MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 745

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008818	GCCC	2	8	710	717	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_008818	GTCC	2	8	1858	1865	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008818	CACC	2	8	1868	1875	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_008818	CCGG	2	8	2384	2391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008818	CCCA	2	8	2451	2458	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_008818	CAGA	2	8	2638	2645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008818	GGGT	2	8	3139	3146	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008818	TAGC	2	8	5037	5044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008818	ATGT	2	8	5361	5368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008818	TAGA	2	8	7201	7208	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008818	TGAC	2	8	7242	7249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008818	TTGG	2	8	7892	7899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008818	GCCC	2	8	7950	7957	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008818	ATGT	2	8	16227	16234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008818	CTCG	2	8	16242	16249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008818	CTAC	2	8	17603	17610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008818	TGGT	2	8	18681	18688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008818	GGCT	2	8	24556	24563	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008818	CATC	2	8	27471	27478	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008818	CTTC	2	8	34165	34172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008818	CTGA	2	8	39468	39475	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008818	GGTA	2	8	43185	43192	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008818	TGGG	2	8	43807	43814	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008818	CTAG	2	8	60282	60289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008818	TCCC	2	8	65397	65404	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_008818	AAAC	2	8	66241	66248	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008818	GCCC	2	8	66802	66809	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_008818	AGGA	2	8	68675	68682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008818	ACAA	2	8	68969	68976	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008818	GCTT	2	8	69145	69152	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008818	ATAA	2	8	72495	72502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008818	GACC	2	8	73087	73094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008818	CTAG	2	8	77101	77108	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008818	CAAA	2	8	90144	90151	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008818	AGAA	2	8	90392	90399	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008818	ACAT	2	8	90581	90588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008818	ATAG	2	8	103914	103921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008818	TTCT	2	8	104516	104523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008818	TAGA	2	8	110397	110404	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008818	ATGC	2	8	110580	110587	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008818	CCCT	2	8	113167	113174	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_008818	GGAG	2	8	115442	115449	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008818	CAGC	2	8	117289	117296	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008818	ACCA	2	8	117981	117988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008818	TGAC	2	8	118678	118685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008818	ACCA	2	8	118691	118698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008818	ATAG	2	8	118731	118738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008818	TGGG	2	8	119383	119390	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008818	TGGC	2	8	120833	120840	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008818	CCAT	2	8	123184	123191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008818	CCTA	2	8	123286	123293	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008818	TCCT	2	8	129043	129050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008818	GGCA	2	8	129519	129526	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008818	ATGT	2	8	129735	129742	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008818	GCTT	2	8	129932	129939	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008818	TCCC	2	8	130720	130727	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_008818	TTCT	2	8	130763	130770	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008818	TCCT	2	8	132788	132795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008818	CTGT	2	8	133685	133692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008818	TGGA	2	8	133947	133954	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008818	TGCT	2	8	134600	134607	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008818	GTAG	2	8	134715	134722	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008818	TGGC	2	8	134732	134739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008818	TTAG	2	8	137208	137215	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008818	TAGA	2	8	139139	139146	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008818	TTTG	2	8	139184	139191	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008818	CAAG	2	8	144651	144658	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008818	CAGC	2	8	144877	144884	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008818	AGGG	2	8	152985	152992	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008818	ACAT	2	8	158724	158731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008818	GTGA	2	8	158954	158961	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008818	TATG	2	8	161003	161010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008818	CGAG	2	8	162116	162123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008818	GAGG	2	8	163235	163242	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008818	CAAT	2	8	164875	164882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008818	GGTT	2	8	165972	165979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008818	GGGC	2	8	166034	166041	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008818	GGAA	2	8	180897	180904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008818	GGGC	2	8	181793	181800	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008818	CTAG	2	8	182659	182666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008818	ACCC	2	8	183719	183726	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_008818	GCAG	2	8	185009	185016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008818	CGGG	2	8	185023	185030	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008818	AGCT	2	8	185036	185043	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008818	GGCG	2	8	185155	185162	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008818	GCAG	2	8	185357	185364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008818	ATGC	2	8	185387	185394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008818	TTTA	2	8	191258	191265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008818	GTTG	2	8	200082	200089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008818	ACAT	2	8	204896	204903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008818	TGGT	2	8	205098	205105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008818	GAGC	2	8	205227	205234	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008818	AGCA	2	8	209305	209312	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008818	CATG	2	8	209461	209468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008818	GAGG	2	8	209570	209577	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008818	TATG	2	8	209613	209620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008818	GGCT	2	8	216575	216582	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008818	TCCA	2	8	216607	216614	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008818	CAAC	2	8	220631	220638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008818	GCGT	2	8	221290	221297	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008818	GTTT	2	8	221449	221456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008818	ATGC	2	8	224914	224921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008818	CTGA	2	8	226029	226036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008818	CATG	2	8	229026	229033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008818	AGCT	2	8	229078	229085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008818	TACA	2	8	230971	230978	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008818	AGGA	2	8	231134	231141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008818	AGGC	2	8	231845	231852	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008818	AGCC	2	8	232359	232366	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008818	TTCC	2	8	246243	246250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008818	TTCA	2	8	251922	251929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008818	GAGG	2	8	252196	252203	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008818	GCAG	2	8	252568	252575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008818	CCGC	2	8	257704	257711	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_008818	AGCA	2	8	258195	258202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008818	AGGG	2	8	259077	259084	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008818	GCAG	2	8	260890	260897	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008818	TAGC	2	8	260902	260909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008818	CGCT	2	8	260950	260957	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008818	GCCA	2	8	262957	262964	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008818	GCTG	2	8	263732	263739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008818	TGAC	2	8	267215	267222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008818	CCCT	2	8	267238	267245	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_008818	AGCT	2	8	274172	274179	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008818	CTCA	2	8	277168	277175	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008818	ATGA	2	8	284177	284184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008818	CATT	2	8	294665	294672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008818	CTAT	2	8	303050	303057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008818	TGTA	2	8	307994	308001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008818	TACA	2	8	308352	308359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008818	ACCC	2	8	311617	311624	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_008818	TTCT	2	8	313694	313701	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008818	TTTC	2	8	313778	313785	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008818	TACA	2	8	317903	317910	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008818	AATG	2	8	318077	318084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008818	AGGG	2	8	318633	318640	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008818	TTGC	2	8	318756	318763	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008818	GAGG	2	8	318806	318813	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008818	AACC	2	8	320820	320827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008818	CCAA	2	8	320974	320981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008818	AGGC	2	8	321226	321233	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008818	TAGA	2	8	323928	323935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008818	GTAT	2	8	323980	323987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008818	GAGG	2	8	327938	327945	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008818	CTAT	2	8	327985	327992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008818	TCTT	2	8	331215	331222	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008818	GTAT	2	8	332210	332217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008818	GTCG	2	8	332271	332278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008818	GAAG	2	8	339303	339310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008818	TTGC	2	8	339497	339504	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008818	CGGG	3	12	339626	339637	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008818	CCCG	2	8	339645	339652	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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161	NC_008818	TAAT	2	8	366102	366109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_008818	TTAT	2	8	366632	366639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_008818	ATGG	2	8	447357	447364	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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190	NC_008818	AGCT	2	8	452745	452752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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482	NC_008818	GCAG	2	8	1119629	1119636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
483	NC_008818	TAGC	2	8	1124239	1124246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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486	NC_008818	GCCA	2	8	1129142	1129149	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
487	NC_008818	GTCT	2	8	1129582	1129589	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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