MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 26106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008818	CTG	2	6	1	6	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008818	GCC	2	6	33	38	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_008818	AGG	2	6	199	204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008818	GGC	2	6	230	235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008818	TAC	2	6	258	263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008818	CTT	2	6	337	342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008818	GCG	2	6	492	497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008818	AAT	2	6	517	522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008818	AGG	2	6	653	658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008818	AGG	2	6	669	674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008818	GCC	3	9	753	761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_008818	CTA	2	6	790	795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008818	TAT	2	6	862	867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008818	TTA	2	6	884	889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008818	GAC	2	6	910	915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026907
16	NC_008818	TAG	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026907
17	NC_008818	GCT	3	9	983	991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026907
18	NC_008818	TCC	2	6	1163	1168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026907
19	NC_008818	TAT	2	6	1189	1194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124026907
20	NC_008818	CAA	2	6	1218	1223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026907
21	NC_008818	ATT	2	6	1229	1234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124026907
22	NC_008818	TGC	2	6	1246	1251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026907
23	NC_008818	TGC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026907
24	NC_008818	TCC	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026907
25	NC_008818	GAG	2	6	1279	1284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026907
26	NC_008818	TGC	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026907
27	NC_008818	TCC	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026907
28	NC_008818	TGC	2	6	1549	1554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026907
29	NC_008818	TAT	2	6	1555	1560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124026907
30	NC_008818	CTG	2	6	1625	1630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026907
31	NC_008818	ACA	2	6	1757	1762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026907
32	NC_008818	CAG	2	6	1846	1851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026907
33	NC_008818	GAC	2	6	1898	1903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008818	ATA	2	6	1907	1912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008818	GCA	2	6	1934	1939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008818	GCC	2	6	2005	2010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_008818	TGC	2	6	2107	2112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008818	CCT	2	6	2134	2139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_008818	CAG	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008818	GAG	2	6	2173	2178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008818	AAC	2	6	2299	2304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008818	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008818	CAC	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008818	TGG	2	6	2377	2382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008818	CAT	2	6	2487	2492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008818	GCC	2	6	2541	2546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008818	GCC	2	6	2698	2703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_008818	GCC	2	6	2781	2786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_008818	CGG	3	9	2843	2851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008818	TCC	2	6	2922	2927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_008818	GAG	2	6	2938	2943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008818	GGA	2	6	3077	3082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008818	GGC	2	6	3089	3094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008818	GGC	2	6	3177	3182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008818	CGC	2	6	3271	3276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_008818	GTG	2	6	3335	3340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008818	GCG	2	6	3341	3346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008818	GCG	2	6	3434	3439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124026908
59	NC_008818	AAG	3	9	3463	3471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026908
60	NC_008818	GAG	2	6	3673	3678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026908
61	NC_008818	GTT	2	6	3685	3690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026908
62	NC_008818	GAG	2	6	3718	3723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026908
63	NC_008818	CTT	2	6	3748	3753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026909
64	NC_008818	ACT	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026909
65	NC_008818	TAC	2	6	3825	3830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026909
66	NC_008818	TGG	2	6	3835	3840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026909
67	NC_008818	CAA	2	6	3937	3942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124026909
68	NC_008818	TGA	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026909
69	NC_008818	TTG	2	6	4008	4013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026909
70	NC_008818	CAT	2	6	4078	4083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026909
71	NC_008818	GGT	2	6	4094	4099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026909
72	NC_008818	GCA	2	6	4154	4159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026909
73	NC_008818	GCT	2	6	4253	4258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026909
74	NC_008818	TAG	2	6	4287	4292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026909
75	NC_008818	TGG	3	9	4294	4302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026909
76	NC_008818	CGT	2	6	4354	4359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026909
77	NC_008818	AAG	2	6	4417	4422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124026910
78	NC_008818	CTC	2	6	4430	4435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026910
79	NC_008818	CTT	3	9	4481	4489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026910
80	NC_008818	CCT	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026910
81	NC_008818	TCA	2	6	4786	4791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008818	TCC	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026911
83	NC_008818	CAG	2	6	4926	4931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026911
84	NC_008818	TCT	2	6	4962	4967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026911
85	NC_008818	CCT	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026911
86	NC_008818	CCT	2	6	5046	5051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_008818	ACT	2	6	5067	5072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008818	AAT	2	6	5325	5330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008818	TGC	2	6	5465	5470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008818	TGG	2	6	5501	5506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008818	GTT	2	6	5527	5532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008818	TAT	2	6	5538	5543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124026912
93	NC_008818	GGC	2	6	5616	5621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124026912
94	NC_008818	GGT	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026912
95	NC_008818	TGC	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026912
96	NC_008818	GGA	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026912
97	NC_008818	TTG	2	6	5683	5688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026912
98	NC_008818	TGT	2	6	5872	5877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026912
99	NC_008818	TCC	3	9	6039	6047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026912
100	NC_008818	GAT	2	6	6053	6058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026912
101	NC_008818	CTC	2	6	6086	6091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026912
102	NC_008818	TTA	2	6	6286	6291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124026912
103	NC_008818	GGC	2	6	6305	6310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124026912
104	NC_008818	CTA	2	6	6319	6324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124026912
105	NC_008818	AGT	2	6	6504	6509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026912
106	NC_008818	CTT	2	6	6568	6573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026912
107	NC_008818	GAG	2	6	6791	6796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026912
108	NC_008818	TCC	2	6	6813	6818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026912
109	NC_008818	TGC	2	6	6886	6891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008818	TGA	2	6	6956	6961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026913
111	NC_008818	TCG	2	6	7098	7103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026913
112	NC_008818	AGT	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026913
113	NC_008818	GGT	2	6	7179	7184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008818	TCC	2	6	7224	7229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_008818	GCC	2	6	7389	7394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124026914
116	NC_008818	GTT	2	6	7402	7407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026914
117	NC_008818	CAG	2	6	7506	7511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026914
118	NC_008818	CGC	2	6	7528	7533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124026914
119	NC_008818	GTT	2	6	7534	7539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026914
120	NC_008818	AGC	2	6	7563	7568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026914
121	NC_008818	TCC	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124026914
122	NC_008818	AGT	2	6	7603	7608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026914
123	NC_008818	GCA	3	9	7621	7629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026914
124	NC_008818	AGC	2	6	7661	7666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124026914
125	NC_008818	TTC	2	6	7675	7680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124026914
126	NC_008818	GAG	2	6	7762	7767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124026914
127	NC_008818	GCC	2	6	7769	7774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124026914
128	NC_008818	TGC	2	6	7815	7820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026914
129	NC_008818	TTG	2	6	7826	7831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124026914
130	NC_008818	ATT	2	6	8014	8019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008818	TGG	2	6	8021	8026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008818	TGG	3	9	8066	8074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026915
133	NC_008818	AGT	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026915
134	NC_008818	GTG	2	6	8140	8145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124026915
135	NC_008818	AGT	2	6	8163	8168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124026915
136	NC_008818	CTG	2	6	8302	8307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124026915
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