	20 %	40 %	0 %	124027045
60	NC_008818	GCCAA	2	10	135753	135762	40 %	0 %	20 %	40 %	124027048
61	NC_008818	TGTCG	2	10	140128	140137	0 %	40 %	40 %	20 %	124027051
62	NC_008818	ACAGC	2	10	140469	140478	40 %	0 %	20 %	40 %	124027051
63	NC_008818	CCCGA	2	10	140555	140564	20 %	0 %	20 %	60 %	124027051
64	NC_008818	GGCTC	2	10	142026	142035	0 %	20 %	40 %	40 %	124027054
65	NC_008818	CTATG	2	10	142517	142526	20 %	40 %	20 %	20 %	124027054
66	NC_008818	CTACG	2	10	145767	145776	20 %	20 %	20 %	40 %	124027057
67	NC_008818	ATACT	2	10	147475	147484	40 %	40 %	0 %	20 %	124027059
68	NC_008818	CAGCT	2	10	147921	147930	20 %	20 %	20 %	40 %	124027059
69	NC_008818	TCCTT	2	10	148480	148489	0 %	60 %	0 %	40 %	124027059
70	NC_008818	ACGTC	2	10	149373	149382	20 %	20 %	20 %	40 %	124027061
71	NC_008818	GCTCT	2	10	150274	150283	0 %	40 %	20 %	40 %	124027063
72	NC_008818	GCTAG	2	10	153131	153140	20 %	20 %	40 %	20 %	124027065
73	NC_008818	TTCCA	2	10	154299	154308	20 %	40 %	0 %	40 %	124027067
74	NC_008818	CTGCG	2	10	155563	155572	0 %	20 %	40 %	40 %	124027068
75	NC_008818	AAACG	2	10	155631	155640	60 %	0 %	20 %	20 %	124027068
76	NC_008818	AGGCT	2	10	155672	155681	20 %	20 %	40 %	20 %	124027068
77	NC_008818	CAGCC	2	10	156802	156811	20 %	0 %	20 %	60 %	124027069
78	NC_008818	ATCCT	2	10	158151	158160	20 %	40 %	0 %	40 %	124027072
79	NC_008818	GCTAC	2	10	158441	158450	20 %	20 %	20 %	40 %	124027072
80	NC_008818	CGAGC	2	10	161603	161612	20 %	0 %	40 %	40 %	124027076
81	NC_008818	CTTCT	2	10	165380	165389	0 %	60 %	0 %	40 %	124027081
82	NC_008818	GCTCG	2	10	168901	168910	0 %	20 %	40 %	40 %	124027085
83	NC_008818	ACAGC	2	10	169129	169138	40 %	0 %	20 %	40 %	124027085
84	NC_008818	CGAGG	2	10	169744	169753	20 %	0 %	60 %	20 %	124027086
85	NC_008818	GGCAA	2	10	170810	170819	40 %	0 %	40 %	20 %	124027087
86	NC_008818	GCGGG	2	10	171142	171151	0 %	0 %	80 %	20 %	124027087
87	NC_008818	GTGGC	2	10	171383	171392	0 %	20 %	60 %	20 %	124027088
88	NC_008818	CGGCG	2	10	173528	173537	0 %	0 %	60 %	40 %	124027089
89	NC_008818	TGGCG	2	10	176187	176196	0 %	20 %	60 %	20 %	124027091
90	NC_008818	TGCCT	2	10	176532	176541	0 %	40 %	20 %	40 %	124027091
91	NC_008818	CATAC	2	10	176831	176840	40 %	20 %	0 %	40 %	124027091
92	NC_008818	GGTAT	2	10	180112	180121	20 %	40 %	40 %	0 %	124027096
93	NC_008818	GATAG	2	10	180336	180345	40 %	20 %	40 %	0 %	124027096
94	NC_008818	CTCGC	2	10	181369	181378	0 %	20 %	20 %	60 %	124027097
95	NC_008818	CAGCC	2	10	182207	182216	20 %	0 %	20 %	60 %	124027098
96	NC_008818	AGGCT	2	10	186473	186482	20 %	20 %	40 %	20 %	124027102
97	NC_008818	CCCCG	2	10	189441	189450	0 %	0 %	20 %	80 %	124027104
98	NC_008818	AGTAT	2	10	189601	189610	40 %	40 %	20 %	0 %	124027104
99	NC_008818	CGGTA	2	10	190945	190954	20 %	20 %	40 %	20 %	124027106
100	NC_008818	CGCGG	2	10	192535	192544	0 %	0 %	60 %	40 %	124027107
101	NC_008818	GGTAT	2	10	193637	193646	20 %	40 %	40 %	0 %	124027108
102	NC_008818	CGGGC	2	10	195628	195637	0 %	0 %	60 %	40 %	124027110
103	NC_008818	GCTTA	2	10	196058	196067	20 %	40 %	20 %	20 %	124027110
104	NC_008818	GTATC	2	10	197727	197736	20 %	40 %	20 %	20 %	124027112
105	NC_008818	TGCCC	2	10	198909	198918	0 %	20 %	20 %	60 %	124027113
106	NC_008818	CAGGC	2	10	201979	201988	20 %	0 %	40 %	40 %	124027115
107	NC_008818	AGCGT	2	10	202947	202956	20 %	20 %	40 %	20 %	124027115
108	NC_008818	GCCCC	2	10	204331	204340	0 %	0 %	20 %	80 %	124027115
109	NC_008818	GTCAT	2	10	205768	205777	20 %	40 %	20 %	20 %	124027116
110	NC_008818	CGGGC	2	10	206112	206121	0 %	0 %	60 %	40 %	124027117
111	NC_008818	GCCAC	2	10	206712	206721	20 %	0 %	20 %	60 %	124027117
112	NC_008818	CAAGG	2	10	210320	210329	40 %	0 %	40 %	20 %	124027120
113	NC_008818	CCGTG	2	10	210810	210819	0 %	20 %	40 %	40 %	124027121
114	NC_008818	GTATG	2	10	214144	214153	20 %	40 %	40 %	0 %	124027123
115	NC_008818	ATCTC	2	10	214680	214689	20 %	40 %	0 %	40 %	124027124
116	NC_008818	CTCTC	2	10	215151	215160	0 %	40 %	0 %	60 %	124027124
117	NC_008818	AGGGT	2	10	216666	216675	20 %	20 %	60 %	0 %	124027126
118	NC_008818	CTAAG	2	10	216723	216732	40 %	20 %	20 %	20 %	124027126
119	NC_008818	CGCTA	2	10	219249	219258	20 %	20 %	20 %	40 %	124027128
120	NC_008818	GCGCA	2	10	226849	226858	20 %	0 %	40 %	40 %	124027136
121	NC_008818	TCCTC	2	10	229344	229353	0 %	40 %	0 %	60 %	124027140
122	NC_008818	TATGT	2	10	229418	229427	20 %	60 %	20 %	0 %	124027140
123	NC_008818	CGGCT	2	10	229735	229744	0 %	20 %	40 %	40 %	124027140
124	NC_008818	TCCTC	2	10	230064	230073	0 %	40 %	0 %	60 %	124027140
125	NC_008818	GCCAG	2	10	230609	230618	20 %	0 %	40 %	40 %	124027140
126	NC_008818	AACCC	2	10	233995	234004	40 %	0 %	0 %	60 %	124027143
127	NC_008818	TAGGC	2	10	234481	234490	20 %	20 %	40 %	20 %	124027143
128	NC_008818	TGTCT	2	10	239152	239161	0 %	60 %	20 %	20 %	124027149
129	NC_008818	CTATG	2	10	243478	243487	20 %	40 %	20 %	20 %	124027152
130	NC_008818	AGCCT	2	10	245575	245584	20 %	20 %	20 %	40 %	124027154
131	NC_008818	GCCTG	2	10	245666	245675	0 %	20 %	40 %	40 %	124027154
132	NC_008818	CTTCT	2	10	246450	246459	0 %	60 %	0 %	40 %	124027155
133	NC_008818	GGGCT	2	10	248545	248554	0 %	20 %	60 %	20 %	124027158
134	NC_008818	TCTCG	2	10	249914	249923	0 %	40 %	20 %	40 %	124027160
135	NC_008818	ATCGA	2	10	250082	250091	40 %	20 %	20 %	20 %	124027160
136	NC_008818	AGAGG	2	10	250679	250688	40 %	0 %	60 %	0 %	124027161
137	NC_008818	GGCTG	2	10	253046	253055	0 %	20 %	60 %	20 %	124027163
138	NC_008818	GGATA	2	10	254324	254333	40 %	20 %	40 %	0 %	124027165
139	NC_008818	GTAGC	2	10	254610	254619	20 %	20 %	40 %	20 %	124027165
140	NC_008818	CGTGG	2	10	256035	256044	0 %	20 %	60 %	20 %	124027166
141	NC_008818	GGGCC	2	10	259172	259181	0 %	0 %	60 %	40 %	124027170
142	NC_008818	AACAG	2	10	261777	261786	60 %	0 %	20 %	20 %	124027172
143	NC_008818	CCATA	2	10	263855	263864	40 %	20 %	0 %	40 %	124027175
144	NC_008818	CCCTC	2	10	265144	265153	0 %	20 %	0 %	80 %	124027176
145	NC_008818	TGCCG	2	10	267433	267442	0 %	20 %	40 %	40 %	124027179
146	NC_008818	TAGCC	2	10	268009	268018	20 %	20 %	20 %	40 %	124027179
147	NC_008818	TGGCT	2	10	270123	270132	0 %	40 %	40 %	20 %	124027181
148	NC_008818	GTAGT	2	10	273088	273097	20 %	40 %	40 %	0 %	124027184
149	NC_008818	AGCAC	2	10	273540	273549	40 %	0 %	20 %	40 %	124027185
150	NC_008818	GGCAG	2	10	274538	274547	20 %	0 %	60 %	20 %	124027186
151	NC_008818	TGCGC	2	10	275076	275085	0 %	20 %	40 %	40 %	124027186
152	NC_008818	GCTAG	2	10	277801	277810	20 %	20 %	40 %	20 %	124027189
153	NC_008818	CGGAG	2	10	278208	278217	20 %	0 %	60 %	20 %	124027190
154	NC_008818	TAGGT	2	10	284350	284359	20 %	40 %	40 %	0 %	124027197
155	NC_008818	GCCCG	2	10	290824	290833	0 %	0 %	40 %	60 %	124027200
156	NC_008818	ATAGC	2	10	290957	290966	40 %	20 %	20 %	20 %	124027200
157	NC_008818	TCATG	2	10	292025	292034	20 %	40 %	20 %	20 %	124027201
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159	NC_008818	TACGC	2	10	294926	294935	20 %	20 %	20 %	40 %	124027203
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161	NC_008818	CCAGC	2	10	297159	297168	20 %	0 %	20 %	60 %	124027204
162	NC_008818	TCAAG	2	10	298790	298799	40 %	20 %	20 %	20 %	124027205
163	NC_008818	GCTGG	2	10	299447	299456	0 %	20 %	60 %	20 %	124027205
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165	NC_008818	GTAGC	2	10	300946	300955	20 %	20 %	40 %	20 %	124027207
166	NC_008818	CAGCC	2	10	304012	304021	20 %	0 %	20 %	60 %	124027209
167	NC_008818	CAGGG	2	10	305847	305856	20 %	0 %	60 %	20 %	124027211
168	NC_008818	CTGTG	2	10	310748	310757	0 %	40 %	40 %	20 %	124027217
169	NC_008818	GCCGT	2	10	314700	314709	0 %	20 %	40 %	40 %	124027221
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171	NC_008818	TCTGC	2	10	318895	318904	0 %	40 %	20 %	40 %	124027224
172	NC_008818	TCCTG	2	10	322652	322661	0 %	40 %	20 %	40 %	124027227
173	NC_008818	AGAGG	2	10	329881	329890	40 %	0 %	60 %	0 %	124027237
174	NC_008818	AGCTG	2	10	331658	331667	20 %	20 %	40 %	20 %	124027240
175	NC_008818	CGATA	2	10	333317	333326	40 %	20 %	20 %	20 %	124027243
176	NC_008818	AGCCC	2	10	338272	338281	20 %	0 %	20 %	60 %	124027246
177	NC_008818	TATGC	2	10	341032	341041	20 %	40 %	20 %	20 %	124027248
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179	NC_008818	TACAG	2	10	342084	342093	40 %	20 %	20 %	20 %	124027249
180	NC_008818	CCATG	2	10	344815	344824	20 %	20 %	20 %	40 %	124027251
181	NC_008818	CATGT	2	10	345889	345898	20 %	40 %	20 %	20 %	124027252
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193	NC_008818	GCTCT	2	10	361280	361289	0 %	40 %	20 %	40 %	124027267
194	NC_008818	CCTAG	2	10	362359	362368	20 %	20 %	20 %	40 %	124027267
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198	NC_008818	TGTGC	2	10	374913	374922	0 %	40 %	40 %	20 %	124027279
199	NC_008818	AACTA	2	10	378276	378285	60 %	20 %	0 %	20 %	124027283
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201	NC_008818	GCTAG	2	10	384512	384521	20 %	20 %	40 %	20 %	124027290
202	NC_008818	CATCG	2	10	384834	384843	20 %	20 %	20 %	40 %	124027291
203	NC_008818	CGAGG	2	10	385138	385147	20 %	0 %	60 %	20 %	124027291
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234	NC_008818	ACGTA	2	10	446467	446476	40 %	20 %	20 %	20 %	124027353
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236	NC_008818	GCCGG	2	10	451931	451940	0 %	0 %	60 %	40 %	124027360
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239	NC_008818	GCCAG	2	10	455388	455397	20 %	0 %	40 %	40 %	124027364
240	NC_008818	GGTAC	2	10	456659	456668	20 %	20 %	40 %	20 %	124027366
241	NC_008818	TACAA	2	10	457530	457539	60 %	20 %	0 %	20 %	124027367
242	NC_008818	TCCTC	2	10	458387	458396	0 %	40 %	0 %	60 %	124027368
243	NC_008818	AACCG	2	10	461113	461122	40 %	0 %	20 %	40 %	124027371
244	NC_008818	TAGCC	2	10	470529	470538	20 %	20 %	20 %	40 %	124027378
245	NC_008818	AGCAG	2	10	474781	474790	40 %	0 %	40 %	20 %	124027381
246	NC_008818	CTACT	2	10	483522	483531	20 %	40 %	0 %	40 %	124027389
247	NC_008818	CACGC	2	10	485819	485828	20 %	0 %	20 %	60 %	124027391
248	NC_008818	GGCGT	2	10	487231	487240	0 %	20 %	60 %	20 %	124027391
249	NC_008818	TGGTT	2	10	489734	489743	0 %	60 %	40 %	0 %	124027394
250	NC_008818	AGGAG	2	10	494585	494594	40 %	0 %	60 %	0 %	124027398
251	NC_008818	CTTCC	2	10	497340	497349	0 %	40 %	0 %	60 %	124027401
252	NC_008818	GGCTG	2	10	501766	501775	0 %	20 %	60 %	20 %	124027405
253	NC_008818	AGAGG	2	10	501792	501801	40 %	0 %	60 %	0 %	124027405
254	NC_008818	GAGCA	2	10	502512	502521	40 %	0 %	40 %	20 %	124027405
255	NC_008818	AACAG	2	10	503295	503304	60 %	0 %	20 %	20 %	124027406
256	NC_008818	ACTAG	2	10	505560	505569	40 %	20 %	20 %	20 %	124027408
257	NC_008818	GCAGC	2	10	505795	505804	20 %	0 %	40 %	40 %	124027408
258	NC_008818	CGGAG	2	10	508103	508112	20 %	0 %	60 %	20 %	124027410
259	NC_008818	AAGCC	2	10	512385	512394	40 %	0 %	20 %	40 %	124027414
260	NC_008818	AGCTG	2	10	513044	513053	20 %	20 %	40 %	20 %	124027415
261	NC_008818	CGGTT	2	10	514437	514446	0 %	40 %	40 %	20 %	124027417
262	NC_008818	GGCAG	2	10	521272	521281	20 %	0 %	60 %	20 %	124027427
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381	NC_008818	GCGTA	2	10	787953	787962	20 %	20 %	40 %	20 %	124027671
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384	NC_008818	ACGGT	2	10	790947	790956	20 %	20 %	40 %	20 %	124027674
385	NC_008818	AAGCC	2	10	791511	791520	40 %	0 %	20 %	40 %	124027674
386	NC_008818	CGAGA	2	10	792454	792463	40 %	0 %	40 %	20 %	124027675
387	NC_008818	GGATT	2	10	794201	794210	20 %	40 %	40 %	0 %	124027677
388	NC_008818	GCTGG	2	10	794321	794330	0 %	20 %	60 %	20 %	124027677
389	NC_008818	CCGGC	2	10	795415	795424	0 %	0 %	40 %	60 %	124027678
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