MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 3139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008818	GCCC	2	8	710	717	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_008818	ATGG	2	8	1108	1115	25 %	25 %	50 %	0 %	124026907
3	NC_008818	GTCC	2	8	1858	1865	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008818	CACC	2	8	1868	1875	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_008818	CCGG	2	8	2384	2391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008818	CCCA	2	8	2451	2458	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_008818	CAGA	2	8	2638	2645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008818	GGGT	2	8	3139	3146	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008818	AGGC	2	8	4209	4216	25 %	0 %	50 %	25 %	124026909
10	NC_008818	CAGC	2	8	4600	4607	25 %	0 %	25 %	50 %	124026910
11	NC_008818	TAGC	2	8	5037	5044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008818	ATGT	2	8	5361	5368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008818	ATGG	2	8	5561	5568	25 %	25 %	50 %	0 %	124026912
14	NC_008818	TAGA	2	8	7201	7208	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008818	TGAC	2	8	7242	7249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008818	GTGC	2	8	7381	7388	0 %	25 %	50 %	25 %	124026914
17	NC_008818	AACA	2	8	7708	7715	75 %	0 %	0 %	25 %	124026914
18	NC_008818	TTGG	2	8	7892	7899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008818	GCCC	2	8	7950	7957	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_008818	AGGT	2	8	8150	8157	25 %	25 %	50 %	0 %	124026915
21	NC_008818	GTAC	2	8	8287	8294	25 %	25 %	25 %	25 %	124026915
22	NC_008818	GGCT	2	8	9193	9200	0 %	25 %	50 %	25 %	124026916
23	NC_008818	GAGC	2	8	10821	10828	25 %	0 %	50 %	25 %	124026918
24	NC_008818	TGTA	2	8	15275	15282	25 %	50 %	25 %	0 %	124026922
25	NC_008818	ATGT	2	8	16227	16234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008818	CTCG	2	8	16242	16249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008818	ATGT	2	8	17071	17078	25 %	50 %	25 %	0 %	124026925
28	NC_008818	CTAC	2	8	17603	17610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008818	GTTT	2	8	17687	17694	0 %	75 %	25 %	0 %	124026926
30	NC_008818	TGCG	2	8	18453	18460	0 %	25 %	50 %	25 %	124026926
31	NC_008818	TGGT	2	8	18681	18688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008818	CTTG	2	8	19674	19681	0 %	50 %	25 %	25 %	124026928
33	NC_008818	TGGT	2	8	19997	20004	0 %	50 %	50 %	0 %	124026928
34	NC_008818	CCTT	2	8	20012	20019	0 %	50 %	0 %	50 %	124026928
35	NC_008818	GTAT	2	8	20179	20186	25 %	50 %	25 %	0 %	124026929
36	NC_008818	AGCC	2	8	20763	20770	25 %	0 %	25 %	50 %	124026930
37	NC_008818	CCAA	2	8	21592	21599	50 %	0 %	0 %	50 %	124026931
38	NC_008818	CTTG	2	8	22335	22342	0 %	50 %	25 %	25 %	124026932
39	NC_008818	GCAG	2	8	23311	23318	25 %	0 %	50 %	25 %	124026933
40	NC_008818	AGGA	2	8	23620	23627	50 %	0 %	50 %	0 %	124026933
41	NC_008818	GGCT	2	8	24556	24563	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008818	AAAT	2	8	24998	25005	75 %	25 %	0 %	0 %	124026935
43	NC_008818	CAGG	2	8	25395	25402	25 %	0 %	50 %	25 %	124026936
44	NC_008818	GCTG	2	8	26157	26164	0 %	25 %	50 %	25 %	124026937
45	NC_008818	AGGC	2	8	26315	26322	25 %	0 %	50 %	25 %	124026937
46	NC_008818	CGAT	2	8	26404	26411	25 %	25 %	25 %	25 %	124026937
47	NC_008818	GAGG	2	8	26595	26602	25 %	0 %	75 %	0 %	124026937
48	NC_008818	CATC	2	8	27471	27478	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008818	CCCA	2	8	30522	30529	25 %	0 %	0 %	75 %	124026940
50	NC_008818	GCTC	2	8	30648	30655	0 %	25 %	25 %	50 %	124026940
51	NC_008818	CCTT	2	8	31060	31067	0 %	50 %	0 %	50 %	124026941
52	NC_008818	CACC	2	8	31806	31813	25 %	0 %	0 %	75 %	124026942
53	NC_008818	TAGG	2	8	31996	32003	25 %	25 %	50 %	0 %	124026942
54	NC_008818	TCTA	2	8	32752	32759	25 %	50 %	0 %	25 %	124026943
55	NC_008818	TGGA	2	8	33192	33199	25 %	25 %	50 %	0 %	124026943
56	NC_008818	AAGC	2	8	33337	33344	50 %	0 %	25 %	25 %	124026943
57	NC_008818	TCCT	2	8	33877	33884	0 %	50 %	0 %	50 %	124026944
58	NC_008818	CTTC	2	8	34165	34172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008818	GCGT	2	8	34854	34861	0 %	25 %	50 %	25 %	124026945
60	NC_008818	CTGC	2	8	35327	35334	0 %	25 %	25 %	50 %	124026946
61	NC_008818	ATCT	2	8	36103	36110	25 %	50 %	0 %	25 %	124026948
62	NC_008818	CGGC	2	8	36544	36551	0 %	0 %	50 %	50 %	124026949
63	NC_008818	GTTG	2	8	36975	36982	0 %	50 %	50 %	0 %	124026949
64	NC_008818	AGGT	2	8	37006	37013	25 %	25 %	50 %	0 %	124026949
65	NC_008818	GGAG	2	8	37817	37824	25 %	0 %	75 %	0 %	124026950
66	NC_008818	AGAC	2	8	38543	38550	50 %	0 %	25 %	25 %	124026950
67	NC_008818	GGCA	2	8	38644	38651	25 %	0 %	50 %	25 %	124026950
68	NC_008818	ATGT	2	8	39233	39240	25 %	50 %	25 %	0 %	124026951
69	NC_008818	CTGA	2	8	39468	39475	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008818	ATCT	2	8	39912	39919	25 %	50 %	0 %	25 %	124026952
71	NC_008818	GCCA	2	8	41000	41007	25 %	0 %	25 %	50 %	124026953
72	NC_008818	AGTG	2	8	42607	42614	25 %	25 %	50 %	0 %	124026954
73	NC_008818	GGTA	2	8	43185	43192	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008818	TGGG	2	8	43807	43814	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008818	AGGA	2	8	44426	44433	50 %	0 %	50 %	0 %	124026957
76	NC_008818	GGCA	2	8	44599	44606	25 %	0 %	50 %	25 %	124026957
77	NC_008818	AGGC	2	8	44887	44894	25 %	0 %	50 %	25 %	124026958
78	NC_008818	AGCT	2	8	45710	45717	25 %	25 %	25 %	25 %	124026958
79	NC_008818	CCCA	2	8	45888	45895	25 %	0 %	0 %	75 %	124026958
80	NC_008818	TGCC	2	8	46064	46071	0 %	25 %	25 %	50 %	124026958
81	NC_008818	ATGC	2	8	46729	46736	25 %	25 %	25 %	25 %	124026959
82	NC_008818	ATAG	2	8	47162	47169	50 %	25 %	25 %	0 %	124026960
83	NC_008818	ACAT	2	8	47213	47220	50 %	25 %	0 %	25 %	124026960
84	NC_008818	CAGC	2	8	47318	47325	25 %	0 %	25 %	50 %	124026960
85	NC_008818	CTTC	2	8	47379	47386	0 %	50 %	0 %	50 %	124026960
86	NC_008818	CCAT	2	8	47492	47499	25 %	25 %	0 %	50 %	124026960
87	NC_008818	AGCT	2	8	49206	49213	25 %	25 %	25 %	25 %	124026962
88	NC_008818	GTTG	2	8	49378	49385	0 %	50 %	50 %	0 %	124026962
89	NC_008818	ATCC	2	8	49403	49410	25 %	25 %	0 %	50 %	124026962
90	NC_008818	TCCT	2	8	50609	50616	0 %	50 %	0 %	50 %	124026964
91	NC_008818	ATGG	2	8	51351	51358	25 %	25 %	50 %	0 %	124026965
92	NC_008818	CGTG	2	8	51807	51814	0 %	25 %	50 %	25 %	124026966
93	NC_008818	TGTA	2	8	52087	52094	25 %	50 %	25 %	0 %	124026966
94	NC_008818	CACT	2	8	52348	52355	25 %	25 %	0 %	50 %	124026966
95	NC_008818	AGGG	2	8	53403	53410	25 %	0 %	75 %	0 %	124026966
96	NC_008818	GTGC	2	8	54156	54163	0 %	25 %	50 %	25 %	124026967
97	NC_008818	CCCT	2	8	54381	54388	0 %	25 %	0 %	75 %	124026967
98	NC_008818	CTAG	2	8	54573	54580	25 %	25 %	25 %	25 %	124026967
99	NC_008818	CTAT	2	8	54675	54682	25 %	50 %	0 %	25 %	124026967
100	NC_008818	ATGG	2	8	55323	55330	25 %	25 %	50 %	0 %	124026968
101	NC_008818	GCTA	2	8	56439	56446	25 %	25 %	25 %	25 %	124026968
102	NC_008818	TTTA	2	8	57061	57068	25 %	75 %	0 %	0 %	124026969
103	NC_008818	TGCT	2	8	57220	57227	0 %	50 %	25 %	25 %	124026969
104	NC_008818	AGCT	2	8	57918	57925	25 %	25 %	25 %	25 %	124026969
105	NC_008818	CGAG	2	8	58911	58918	25 %	0 %	50 %	25 %	124026970
106	NC_008818	CAAG	2	8	59973	59980	50 %	0 %	25 %	25 %	124026970
107	NC_008818	CTAG	2	8	60282	60289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008818	TCAC	2	8	61141	61148	25 %	25 %	0 %	50 %	124026971
109	NC_008818	GCTG	2	8	61255	61262	0 %	25 %	50 %	25 %	124026971
110	NC_008818	TGCA	2	8	61525	61532	25 %	25 %	25 %	25 %	124026971
111	NC_008818	CAGC	2	8	62175	62182	25 %	0 %	25 %	50 %	124026971
112	NC_008818	CAGC	2	8	62262	62269	25 %	0 %	25 %	50 %	124026971
113	NC_008818	TTGT	2	8	62607	62614	0 %	75 %	25 %	0 %	124026972
114	NC_008818	CATC	2	8	64323	64330	25 %	25 %	0 %	50 %	124026974
115	NC_008818	AAGG	2	8	64896	64903	50 %	0 %	50 %	0 %	124026975
116	NC_008818	TCCC	2	8	65397	65404	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_008818	AAAC	2	8	66241	66248	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008818	GCCC	2	8	66802	66809	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_008818	CTGG	2	8	67999	68006	0 %	25 %	50 %	25 %	124026978
120	NC_008818	AGGA	2	8	68675	68682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008818	ACAA	2	8	68969	68976	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008818	GCTT	2	8	69145	69152	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008818	GGGC	2	8	69530	69537	0 %	0 %	75 %	25 %	124026979
124	NC_008818	TCCG	2	8	69791	69798	0 %	25 %	25 %	50 %	124026979
125	NC_008818	GGCC	2	8	69997	70004	0 %	0 %	50 %	50 %	124026979
126	NC_008818	CGAG	2	8	71276	71283	25 %	0 %	50 %	25 %	124026980
127	NC_008818	GCGG	2	8	71640	71647	0 %	0 %	75 %	25 %	124026980
128	NC_008818	ATAA	2	8	72495	72502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008818	GACC	2	8	73087	73094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008818	GGGC	2	8	73209	73216	0 %	0 %	75 %	25 %	124026983
131	NC_008818	ACGT	2	8	73523	73530	25 %	25 %	25 %	25 %	124026983
132	NC_008818	GCCC	2	8	74151	74158	0 %	0 %	25 %	75 %	124026983
133	NC_008818	GGCC	2	8	75437	75444	0 %	0 %	50 %	50 %	124026984
134	NC_008818	GACC	2	8	76077	76084	25 %	0 %	25 %	50 %	124026984
135	NC_008818	CTAG	2	8	77101	77108	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008818	TAGC	2	8	77456	77463	25 %	25 %	25 %	25 %	124026986
137	NC_008818	CTGG	2	8	77938	77945	0 %	25 %	50 %	25 %	124026987
138	NC_008818	CGCT	2	8	79088	79095	0 %	25 %	25 %	50 %	124026988
139	NC_008818	GTCT	2	8	80458	80465	0 %	50 %	25 %	25 %	124026990
140	NC_008818	AGGG	2	8	80860	80867	25 %	0 %	75 %	0 %	124026990
141	NC_008818	TACG	2	8	81585	81592	25 %	25 %	25 %	25 %	124026990
142	NC_008818	GCCA	2	8	82020	82027	25 %	0 %	25 %	50 %	124026990
143	NC_008818	CAGC	2	8	82368	82375	25 %	0 %	25 %	50 %	124026991
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